More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0331 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0331  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1201 aa  2347    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.535871  normal  0.0329796 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0855  chromosome segregation protein SMC  77.11 
 
 		 1200 aa  1608    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00379552  normal  0.0307887 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0765  chromosome segregation protein SMC  49.22 
 
 		 1189 aa  895    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.430738 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  32.27 
 
 		 1187 aa  558  1e-157  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  30.76 
 
 		 1190 aa  550  1e-155  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  33.2 
 
 		 1181 aa  543  1e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  29.21 
 
 		 1196 aa  543  9.999999999999999e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  31.52 
 
 		 1186 aa  529  1e-148  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  30.6 
 
 		 1189 aa  522  1e-146  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  30.71 
 
 		 1189 aa  522  1e-146  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  31.41 
 
 		 1189 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  30.24 
 
 		 1190 aa  518  1.0000000000000001e-145  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  30.06 
 
 		 1189 aa  513  1e-144  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  33.97 
 
 		 1187 aa  514  1e-144  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  34.04 
 
 		 1198 aa  511  1e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  29.39 
 
 		 1188 aa  510  1e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  29.39 
 
 		 1188 aa  510  1e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  29.15 
 
 		 1185 aa  502  1e-140  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  35.17 
 
 		 1199 aa  491  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  31.54 
 
 		 1187 aa  491  1e-137  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2640  chromosome segregation protein SMC  45.1 
 
 		 1192 aa  488  1e-136  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  29.94 
 
 		 1186 aa  487  1e-136  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  34.71 
 
 		 1199 aa  484  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  34.63 
 
 		 1199 aa  482  1e-134  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  28.57 
 
 		 1177 aa  478  1e-133  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  29.27 
 
 		 1184 aa  460  9.999999999999999e-129  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  33.47 
 
 		 1198 aa  460  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  32.27 
 
 		 1176 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  32.39 
 
 		 1187 aa  451  1e-125  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  30.2 
 
 		 1174 aa  448  1.0000000000000001e-124  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  28.82 
 
 		 1177 aa  444  1e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  30.35 
 
 		 1176 aa  439  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  32.54 
 
 		 1175 aa  428  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  28.92 
 
 		 1179 aa  428  1e-118  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  31.34 
 
 		 1176 aa  427  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  31.88 
 
 		 1176 aa  426  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  32.32 
 
 		 1177 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  26.92 
 
 		 1172 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  27.56 
 
 		 1185 aa  409  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  27.5 
 
 		 1186 aa  399  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  27.72 
 
 		 1204 aa  392  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  27.68 
 
 		 1169 aa  386  1e-105  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  27.6 
 
 		 1169 aa  386  1e-105  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  29.57 
 
 		 1167 aa  380  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  26.25 
 
 		 1176 aa  380  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  27.5 
 
 		 1170 aa  382  1e-104  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  25.79 
 
 		 1178 aa  377  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  27.97 
 
 		 1170 aa  378  1e-103  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  30.52 
 
 		 1167 aa  374  1e-102  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  30.22 
 
 		 1167 aa  375  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  26.4 
 
 		 1148 aa  372  1e-101  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  30.44 
 
 		 1167 aa  373  1e-101  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  30.25 
 
 		 1162 aa  373  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10080  chromosome segregation protein SMC  29.72 
 
 		 1174 aa  371  1e-101  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.503151  hitchhiker  0.00000182837 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  30.17 
 
 		 1162 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  27.54 
 
 		 1168 aa  367  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  27.29 
 
 		 1179 aa  365  4e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  29.69 
 
 		 1162 aa  364  6e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  30.19 
 
 		 1179 aa  364  7.0000000000000005e-99  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  29.93 
 
 		 1168 aa  362  3e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  25.71 
 
 		 1164 aa  362  3e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  27.91 
 
 		 1178 aa  362  3e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  30.3 
 
 		 1175 aa  360  8e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  32.5 
 
 		 1175 aa  359  9.999999999999999e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  31.55 
 
 		 1164 aa  355  2.9999999999999997e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  24.45 
 
 		 1180 aa  355  4e-96  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4276  chromosome segregation protein SMC  28.65 
 
 		 1162 aa  353  8e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  28 
 
 		 1162 aa  353  8.999999999999999e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  29.82 
 
 		 1171 aa  353  1e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1457  chromosome segregation protein SMC  28.8 
 
 		 1173 aa  352  2e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  28.37 
 
 		 1162 aa  352  3e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  31.02 
 
 		 1175 aa  352  3e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  31.68 
 
 		 1403 aa  348  5e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  29.76 
 
 		 1171 aa  345  2.9999999999999997e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2514  chromosome segregation protein SMC  30.14 
 
 		 1170 aa  344  5e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0530303 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  22.33 
 
 		 1174 aa  344  5.999999999999999e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1799  condensin subunit Smc  28.34 
 
 		 1162 aa  343  1e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0884011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  31.42 
 
 		 1189 aa  340  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  25.93 
 
 		 1164 aa  339  1.9999999999999998e-91  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  31.98 
 
 		 1189 aa  339  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  29.82 
 
 		 1182 aa  339  1.9999999999999998e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  31.55 
 
 		 1189 aa  338  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  31.42 
 
 		 1189 aa  338  2.9999999999999997e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  31.55 
 
 		 1189 aa  338  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  31.55 
 
 		 1189 aa  338  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  31.37 
 
 		 1189 aa  338  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  31.55 
 
 		 1189 aa  338  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  26.27 
 
 		 1164 aa  337  1e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  25.39 
 
 		 1184 aa  330  9e-89  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  28.25 
 
 		 1190 aa  328  4.0000000000000003e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  29.16 
 
 		 1198 aa  325  3e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  29.01 
 
 		 1198 aa  320  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  23.82 
 
 		 1153 aa  317  7e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0501  chromosome segregation protein SMC  27.51 
 
 		 1152 aa  316  1.9999999999999998e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  31.24 
 
 		 1185 aa  311  4e-83  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  30.76 
 
 		 1191 aa  309  2.0000000000000002e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  30.82 
 
 		 1191 aa  306  2.0000000000000002e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  28.38 
 
 		 1185 aa  300  9e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  24.15 
 
 		 1172 aa  298  3e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  27.97 
 
 		 1185 aa  294  7e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>