More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0716 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2318  condensin subunit Smc  52.3 
 
 		 1154 aa  993    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0497  SMC family protein  65.39 
 
 		 1152 aa  1321    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0657  chromosome segregation protein SMC  93.93 
 
 		 1153 aa  2006    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.915586  normal  0.754344 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3824  chromosome segregation protein SMC  51.43 
 
 		 1151 aa  956    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0542546 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2608  chromosome segregation protein SMC  50.6 
 
 		 1168 aa  983    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.198178  normal  0.335966 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1095  chromosome segregation protein  77.06 
 
 		 1153 aa  1631    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0613  chromosome segregation protein SMC  65.31 
 
 		 1152 aa  1315    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3248  condensin subunit Smc  44.12 
 
 		 1167 aa  712    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0745  chromosome segregation protein SMC  49.19 
 
 		 1150 aa  915    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.525394  normal  0.893736 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1066  chromosome segregation protein SMC  51.98 
 
 		 1154 aa  1002    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0374  chromosome segregation protein SMC  44.32 
 
 		 1151 aa  777    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4374  chromosome segregation protein SMC  50.87 
 
 		 1154 aa  1019    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.95695  normal  0.0465691 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1194  chromosome segregation protein SMC  52 
 
 		 1154 aa  994    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3230  chromosome segregation protein SMC  50.64 
 
 		 1170 aa  984    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2587  chromosome segregation protein SMC  45.1 
 
 		 1151 aa  820    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000427179 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0768  condensin subunit Smc  63.51 
 
 		 1152 aa  1181    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0699  chromosome segregation protein SMC  51.16 
 
 		 1153 aa  941    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0500  chromosome segregation protein SMC  65.48 
 
 		 1152 aa  1321    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.169399  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1981  chromosome segregation protein SMC  51.77 
 
 		 1150 aa  889    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0716  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1153 aa  2254    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0547  chromosome segregation protein SMC  74.65 
 
 		 1153 aa  1535    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.725203 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4373  chromosome segregation protein SMC  44.62 
 
 		 1153 aa  729    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.991905 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4983  chromosome segregation protein SMC  51.95 
 
 		 1154 aa  995    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127534  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2199  condensin subunit Smc  45.05 
 
 		 1148 aa  439  1e-121  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.53129 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  33.25 
 
 		 1162 aa  418  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  31.6 
 
 		 1162 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  31.94 
 
 		 1162 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  31.62 
 
 		 1173 aa  402  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  31.67 
 
 		 1167 aa  399  1e-109  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  31.67 
 
 		 1168 aa  396  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  29.95 
 
 		 1169 aa  392  1e-107  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  32.02 
 
 		 1167 aa  388  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  31.89 
 
 		 1167 aa  387  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  29.51 
 
 		 1169 aa  385  1e-105  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  31.67 
 
 		 1182 aa  386  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4694  chromosome segregation protein SMC  41.68 
 
 		 1140 aa  382  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  28.06 
 
 		 1185 aa  381  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  32.16 
 
 		 1171 aa  376  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0163  chromosome segregation protein SMC  48.64 
 
 		 1150 aa  366  1e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  27.47 
 
 		 1189 aa  363  1e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7655  chromosome segregation protein SMC  59.22 
 
 		 1148 aa  358  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00190533  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0144  chromosome segregation protein SMC  54.89 
 
 		 1170 aa  358  3.9999999999999996e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0876  chromosome segregation protein SMC2  54.02 
 
 		 1151 aa  352  2e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.601564  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2536  chromosome segregation protein SMC  54.02 
 
 		 1170 aa  351  4e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6942  chromosome segregation protein SMC  69.08 
 
 		 1144 aa  331  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0702595 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2738  chromosome segregation protein SMC  54.83 
 
 		 1167 aa  329  2.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  27.23 
 
 		 1186 aa  327  8.000000000000001e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  26.21 
 
 		 1186 aa  323  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  27.77 
 
 		 1179 aa  315  2.9999999999999996e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  29.22 
 
