More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0765 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0331  chromosome segregation protein SMC  48.02 
 
 
1201 aa  894    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.535871  normal  0.0329796 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0765  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 
1189 aa  2330    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.430738 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2640  chromosome segregation protein SMC  43.65 
 
 
1192 aa  732    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0855  chromosome segregation protein SMC  46.41 
 
 
1200 aa  841    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00379552  normal  0.0307887 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  32.96 
 
 
1187 aa  569  1e-160  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  32.68 
 
 
1189 aa  551  1e-155  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  32.13 
 
 
1189 aa  544  1e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  31.6 
 
 
1189 aa  544  1e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  31.99 
 
 
1189 aa  544  1e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  31.89 
 
 
1189 aa  544  1e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  31.68 
 
 
1189 aa  544  1e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  31.99 
 
 
1189 aa  543  1e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  32.34 
 
 
1189 aa  544  1e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  32.17 
 
 
1189 aa  545  1e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  31.6 
 
 
1189 aa  544  1e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  32.13 
 
 
1189 aa  544  1e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  30.88 
 
 
1190 aa  537  1e-151  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  33.12 
 
 
1186 aa  535  1e-150  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  30.3 
 
 
1190 aa  523  1e-147  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  34.86 
 
 
1187 aa  525  1e-147  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  30.76 
 
 
1188 aa  514  1e-144  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  30.76 
 
 
1188 aa  514  1e-144  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  32.4 
 
 
1181 aa  501  1e-140  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  29.16 
 
 
1196 aa  499  1e-140  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  29.56 
 
 
1189 aa  493  1e-137  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  29.29 
 
 
1191 aa  483  1e-135  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  28.74 
 
 
1185 aa  482  1e-134  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  29.02 
 
 
1185 aa  478  1e-133  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  34.68 
 
 
1185 aa  457  1e-127  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  30.44 
 
 
1184 aa  458  1e-127  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  27.95 
 
 
1177 aa  451  1e-125  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  29.64 
 
 
1186 aa  448  1.0000000000000001e-124  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  30.09 
 
 
1187 aa  443  1e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  31.47 
 
 
1176 aa  445  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  30.52 
 
 
1191 aa  439  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  30.19 
 
 
1179 aa  434  1e-120  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  31.92 
 
 
1177 aa  435  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  29.75 
 
 
1174 aa  431  1e-119  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  30.35 
 
 
1177 aa  431  1e-119  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  31.54 
 
 
1176 aa  429  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  27.98 
 
 
1185 aa  425  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  29.11 
 
 
1185 aa  426  1e-117  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  30.95 
 
 
1175 aa  422  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  27.11 
 
 
1172 aa  422  1e-116  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  29.33 
 
 
1204 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  26.75 
 
 
1178 aa  404  1e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  29.03 
 
 
1186 aa  398  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  29.12 
 
 
1176 aa  390  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  27.85 
 
 
1148 aa  390  1e-107  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  28.72 
 
 
1179 aa  383  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  30.7 
 
 
1167 aa  383  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  24.44 
 
 
1180 aa  375  1e-102  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  28.23 
 
 
1178 aa  374  1e-102  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  29.58 
 
 
1179 aa  367  1e-100  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  29.8 
 
 
1169 aa  367  1e-99  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  29.49 
 
 
1169 aa  364  5.0000000000000005e-99  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  30.38 
 
 
1162 aa  363  1e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  29.01 
 
 
1168 aa  360  8e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  24.26 
 
 
1174 aa  359  9.999999999999999e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  29.6 
 
 
1167 aa  360  9.999999999999999e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  30.18 
 
 
1167 aa  358  1.9999999999999998e-97  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  30.32 
 
 
1167 aa  358  5e-97  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0219  chromosome segregation ATPase  29.7 
 
 
1225 aa  340  9.999999999999999e-92  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  30.85 
 
 
1175 aa  335  3e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  29.5 
 
 
1134 aa  335  4e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  27.04 
 
 
1170 aa  330  8e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  25.3 
 
 
1184 aa  329  1.0000000000000001e-88  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  23.96 
 
 
1164 aa  330  1.0000000000000001e-88  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  27.07 
 
 
1170 aa  329  2.0000000000000001e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  29.02 
 
 
1171 aa  327  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  30.94 
 
 
1164 aa  323  9.999999999999999e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1270  chromosome segregation protein SMC  29.02 
 
 
1171 aa  320  7e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845906  normal  0.0711674 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  29.21 
 
 
1198 aa  320  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  30.45 
 
 
1403 aa  320  1e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0716  chromosome segregation protein SMC  30.14 
 
 
1153 aa  317  7e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  24.57 
 
 
1153 aa  317  9.999999999999999e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1095  chromosome segregation protein  29.64 
 
 
1153 aa  310  1.0000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2638  chromosome segregation protein SMC  28.76 
 
 
1308 aa  298  5e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  27.36 
 
 
1171 aa  290  9e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  23.41 
 
 
1191 aa  287  8e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  22.96 
 
 
1172 aa  276  1.0000000000000001e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  24.62 
 
 
1174 aa  274  6e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  22.71 
 
 
1189 aa  272  2e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  24.7 
 
 
1175 aa  272  4e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  23.2 
 
 
1189 aa  270  1e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  24.67 
 
 
1175 aa  268  4e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  30.79 
 
 
1176 aa  268  5.999999999999999e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  26.95 
 
 
1146 aa  267  7e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  22.89 
 
 
1189 aa  267  8.999999999999999e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  33.88 
 
 
1187 aa  265  3e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  22.61 
 
 
1189 aa  265  4.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  31.77 
 
 
1198 aa  264  8.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2185  chromosome segregation protein SMC  26.41 
 
 
1146 aa  262  3e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  32.52 
 
 
1173 aa  261  6e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1831  chromosome segregation protein SMC  27.45 
 
 
1147 aa  256  2.0000000000000002e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  26.85 
 
 
1217 aa  249  3e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  26.85 
 
 
1193 aa  246  1.9999999999999999e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  30.66 
 
 
1301 aa  245  3e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  25.7 
 
 
1146 aa  245  3.9999999999999997e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4429  chromosome segregation protein SMC  25.94 
 
 
1190 aa  244  7e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>