More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_242 on replicon NC_009360
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001303  ANIA_04597  nuclear condensin complex subunit Smc4, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02170)  41.3 
 
 		 1476 aa  836    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00970  conserved hypothetical protein  39.78 
 
 		 1540 aa  813    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.895196  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_242  predicted protein  100 
 
 		 1224 aa  2468    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44165  predicted protein  42.34 
 
 		 1356 aa  878    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25506  predicted protein  24.24 
 
 		 1237 aa  244  7.999999999999999e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4429  chromosome segregation protein SMC  23.5 
 
 		 1190 aa  243  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  25.27 
 
 		 1174 aa  243  2e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  24.28 
 
 		 1171 aa  239  3e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  25.49 
 
 		 1191 aa  229  3e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  24.53 
 
 		 1189 aa  221  5e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  24.88 
 
 		 1193 aa  221  6e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  24.47 
 
 		 1146 aa  218  7e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  24.17 
 
 		 1189 aa  214  7.999999999999999e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  24.62 
 
 		 1219 aa  211  6e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  24.75 
 
 		 1187 aa  209  2e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  25.9 
 
 		 1184 aa  208  6e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02640  cohesin complex subunit psm1, putative  23.48 
 
 		 1202 aa  206  2e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.176363  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  22.53 
 
 		 1196 aa  206  3e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  24.74 
 
 		 1177 aa  203  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  23.73 
 
 		 1187 aa  200  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  22.58 
 
 		 1189 aa  194  1e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  22.86 
 
 		 1188 aa  189  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  22.86 
 
 		 1188 aa  189  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  23.54 
 
 		 1204 aa  183  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  23.5 
 
 		 1174 aa  182  4e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1012  condensin subunit Smc  26.36 
 
 		 1149 aa  172  5e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.750966 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  23.47 
 
 		 1176 aa  169  4e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59451  Chromosome segregation and condensation  22.08 
 
 		 1171 aa  161  7e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.819288  decreased coverage  0.00000261165 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1831  chromosome segregation protein SMC  27.84 
 
 		 1147 aa  160  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  23.08 
 
 		 1179 aa  157  8e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3002  chromosome segregation protein SMC  26.62 
 
 		 1192 aa  155  4e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  23.3 
 
 		 1177 aa  155  4e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  25.07 
 
 		 1185 aa  154  8.999999999999999e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  21.53 
 
 		 1181 aa  154  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64147  Structural maintenance of chromosome protein 1 (sister chromatid cohesion complex Cohesin, subunit SMC1)  43.68 
 
 		 1240 aa  153  2e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.471232 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  24.17 
 
 		 1172 aa  150  1.0000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  25.46 
 
 		 1217 aa  149  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00651  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  25.79 
 
 		 1207 aa  146  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.929261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  22.02 
 
 		 1174 aa  145  4e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0484  chromosome segregation protein SMC  30.31 
 
 		 1148 aa  144  8e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30705  predicted protein  34.85 
 
 		 1225 aa  134  1.0000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.830885  normal  0.342415 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0947  SMC domain protein  26.92 
 
 		 1082 aa  133  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.823623  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0425  chromosome segregation protein SMC  25.17 
 
 		 1204 aa  132  4.0000000000000003e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.501211  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  28.62 
 
 		 1188 aa  132  6e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2185  chromosome segregation protein SMC  27.83 
 
 		 1146 aa  130  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  22.98 
 
 		 1191 aa  130  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  24.22 
 
 		 1177 aa  130  1.0000000000000001e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2045  condensin subunit Smc  30.57 
 
 		 1195 aa  128  8.000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  24.36 
 
 		 1185 aa  127  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  28.44 
 
 		 1189 aa  126  3e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  30.24 
 
 		 1146 aa  122  6e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  31.51 
 
 		 1189 aa  122  6e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  24.07 
 
 		 1185 aa  121  7e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  35.59 
 
 		 1172 aa  120  9.999999999999999e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  22.9 
 
 		 1186 aa  120  9.999999999999999e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  23.25 
 
 		 1199 aa  120  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0334  chromosome segregation protein SMC  30.49 
 
 		 1198 aa  119  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.452064  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  23.28 
 
 		 1199 aa  119  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  33.5 
 
 		 1175 aa  117  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  31.5 
 
 		 1175 aa  116  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  29.5 
 
 		 1168 aa  116  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  23.58 
 
 		 1403 aa  115  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  31 
 
 		 1176 aa  115  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2587  chromosome segregation protein SMC  29.06 
 
 		 1189 aa  115  7.000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  31.94 
 
 		 1176 aa  114  8.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  24.13 
 
 		 1189 aa  114  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  24.44 
 
 		 1173 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  31.31 
 
 		 1190 aa  113  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  33.5 
 
 		 1176 aa  114  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00661  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  29.55 
 
 		 1194 aa  112  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  23.99 
 
 		 1189 aa  112  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1341  chromosome segregation protein SMC  28.57 
 
 		 1196 aa  111  8.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  33.72 
 
 		 1190 aa  110  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  23.52 
 
 		 1177 aa  110  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  32.12 
 
 		 1190 aa  110  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0651  SMC domain-containing protein  30.05 
 
 		 1174 aa  110  1e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.721251 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0900  chromosome segregation protein SMC  35.33 
 
 		 1150 aa  109  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.188992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  38.35 
 
 		 1191 aa  110  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0753  chromosome segregation protein SMC  35.33 
 
 		 1150 aa  109  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  26.34 
 
 		 1162 aa  109  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1420  condensin subunit Smc  27.82 
 
 		 1183 aa  108  7e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01211  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  27.47 
 
 		 1201 aa  108  7e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4276  chromosome segregation protein SMC  33.51 
 
 		 1162 aa  107  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1592  chromosome segregation protein SMC  33.51 
 
 		 1162 aa  107  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.843365  normal  0.195769 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3840  chromosome segregation protein SMC  33.51 
 
 		 1162 aa  107  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509302 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  23.8 
 
 		 1134 aa  106  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0613  chromosome segregation protein SMC  32.49 
 
 		 1152 aa  105  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0059  condensin subunit Smc  27.6 
 
 		 1196 aa  105  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  31.41 
 
 		 1162 aa  105  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1736  chromosome segregation protein SMC  25.05 
 
 		 814 aa  105  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00195971  unclonable  0.00000000014199 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  34.78 
 
 		 1186 aa  104  8e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0547  chromosome segregation protein SMC  31.37 
 
 		 1153 aa  104  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.725203 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  32.47 
 
 		 1162 aa  104  9e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1514  SMC family protein  27.61 
 
 		 1139 aa  104  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  33.33 
 
 		 1198 aa  104  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03271  hypothetical protein  30.61 
 
 		 1184 aa  103  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0765  chromosome segregation protein SMC  35.71 
 
 		 1189 aa  103  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.430738 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  33.33 
 
 		 1163 aa  103  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  28.27 
 
 		 1187 aa  103  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2199  condensin subunit Smc  31.86 
 
 		 1148 aa  103  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.53129 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>