 		 1179 aa  314  6.999999999999999e-84  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2270  chromosome segregation protein SMC  62.39 
 
 		 1147 aa  295  3e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0064  SMC domain protein  41.42 
 
 		 1511 aa  295  4e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0434137 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0955  chromosome segregation protein SMC  46.88 
 
 		 1147 aa  293  9e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.235362  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  23.84 
 
 		 1180 aa  283  1e-74  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0399  chromosome segregation protein SMC  45.17 
 
 		 1165 aa  277  1.0000000000000001e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.489923  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  24.41 
 
 		 1164 aa  268  5e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  30.97 
 
 		 1176 aa  230  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  31.25 
 
 		 1167 aa  225  3e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  29.71 
 
 		 1175 aa  222  3e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2656  chromosome segregation protein SMC  44.44 
 
 		 1138 aa  219  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000574242  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2760  chromosome segregation protein SMC  44.44 
 
 		 1138 aa  219  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.494661  unclonable  0.00000956134 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2681  chromosome segregation protein SMC  44.44 
 
 		 1138 aa  219  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000886702  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  29.35 
 
 		 1177 aa  219  2.9999999999999998e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  45.96 
 
 		 1199 aa  218  5.9999999999999996e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  48.46 
 
 		 1195 aa  218  5.9999999999999996e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  45.96 
 
 		 1199 aa  218  5.9999999999999996e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1736  chromosome segregation protein SMC  51.18 
 
 		 814 aa  218  5.9999999999999996e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00195971  unclonable  0.00000000014199 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1703  chromosome segregation protein SMC  44.09 
 
 		 1138 aa  218  7e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00557127  hitchhiker  0.00000000707845 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  50.88 
 
 		 1199 aa  218  8e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  46.43 
 
 		 1164 aa  216  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1687  chromosome segregation protein SMC  30.38 
 
 		 1140 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0207263  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  48.67 
 
 		 1198 aa  214  1e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  48.7 
 
 		 1164 aa  214  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4276  chromosome segregation protein SMC  36.34 
 
 		 1162 aa  213  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3840  chromosome segregation protein SMC  36.34 
 
 		 1162 aa  213  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509302 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  43.46 
 
 		 1162 aa  213  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1592  chromosome segregation protein SMC  36.34 
 
 		 1162 aa  213  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.843365  normal  0.195769 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3602  chromosome segregation protein SMC  36.34 
 
 		 1162 aa  213  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0161  chromosome segregation protein SMC  31.99 
 
 		 1167 aa  212  3e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1567  chromosome segregation protein SMC  37.15 
 
 		 1142 aa  212  4e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218486  hitchhiker  0.0000000844837 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1573  chromosome segregation protein SMC  36.87 
 
 		 1142 aa  211  9e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00374514  hitchhiker  0.000804403 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  42.4 
 
 		 1171 aa  209  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  35.7 
 
 		 1175 aa  209  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  45.15 
 
 		 1163 aa  208  5e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1799  condensin subunit Smc  35.93 
 
 		 1162 aa  207  7e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0884011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1514  SMC family protein  31.3 
 
 		 1139 aa  207  7e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1506  chromosome segregation protein SMC  36.87 
 
 		 1142 aa  207  8e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00012681  hitchhiker  0.00000000387349 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  42.62 
 
 		 1162 aa  207  8e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  36.59 
 
 		 1176 aa  207  8e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  42.32 
 
 		 1164 aa  207  9e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  42.62 
 
 		 1162 aa  206  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2898  SMC family protein  34.16 
 
 		 1145 aa  206  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  49.57 
 
 		 1403 aa  206  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2463  chromosome segregation protein SMC  49.3 
 
 		 1144 aa  206  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000141924  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  41.38 
 
 		 1176 aa  206  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  42.24 
 
 		 1176 aa  205  4e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  42.24 
 
 		 1176 aa  204  7e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1228  condensin subunit Smc  31.3 
 
 		 1165 aa  204  7e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  36.45 
 
 		 1190 aa  204  7e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1401  condensin subunit Smc  32 
 
 		 1168 aa  204  7e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.934786  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>