More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE00970 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001303  ANIA_04597  nuclear condensin complex subunit Smc4, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02170)  42.83 
 
 
1476 aa  1112    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00970  conserved hypothetical protein  100 
 
 
1540 aa  3133    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.895196  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44165  predicted protein  37.42 
 
 
1356 aa  776    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_242  predicted protein  39.86 
 
 
1224 aa  815    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  24.6 
 
 
1187 aa  217  1.9999999999999998e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  24.93 
 
 
1217 aa  215  4.9999999999999996e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  23.04 
 
 
1185 aa  199  5.000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0425  chromosome segregation protein SMC  23.13 
 
 
1204 aa  179  3e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.501211  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2587  chromosome segregation protein SMC  26.96 
 
 
1189 aa  176  2.9999999999999996e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1831  chromosome segregation protein SMC  23.36 
 
 
1147 aa  173  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  23.31 
 
 
1204 aa  173  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  25.22 
 
 
1184 aa  169  5e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  23.9 
 
 
1189 aa  167  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3002  chromosome segregation protein SMC  27.25 
 
 
1192 aa  161  1e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  21.4 
 
 
1174 aa  160  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  24.27 
 
 
1190 aa  158  6e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  24.43 
 
 
1193 aa  151  8e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1341  chromosome segregation protein SMC  26.4 
 
 
1196 aa  151  8e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1012  condensin subunit Smc  26.19 
 
 
1149 aa  151  1.0000000000000001e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.750966 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  24.6 
 
 
1177 aa  149  4.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  23.72 
 
 
1184 aa  147  1e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  21.99 
 
 
1180 aa  147  2e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  22.21 
 
 
1148 aa  145  7e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02963  subunit of the multiprotein cohesin complex (Eurofung)  37.5 
 
 
1261 aa  143  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.869659  normal  0.319828 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  22.34 
 
 
1403 aa  143  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  22.77 
 
 
1185 aa  143  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  24.67 
 
 
1146 aa  142  3.9999999999999997e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  24.74 
 
 
1146 aa  142  4.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64147  Structural maintenance of chromosome protein 1 (sister chromatid cohesion complex Cohesin, subunit SMC1)  39.65 
 
 
1240 aa  142  4.999999999999999e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.471232 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  24.14 
 
 
1187 aa  141  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25506  predicted protein  23.57 
 
 
1237 aa  141  1e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  24.88 
 
 
1171 aa  139  4e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02640  cohesin complex subunit psm1, putative  33.95 
 
 
1202 aa  135  3.9999999999999996e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.176363  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  23.21 
 
 
1172 aa  135  6e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  24.39 
 
 
1188 aa  133  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  25.59 
 
 
1189 aa  133  3e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  24.39 
 
 
1188 aa  133  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  21.16 
 
 
1178 aa  132  5.0000000000000004e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  23.35 
 
 
1174 aa  129  5e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4429  chromosome segregation protein SMC  23.96 
 
 
1190 aa  129  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05899  Condensin subunit [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J150]  25.3 
 
 
1179 aa  128  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.566819 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0484  chromosome segregation protein SMC  33.16 
 
 
1148 aa  126  3e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  25.11 
 
 
1189 aa  126  3e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  23.58 
 
 
1174 aa  125  8e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  23.57 
 
 
1196 aa  124  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30352  predicted protein  25.1 
 
 
1213 aa  122  4.9999999999999996e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  26.02 
 
 
1189 aa  122  6e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  23.31 
 
 
1190 aa  121  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2185  chromosome segregation protein SMC  32.61 
 
 
1146 aa  120  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  22.33 
 
 
1189 aa  120  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  24.82 
 
 
1187 aa  120  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30705  predicted protein  31.82 
 
 
1225 aa  120  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.830885  normal  0.342415 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  34.22 
 
 
1175 aa  119  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  24.46 
 
 
1189 aa  119  5e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  32.34 
 
 
1219 aa  118  8.999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  21.57 
 
 
1186 aa  117  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  21.82 
 
 
1189 aa  117  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  24.79 
 
 
1189 aa  117  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2255  condensin subunit Smc  31.02 
 
 
1202 aa  116  3e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.204212 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  22.71 
 
 
1175 aa  116  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0947  SMC domain protein  25 
 
 
1082 aa  115  5e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.823623  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00651  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  23.87 
 
 
1207 aa  115  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.929261  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03271  hypothetical protein  29.91 
 
 
1184 aa  115  9e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_52607  predicted protein  23.46 
 
 
1232 aa  114  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  24.42 
 
 
1189 aa  113  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02930  chromosome associated protein, putative  22.3 
 
 
1208 aa  112  6e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.828344  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  23.11 
 
 
1185 aa  112  6e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4689  condensin subunit Smc  32.77 
 
 
1208 aa  112  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1491  chromosome segregation protein SMC  29.9 
 
 
1226 aa  112  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  24.81 
 
 
1177 aa  111  9.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1464  chromosome segregation protein SMC  29.9 
 
 
1226 aa  111  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  22.89 
 
 
1185 aa  110  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  29.96 
 
 
1191 aa  110  3e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  34.44 
 
 
1191 aa  110  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  23.49 
 
 
1172 aa  109  4e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  23.47 
 
 
1301 aa  109  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  28.57 
 
 
1188 aa  108  6e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59451  Chromosome segregation and condensation  23.8 
 
 
1171 aa  108  6e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.819288  decreased coverage  0.00000261165 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06364  Chromosome segregation protein sudA (DA-box protein sudA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00737]  22.05 
 
 
1215 aa  108  8e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00691  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  24.02 
 
 
1196 aa  107  2e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  32.54 
 
 
1173 aa  107  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  23.36 
 
 
1189 aa  107  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  22.34 
 
 
1185 aa  107  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  23.99 
 
 
1179 aa  107  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  23.85 
 
 
1179 aa  106  3e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0334  chromosome segregation protein SMC  33.15 
 
 
1198 aa  106  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.452064  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  22.34 
 
 
1176 aa  106  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01211  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  23.54 
 
 
1201 aa  106  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  22.38 
 
 
1134 aa  105  7e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1420  condensin subunit Smc  29.36 
 
 
1183 aa  104  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00681  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  23.95 
 
 
1196 aa  104  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00661  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  30.4 
 
 
1194 aa  102  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  30.05 
 
 
1175 aa  102  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0753  chromosome segregation protein SMC  31 
 
 
1150 aa  101  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0900  chromosome segregation protein SMC  31 
 
 
1150 aa  101  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.188992  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1496  chromosome partition protein SmC, putative  31.88 
 
 
980 aa  100  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46490  predicted protein  21.91 
 
 
1209 aa  100  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0173437 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  31.84 
 
 
1185 aa  100  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0059  condensin subunit Smc  23.8 
 
 
1196 aa  100  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0651  SMC domain-containing protein  32.88 
 
 
1174 aa  99.8  3e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.721251 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>