More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2640 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2640  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 
1192 aa  2338    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0765  chromosome segregation protein SMC  43.6 
 
 
1189 aa  765    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.430738 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0855  chromosome segregation protein SMC  42.79 
 
 
1200 aa  711    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00379552  normal  0.0307887 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0331  chromosome segregation protein SMC  43.19 
 
 
1201 aa  728    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.535871  normal  0.0329796 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  34.16 
 
 
1181 aa  553  1e-156  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  32.87 
 
 
1187 aa  549  1e-155  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  31.6 
 
 
1196 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  32.04 
 
 
1189 aa  520  1e-146  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  31.36 
 
 
1188 aa  519  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  31.36 
 
 
1188 aa  519  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  31.9 
 
 
1189 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  31.31 
 
 
1189 aa  513  1e-144  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  31.41 
 
 
1189 aa  513  1e-144  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  31.31 
 
 
1189 aa  513  1e-144  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  31.24 
 
 
1189 aa  515  1e-144  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  31.31 
 
 
1189 aa  511  1e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  31.22 
 
 
1189 aa  510  1e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  31.31 
 
 
1189 aa  511  1e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  31.49 
 
 
1189 aa  510  1e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  31.07 
 
 
1189 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  33.07 
 
 
1198 aa  491  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  29.76 
 
 
1185 aa  477  1e-133  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  29.37 
 
 
1185 aa  477  1e-133  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  31.08 
 
 
1184 aa  462  9.999999999999999e-129  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  32.5 
 
 
1199 aa  459  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  32.34 
 
 
1199 aa  456  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  28.69 
 
 
1191 aa  456  1.0000000000000001e-126  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  32.34 
 
 
1199 aa  455  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  29.4 
 
 
1174 aa  451  1e-125  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  34.72 
 
 
1185 aa  449  1.0000000000000001e-124  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  31.08 
 
 
1187 aa  444  1e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  30.28 
 
 
1177 aa  443  1e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  31.65 
 
 
1176 aa  434  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  32.43 
 
 
1173 aa  426  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  27.8 
 
 
1204 aa  413  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  31.84 
 
 
1175 aa  405  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  31.51 
 
 
1177 aa  406  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  28.39 
 
 
1148 aa  397  1e-109  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  30.6 
 
 
1186 aa  395  1e-108  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  25.71 
 
 
1172 aa  392  1e-107  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  28.41 
 
 
1185 aa  392  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  28.34 
 
 
1179 aa  385  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  29.56 
 
 
1179 aa  382  1e-104  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  27.75 
 
 
1170 aa  370  1e-101  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  27.27 
 
 
1169 aa  363  1e-98  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  29.49 
 
 
1167 aa  357  5e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  29.1 
 
 
1177 aa  357  1e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  27.18 
 
 
1169 aa  357  1e-96  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  27.42 
 
 
1170 aa  352  2e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  28.2 
 
 
1168 aa  347  6e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  30.15 
 
 
1167 aa  347  8.999999999999999e-94  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  30.2 
 
 
1167 aa  346  1e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  30.85 
 
 
1403 aa  337  5.999999999999999e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  30.27 
 
 
1164 aa  331  5.0000000000000004e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  35.92 
 
 
1187 aa  308  4.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2638  chromosome segregation protein SMC  29.68 
 
 
1308 aa  305  2.0000000000000002e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  28.55 
 
 
1171 aa  301  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  32.05 
 
 
1191 aa  291  4e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  24.5 
 
 
1189 aa  284  9e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  28.61 
 
 
1177 aa  273  2e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  26.91 
 
 
1180 aa  268  5e-70  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  25.26 
 
 
1174 aa  268  5e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  27.25 
 
 
1185 aa  261  4e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2440  chromosome segregation SMC protein  28.34 
 
 
1109 aa  259  2e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129774  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  22.45 
 
 
1189 aa  254  1e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  28.59 
 
 
1176 aa  249  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  30.62 
 
 
1191 aa  248  4e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0419  chromosome segregation protein SMC  31.13 
 
 
1190 aa  240  1e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327904  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  31.81 
 
 
1176 aa  237  1.0000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  53.11 
 
 
1190 aa  232  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  45.16 
 
 
1190 aa  231  5e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  49.35 
 
 
1190 aa  226  2e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  28.25 
 
 
1178 aa  226  2e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  27.99 
 
 
1164 aa  223  9.999999999999999e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  26.77 
 
 
1178 aa  223  1.9999999999999999e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  45.85 
 
 
1189 aa  219  2e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0425  chromosome segregation protein SMC  26.5 
 
 
1204 aa  216  1.9999999999999998e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.501211  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  31.39 
 
 
1301 aa  216  1.9999999999999998e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8008  chromosome segregation protein SMC  30.72 
 
 
1224 aa  214  9e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  36.87 
 
 
1186 aa  214  9e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  50.99 
 
 
1187 aa  213  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  28.27 
 
 
1193 aa  212  3e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  42.39 
 
 
1198 aa  211  5e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  26.32 
 
 
1153 aa  210  1e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1496  chromosome partition protein SmC, putative  44.91 
 
 
980 aa  209  3e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4025  chromosome segregation protein SMC  46.7 
 
 
1188 aa  207  9e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115508  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1291  chromosome segregation protein SMC  45.81 
 
 
1198 aa  205  5e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.898682 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  44.66 
 
 
1176 aa  204  6e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  45.32 
 
 
1186 aa  204  7e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3688  SMC domain protein  40.34 
 
 
1081 aa  204  7e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.860198 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  44.66 
 
 
1176 aa  204  9e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0655  condensin subunit Smc  46.26 
 
 
1183 aa  203  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  46.23 
 
 
1185 aa  203  1.9999999999999998e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3429  chromosome segregation protein SMC  44.89 
 
 
1218 aa  203  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10080  chromosome segregation protein SMC  43.03 
 
 
1174 aa  202  3e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.503151  hitchhiker  0.00000182837 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1880  chromosome segregation protein SMC  44.5 
 
 
1165 aa  201  5e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0216  chromosome segregation protein SMC  46.26 
 
 
1181 aa  201  5e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1703  chromosome segregation protein SMC  43.54 
 
 
1138 aa  201  7e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00557127  hitchhiker  0.00000000707845 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1506  chromosome segregation protein SMC  44.02 
 
 
1142 aa  201  7e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00012681  hitchhiker  0.00000000387349 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1367  chromosome segregation protein SMC  40.5 
 
 
1186 aa  201  9e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.803555 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>