More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1485 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1485  SMC domain protein  100 
 
 
952 aa  1889    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1496  chromosome partition protein SmC, putative  30.63 
 
 
980 aa  433  1e-120  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  34.58 
 
 
1176 aa  240  8e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  39.78 
 
 
1187 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  38.3 
 
 
1187 aa  234  5e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  32.1 
 
 
1175 aa  231  5e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  41.51 
 
 
1176 aa  229  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  41.51 
 
 
1176 aa  229  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  44.13 
 
 
1190 aa  227  7e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  36.74 
 
 
1176 aa  226  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  44.32 
 
 
1188 aa  225  3e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  44.32 
 
 
1188 aa  225  3e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  44.98 
 
 
1189 aa  223  9.999999999999999e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  36.98 
 
 
1179 aa  223  9.999999999999999e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  40.88 
 
 
1177 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  40 
 
 
1190 aa  221  3.9999999999999997e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  41.52 
 
 
1301 aa  221  6e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  40.07 
 
 
1196 aa  219  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  28.77 
 
 
1173 aa  218  4e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  32.76 
 
 
1186 aa  217  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  34.29 
 
 
1198 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  45.58 
 
 
1176 aa  215  3.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  41.95 
 
 
1190 aa  211  7e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  35.09 
 
 
1199 aa  210  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  35.09 
 
 
1199 aa  210  1e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  41.48 
 
 
1191 aa  210  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  47.41 
 
 
1185 aa  209  2e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0419  chromosome segregation protein SMC  42.06 
 
 
1190 aa  208  3e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327904  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  34.92 
 
 
1199 aa  208  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  43.57 
 
 
1189 aa  208  3e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  42.06 
 
 
1179 aa  208  4e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  43.57 
 
 
1189 aa  208  4e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  48.68 
 
 
1187 aa  207  5e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  36.52 
 
 
1177 aa  207  7e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  40.83 
 
 
1185 aa  207  9e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  39.38 
 
 
1189 aa  206  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  39.24 
 
 
1186 aa  206  1e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  42.91 
 
 
1178 aa  207  1e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  43.59 
 
 
1198 aa  206  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  46.55 
 
 
1185 aa  206  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  33.6 
 
 
1176 aa  206  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  33.17 
 
 
1175 aa  205  3e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  41.34 
 
 
1189 aa  204  7e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  41.34 
 
 
1189 aa  204  7e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  40.94 
 
 
1189 aa  204  7e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  41.34 
 
 
1189 aa  204  8e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  41.34 
 
 
1189 aa  204  8e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  41.34 
 
 
1189 aa  204  8e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  41.34 
 
 
1189 aa  204  9e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  35.52 
 
 
1169 aa  203  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  34.77 
 
 
1177 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  35.69 
 
 
1174 aa  202  1.9999999999999998e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  35.52 
 
 
1169 aa  202  3e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1167  chromosome segregation protein SMC  42.45 
 
 
1255 aa  201  3.9999999999999996e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469719  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  39.25 
 
 
1185 aa  201  3.9999999999999996e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  40.94 
 
 
1189 aa  201  5e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  35.98 
 
 
1164 aa  201  5e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1687  chromosome segregation protein SMC  37.03 
 
 
1140 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0207263  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  44.89 
 
 
1178 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2849  chromosome segregation protein SMC  41.13 
 
 
1133 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000354618  unclonable  0.0000000590997 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  36.24 
 
 
1164 aa  199  3e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1367  chromosome segregation protein SMC  42.56 
 
 
1186 aa  199  3e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.803555 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  33.7 
 
 
1164 aa  199  3e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  41.32 
 
 
1177 aa  198  4.0000000000000005e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2681  chromosome segregation protein SMC  40.31 
 
 
1138 aa  198  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000886702  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  40.82 
 
 
1185 aa  198  5.000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05690  chromosome segregation protein SMC  39.27 
 
 
1184 aa  197  7e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.188799  normal  0.418307 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1457  chromosome segregation protein SMC  31.81 
 
 
1173 aa  197  7e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  34.43 
 
 
1179 aa  197  7e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1506  chromosome segregation protein SMC  40.7 
 
 
1142 aa  197  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00012681  hitchhiker  0.00000000387349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1573  chromosome segregation protein SMC  40.7 
 
 
1142 aa  197  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00374514  hitchhiker  0.000804403 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1567  chromosome segregation protein SMC  40.7 
 
 
1142 aa  197  9e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218486  hitchhiker  0.0000000844837 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2656  chromosome segregation protein SMC  37.38 
 
 
1138 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000574242  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1703  chromosome segregation protein SMC  37.38 
 
 
1138 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00557127  hitchhiker  0.00000000707845 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2898  SMC family protein  40.7 
 
 
1145 aa  196  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2760  chromosome segregation protein SMC  40.31 
 
 
1138 aa  196  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.494661  unclonable  0.00000956134 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  33.73 
 
 
1148 aa  196  2e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  37.54 
 
 
1185 aa  196  2e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  36.54 
 
 
1180 aa  195  3e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2366  chromosome segregation protein SMC  40.31 
 
 
1145 aa  194  5e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00122996  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0219  chromosome segregation ATPase  32.86 
 
 
1225 aa  194  6e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0655  condensin subunit Smc  38.35 
 
 
1183 aa  192  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  29.27 
 
 
1167 aa  193  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  31.62 
 
 
1167 aa  192  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  32.04 
 
 
1162 aa  192  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2514  chromosome segregation protein SMC  33.25 
 
 
1170 aa  191  4e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0530303 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2379  chromosome segregation protein SMC  36.82 
 
 
1141 aa  191  5e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.882333  unclonable  0.00000367062 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0501  chromosome segregation protein SMC  34.59 
 
 
1152 aa  191  5.999999999999999e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  34.33 
 
 
1184 aa  191  5.999999999999999e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10080  chromosome segregation protein SMC  31.95 
 
 
1174 aa  191  7e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.503151  hitchhiker  0.00000182837 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  33.9 
 
 
1167 aa  190  9e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  33.9 
 
 
1167 aa  190  9e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1695  chromosome segregation protein SMC  36.64 
 
 
1170 aa  190  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.573512  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2440  chromosome segregation SMC protein  31.46 
 
 
1109 aa  189  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129774  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2638  chromosome segregation protein SMC  44.72 
 
 
1308 aa  189  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  42.79 
 
 
1162 aa  188  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  33.85 
 
 
1182 aa  188  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  31.17 
 
 
1403 aa  188  4e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  44.28 
 
 
1187 aa  188  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7990  chromosome segregation SMC protein  39.36 
 
 
1227 aa  188  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.900943  normal  0.462175 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>