More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_25506 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_25506  predicted protein  100 
 
 		 1237 aa  2527    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30705  predicted protein  32.34 
 
 		 1225 aa  582  1e-164  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.830885  normal  0.342415 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02963  subunit of the multiprotein cohesin complex (Eurofung)  31.9 
 
 		 1261 aa  565  1.0000000000000001e-159  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.869659  normal  0.319828 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02640  cohesin complex subunit psm1, putative  32.2 
 
 		 1202 aa  545  1e-153  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.176363  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64147  Structural maintenance of chromosome protein 1 (sister chromatid cohesion complex Cohesin, subunit SMC1)  31.27 
 
 		 1240 aa  517  1.0000000000000001e-145  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.471232 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04597  nuclear condensin complex subunit Smc4, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02170)  25.56 
 
 		 1476 aa  264  1e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_242  predicted protein  23.94 
 
 		 1224 aa  248  8e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  24.86 
 
 		 1185 aa  244  5e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  25.06 
 
 		 1174 aa  240  2e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0334  chromosome segregation protein SMC  23.86 
 
 		 1198 aa  215  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.452064  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  25.08 
 
 		 1187 aa  204  8e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  23.89 
 
 		 1146 aa  204  8e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  23.45 
 
 		 1219 aa  203  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  21.43 
 
 		 1191 aa  203  1.9999999999999998e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01211  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  23.23 
 
 		 1201 aa  197  7e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  23 
 
 		 1186 aa  196  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1420  condensin subunit Smc  22.98 
 
 		 1183 aa  183  2e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  22.98 
 
 		 1189 aa  175  5e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  24.05 
 
 		 1171 aa  175  5.999999999999999e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  24.18 
 
 		 1198 aa  174  6.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  22.72 
 
 		 1191 aa  171  6e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  22.91 
 
 		 1170 aa  171  9e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  24.49 
 
 		 1217 aa  171  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  23.46 
 
 		 1186 aa  169  2.9999999999999998e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59451  Chromosome segregation and condensation  22 
 
 		 1171 aa  169  4e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.819288  decreased coverage  0.00000261165 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  22.54 
 
 		 1170 aa  167  9e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00651  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  25.95 
 
 		 1207 aa  160  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.929261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  25.1 
 
 		 1175 aa  158  6e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  24.58 
 
 		 1177 aa  157  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1012  condensin subunit Smc  25.11 
 
 		 1149 aa  157  2e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.750966 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00970  conserved hypothetical protein  23.57 
 
 		 1540 aa  155  4e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.895196  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  21.92 
 
 		 1164 aa  155  4e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  22.48 
 
 		 1177 aa  155  5e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  22.27 
 
 		 1172 aa  152  4e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1831  chromosome segregation protein SMC  24.25 
 
 		 1147 aa  151  9e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  23.07 
 
 		 1181 aa  150  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0425  chromosome segregation protein SMC  25.67 
 
 		 1204 aa  150  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.501211  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  22.03 
 
 		 1178 aa  150  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03271  hypothetical protein  25.37 
 
 		 1184 aa  145  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  22.14 
 
 		 1185 aa  141  7e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  23.86 
 
 		 1146 aa  141  7.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  23.87 
 
 		 1185 aa  140  1e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2587  chromosome segregation protein SMC  24.61 
 
 		 1189 aa  140  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44165  predicted protein  40.99 
 
 		 1356 aa  138  7.000000000000001e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  21.61 
 
 		 1193 aa  134  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  26.03 
 
 		 1188 aa  130  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  23.4 
 
 		 1184 aa  128  7e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  24.53 
 
 		 1189 aa  128  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  24.53 
 
 		 1189 aa  128  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  24.4 
 
 		 1189 aa  128  9e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  24.52 
 
 		 1189 aa  127  9e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  22.51 
 
 		 1185 aa  127  9e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  24.4 
 
 		 1189 aa  128  9e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  24.4 
 
 		 1189 aa  127  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  26.1 
 
 		 1187 aa  127  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1341  chromosome segregation protein SMC  24.46 
 
 		 1196 aa  126  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  21.81 
 
 		 1185 aa  121  6e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  24.87 
 
 		 1162 aa  121  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  33.99 
 
 		 1189 aa  117  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  21.98 
 
 		 1190 aa  116  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  24.24 
 
 		 1162 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00681  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  21.97 
 
 		 1196 aa  115  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  22.06 
 
 		 1176 aa  115  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  20.96 
 
 		 1180 aa  115  6e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  33.5 
 
 		 1189 aa  115  7.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2255  condensin subunit Smc  24.76 
 
 		 1202 aa  114  9e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.204212 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  21.84 
 
 		 1190 aa  114  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  23.15 
 
 		 1174 aa  114  1.0000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  33 
 
 		 1189 aa  114  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1491  chromosome segregation protein SMC  24.25 
 
 		 1226 aa  112  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  35.71 
 
 		 1148 aa  112  6e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06364  Chromosome segregation protein sudA (DA-box protein sudA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00737]  24.51 
 
 		 1215 aa  111  8.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  35.42 
 
 		 1189 aa  110  1e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  23.53 
 
 		 1204 aa  110  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  23.6 
 
 		 1177 aa  110  2e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05899  Condensin subunit [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J150]  22.78 
 
 		 1179 aa  108  5e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.566819 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  21.24 
 
 		 1188 aa  108  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0059  condensin subunit Smc  22.42 
 
 		 1196 aa  108  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  21.24 
 
 		 1188 aa  108  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  25.21 
 
 		 1191 aa  108  5e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  22.94 
 
 		 1189 aa  107  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00691  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  28.1 
 
 		 1196 aa  107  1e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1464  chromosome segregation protein SMC  29.08 
 
 		 1226 aa  107  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  30.69 
 
 		 1195 aa  105  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  22.94 
 
 		 1189 aa  105  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0753  chromosome segregation protein SMC  26.46 
 
 		 1150 aa  105  7e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0900  chromosome segregation protein SMC  26.18 
 
 		 1150 aa  105  8e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.188992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00661  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  28.64 
 
 		 1194 aa  104  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  24.13 
 
 		 1169 aa  103  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  24.34 
 
 		 1134 aa  103  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0651  SMC domain-containing protein  28.21 
 
 		 1174 aa  103  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.721251 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0679  chromosome segregation protein SMC  28.57 
 
 		 1168 aa  102  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2379  chromosome segregation protein SMC  32.34 
 
 		 1141 aa  102  6e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.882333  unclonable  0.00000367062 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12936  chromosome partitioning protein smc  29.41 
 
 		 1205 aa  102  6e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0598484  normal  0.252083 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  23.53 
 
 		 1169 aa  101  7e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0699  chromosome segregation protein SMC  27.36 
 
 		 1153 aa  101  8e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  29.55 
 
 		 1194 aa  101  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0399  chromosome segregation protein SMC  30.6 
 
 		 1165 aa  100  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.489923  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  25.79 
 
 		 1162 aa  100  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  30.37 
 
 		 1164 aa  100  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>