More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1066 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0497  SMC family protein  51.7 
 
 		 1152 aa  1001    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0613  chromosome segregation protein SMC  50.78 
 
 		 1152 aa  977    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2608  chromosome segregation protein SMC  76.71 
 
 		 1168 aa  1651    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.198178  normal  0.335966 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3824  chromosome segregation protein SMC  54 
 
 		 1151 aa  1020    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0542546 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3248  condensin subunit Smc  44.84 
 
 		 1167 aa  742    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0699  chromosome segregation protein SMC  51.35 
 
 		 1153 aa  976    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4983  chromosome segregation protein SMC  88.39 
 
 		 1154 aa  1888    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127534  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1066  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1154 aa  2271    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0374  chromosome segregation protein SMC  44.35 
 
 		 1151 aa  791    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0716  chromosome segregation protein SMC  51.61 
 
 		 1153 aa  995    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4374  chromosome segregation protein SMC  80.5 
 
 		 1154 aa  1753    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.95695  normal  0.0465691 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1194  chromosome segregation protein SMC  93.07 
 
 		 1154 aa  2032    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3230  chromosome segregation protein SMC  76.97 
 
 		 1170 aa  1632    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2587  chromosome segregation protein SMC  44.28 
 
 		 1151 aa  803    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000427179 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1095  chromosome segregation protein  51.77 
 
 		 1153 aa  1011    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0768  condensin subunit Smc  52.58 
 
 		 1152 aa  941    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1981  chromosome segregation protein SMC  56.87 
 
 		 1150 aa  999    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0500  chromosome segregation protein SMC  51.78 
 
 		 1152 aa  1004    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.169399  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0745  chromosome segregation protein SMC  49.35 
 
 		 1150 aa  922    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.525394  normal  0.893736 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2199  condensin subunit Smc  44.11 
 
 		 1148 aa  723    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.53129 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0547  chromosome segregation protein SMC  51.3 
 
 		 1153 aa  979    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.725203 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2318  condensin subunit Smc  76.08 
 
 		 1154 aa  1623    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0657  chromosome segregation protein SMC  51.17 
 
 		 1153 aa  972    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.915586  normal  0.754344 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4694  chromosome segregation protein SMC  45.26 
 
 		 1140 aa  432  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  30.75 
 
 		 1173 aa  398  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  31.37 
 
 		 1182 aa  381  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1506  chromosome segregation protein SMC  30.11 
 
 		 1142 aa  381  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00012681  hitchhiker  0.00000000387349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1573  chromosome segregation protein SMC  29.53 
 
 		 1142 aa  381  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00374514  hitchhiker  0.000804403 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1567  chromosome segregation protein SMC  29.37 
 
 		 1142 aa  382  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218486  hitchhiker  0.0000000844837 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  28.51 
 
 		 1169 aa  378  1e-103  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  29.19 
 
 		 1195 aa  375  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  26.58 
 
 		 1191 aa  373  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  28.63 
 
 		 1164 aa  371  1e-101  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  28.73 
 
 		 1164 aa  370  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  30.87 
 
 		 1171 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  28.28 
 
 		 1169 aa  370  1e-101  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  29.48 
 
 		 1168 aa  369  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  27.7 
 
 		 1189 aa  369  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  27.59 
 
 		 1189 aa  365  3e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7655  chromosome segregation protein SMC  61.99 
 
 		 1148 aa  364  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00190533  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  26.29 
 
 		 1185 aa  362  2e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  27.85 
 
 		 1189 aa  361  4e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  27.94 
 
 		 1189 aa  359  1.9999999999999998e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  27.94 
 
 		 1189 aa  359  1.9999999999999998e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  28.48 
 
 		 1189 aa  359  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  27.97 
 
 		 1189 aa  357  5.999999999999999e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  27.76 
 
 		 1189 aa  357  5.999999999999999e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  27.97 
 
 		 1189 aa  357  5.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2379  chromosome segregation protein SMC  29.81 
 
