More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_30705 on replicon NC_009357
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001306  ANIA_02963  subunit of the multiprotein cohesin complex (Eurofung)  34.47 
 
 
1261 aa  638    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.869659  normal  0.319828 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30705  predicted protein  100 
 
 
1225 aa  2492    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.830885  normal  0.342415 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02640  cohesin complex subunit psm1, putative  33.15 
 
 
1202 aa  570  1e-161  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.176363  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25506  predicted protein  32.21 
 
 
1237 aa  568  1e-160  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64147  Structural maintenance of chromosome protein 1 (sister chromatid cohesion complex Cohesin, subunit SMC1)  31.82 
 
 
1240 aa  529  1e-148  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.471232 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  25.84 
 
 
1146 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  24.55 
 
 
1185 aa  211  8e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  23 
 
 
1190 aa  203  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  24.02 
 
 
1171 aa  199  3e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0484  chromosome segregation protein SMC  26.94 
 
 
1148 aa  169  2.9999999999999998e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4429  chromosome segregation protein SMC  26.54 
 
 
1190 aa  166  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  26.27 
 
 
1174 aa  151  9e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  22.7 
 
 
1181 aa  146  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  23.69 
 
 
1185 aa  144  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  22.85 
 
 
1164 aa  142  3e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04597  nuclear condensin complex subunit Smc4, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02170)  24.81 
 
 
1476 aa  140  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1464  chromosome segregation protein SMC  24.93 
 
 
1226 aa  139  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_242  predicted protein  34.85 
 
 
1224 aa  131  9.000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05899  Condensin subunit [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J150]  24.86 
 
 
1179 aa  129  3e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.566819 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  25.23 
 
 
1146 aa  126  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44165  predicted protein  35.79 
 
 
1356 aa  126  3e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2587  chromosome segregation protein SMC  24.69 
 
 
1189 aa  124  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00970  conserved hypothetical protein  30.4 
 
 
1540 aa  120  9.999999999999999e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.895196  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  33.03 
 
 
1219 aa  121  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0331  chromosome segregation protein SMC  22.9 
 
 
1201 aa  120  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.535871  normal  0.0329796 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  25.04 
 
 
1186 aa  120  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  24.13 
 
 
1199 aa  119  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  24.13 
 
 
1199 aa  117  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  33.04 
 
 
1191 aa  117  2.0000000000000002e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00681  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  22.91 
 
 
1196 aa  116  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  35.1 
 
 
1187 aa  116  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  34.62 
 
 
1185 aa  115  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  34.62 
 
 
1185 aa  115  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  23.86 
 
 
1189 aa  115  8.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  23.51 
 
 
1189 aa  114  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4689  condensin subunit Smc  31.74 
 
 
1208 aa  113  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  32.74 
 
 
1184 aa  113  2.0000000000000002e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  23.73 
 
 
1188 aa  112  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  24.65 
 
 
1196 aa  112  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  23.73 
 
 
1188 aa  112  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  23.64 
 
 
1199 aa  112  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0947  SMC domain protein  23.85 
 
 
1082 aa  112  5e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.823623  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  35.1 
 
 
1187 aa  112  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0334  chromosome segregation protein SMC  33.5 
 
 
1198 aa  111  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.452064  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  23.16 
 
 
1189 aa  111  9.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  36.02 
 
 
1190 aa  111  9.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1491  chromosome segregation protein SMC  30.27 
 
 
1226 aa  110  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  23.59 
 
 
1189 aa  109  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  24.34 
 
 
1185 aa  109  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  24.13 
 
 
1189 aa  108  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  23.59 
 
 
1189 aa  108  5e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1420  condensin subunit Smc  33.94 
 
 
1183 aa  108  6e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01211  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  33.49 
 
 
1201 aa  107  9e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  34.45 
 
 
1189 aa  107  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  23.21 
 
 
1189 aa  106  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3002  chromosome segregation protein SMC  32.24 
 
 
1192 aa  107  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  35.68 
 
 
1194 aa  107  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1889  chromosome segregation protein SMC  32.63 
 
 
1214 aa  106  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274558  normal  0.174948 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  32.55 
 
 
1172 aa  106  3e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  33.64 
 
 
1175 aa  105  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3429  chromosome segregation protein SMC  32.67 
 
 
1218 aa  105  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10940  condensin subunit Smc  34.78 
 
 
1217 aa  105  4e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.638543  normal  0.192819 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8008  chromosome segregation protein SMC  34.21 
 
 
1224 aa  105  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  34.45 
 
 
1185 aa  105  4e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  32.06 
 
 
1187 aa  105  4e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0425  chromosome segregation protein SMC  34.17 
 
 
1204 aa  105  7e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.501211  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf735  chromosome segregation ATPase Smc  23.74 
 
 
978 aa  104  1e-20  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  31.38 
 
 
1162 aa  104  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1341  chromosome segregation protein SMC  30.43 
 
 
1196 aa  103  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1012  condensin subunit Smc  30 
 
 
1149 aa  104  1e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.750966 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1181  chromosome segregation protein SMC  33.99 
 
 
1198 aa  103  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733756  hitchhiker  0.000532551 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  36.15 
 
 
1167 aa  103  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00661  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  33 
 
 
1194 aa  103  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  33.65 
 
 
1162 aa  102  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  30.43 
 
 
1188 aa  102  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  33.97 
 
 
1189 aa  102  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  33.97 
 
 
1189 aa  102  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  33.97 
 
 
1189 aa  102  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  33.97 
 
 
1189 aa  102  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00691  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  33.33 
 
 
1196 aa  102  5e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0216  chromosome segregation protein SMC  32.84 
 
 
1181 aa  102  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  33.97 
 
 
1189 aa  102  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12936  chromosome partitioning protein smc  33.5 
 
 
1205 aa  102  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0598484  normal  0.252083 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1291  chromosome segregation protein SMC  33.5 
 
 
1198 aa  102  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.898682 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4276  chromosome segregation protein SMC  33.49 
 
 
1162 aa  102  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  33.97 
 
 
1189 aa  102  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  33.97 
 
 
1189 aa  102  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  33.97 
 
 
1189 aa  102  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3840  chromosome segregation protein SMC  33.49 
 
 
1162 aa  102  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.509302 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  31.3 
 
 
1162 aa  102  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_52607  predicted protein  22.62 
 
 
1232 aa  102  6e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1592  chromosome segregation protein SMC  33.49 
 
 
1162 aa  102  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.843365  normal  0.195769 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3273  condensin subunit Smc  32.63 
 
 
1188 aa  102  6e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739482  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  31.73 
 
 
1148 aa  102  7e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  24.53 
 
 
1177 aa  101  8e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  31.3 
 
 
1162 aa  101  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  30.9 
 
 
1162 aa  100  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  33.18 
 
 
1162 aa  100  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  34.07 
 
 
1167 aa  100  1e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3602  chromosome segregation protein SMC  33.49 
 
 
1162 aa  101  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111779  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>