 		 1141 aa  357  6.999999999999999e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.882333  unclonable  0.00000367062 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  27.88 
 
 		 1189 aa  357  8.999999999999999e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4373  chromosome segregation protein SMC  54.21 
 
 		 1153 aa  351  4e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.991905 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  25.59 
 
 		 1190 aa  350  7e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  26.77 
 
 		 1189 aa  349  2e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0876  chromosome segregation protein SMC2  52.87 
 
 		 1151 aa  348  4e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.601564  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  27.47 
 
 		 1186 aa  347  6e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  27.34 
 
 		 1185 aa  347  7e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  30.01 
 
 		 1167 aa  347  1e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  29.89 
 
 		 1167 aa  346  2e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0163  chromosome segregation protein SMC  49.62 
 
 		 1150 aa  345  2.9999999999999997e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  27.68 
 
 		 1189 aa  343  1e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  26.69 
 
 		 1176 aa  342  2.9999999999999998e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0144  chromosome segregation protein SMC  64.86 
 
 		 1170 aa  333  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6942  chromosome segregation protein SMC  68.13 
 
 		 1144 aa  333  1e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0702595 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2738  chromosome segregation protein SMC  50.84 
 
 		 1167 aa  332  2e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  29.67 
 
 		 1177 aa  330  1.0000000000000001e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2536  chromosome segregation protein SMC  64.84 
 
 		 1170 aa  328  3e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0955  chromosome segregation protein SMC  50.52 
 
 		 1147 aa  319  2e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.235362  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  26.39 
 
 		 1177 aa  316  1.9999999999999998e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2270  chromosome segregation protein SMC  56.83 
 
 		 1147 aa  301  3e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0064  SMC domain protein  40.61 
 
 		 1511 aa  297  7e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0434137 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  25.93 
 
 		 1181 aa  284  6.000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  22.99 
 
 		 1180 aa  273  1e-71  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0399  chromosome segregation protein SMC  55.46 
 
 		 1165 aa  268  4e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.489923  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2638  chromosome segregation protein SMC  27.46 
 
 		 1308 aa  265  4e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  23.33 
 
 		 1174 aa  265  4.999999999999999e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  54.55 
 
 		 1176 aa  228  5.0000000000000005e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  54.04 
 
 		 1176 aa  225  4e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  36.82 
 
 		 1175 aa  223  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  47.06 
 
 		 1174 aa  220  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  47.06 
 
 		 1174 aa  220  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3590  chromosome segregation protein SMC  34.98 
 
 		 1204 aa  220  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968509  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  42.11 
 
 		 1190 aa  218  4e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1814  chromosome segregation protein SMC  47.71 
 
 		 1181 aa  218  4e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  35.91 
 
 		 1175 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  49.77 
 
 		 1177 aa  216  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  48.4 
 
 		 1198 aa  216  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1228  condensin subunit Smc  40.78 
 
 		 1165 aa  214  7e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  46.36 
 
 		 1175 aa  213  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0679  chromosome segregation protein SMC  48.71 
 
 		 1168 aa  213  1e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2952  chromosome segregation protein SMC  46.64 
 
 		 1171 aa  213  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0128917  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2514  chromosome segregation protein SMC  41.7 
 
 		 1170 aa  213  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0530303 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  47.95 
 
 		 1199 aa  212  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  27.91 
 
 		 1301 aa  211  5e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0161  chromosome segregation protein SMC  32.43 
 
 		 1167 aa  210  1e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  30.03 
 
 		 1162 aa  208  5e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  48.23 
 
 		 1403 aa  208  6e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  42.36 
 
 		 1175 aa  204  7e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1736  chromosome segregation protein SMC  47 
 
 		 814 aa  204  9e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00195971  unclonable  0.00000000014199 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  49.77 
 
 		 1185 aa  202  3e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5336  chromosome segregation protein SMC  45.05 
 
 		 1170 aa  201  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.119827 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>