More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2318 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2318  condensin subunit Smc  100 
 
 		 1154 aa  2274    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0497  SMC family protein  52.56 
 
 		 1152 aa  1029    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0613  chromosome segregation protein SMC  51.57 
 
 		 1152 aa  1009    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0699  chromosome segregation protein SMC  50.92 
 
 		 1153 aa  979    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2608  chromosome segregation protein SMC  75.34 
 
 		 1168 aa  1622    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.198178  normal  0.335966 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0716  chromosome segregation protein SMC  51.96 
 
 		 1153 aa  1007    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4983  chromosome segregation protein SMC  76.34 
 
 		 1154 aa  1619    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127534  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3248  condensin subunit Smc  44.87 
 
 		 1167 aa  752    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3824  chromosome segregation protein SMC  54.21 
 
 		 1151 aa  1046    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0542546 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1066  chromosome segregation protein SMC  76.08 
 
 		 1154 aa  1645    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0374  chromosome segregation protein SMC  44.54 
 
 		 1151 aa  786    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4374  chromosome segregation protein SMC  77.04 
 
 		 1154 aa  1676    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.95695  normal  0.0465691 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0163  chromosome segregation protein SMC  46.45 
 
 		 1150 aa  759    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1194  chromosome segregation protein SMC  76.26 
 
 		 1154 aa  1636    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1095  chromosome segregation protein  51.34 
 
 		 1153 aa  1008    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3230  chromosome segregation protein SMC  75.68 
 
 		 1170 aa  1620    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2587  chromosome segregation protein SMC  45.24 
 
 		 1151 aa  827    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000427179 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0768  condensin subunit Smc  52.33 
 
 		 1152 aa  940    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0500  chromosome segregation protein SMC  52.65 
 
 		 1152 aa  1031    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.169399  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2199  condensin subunit Smc  43.99 
 
 		 1148 aa  713    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.53129 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0547  chromosome segregation protein SMC  51.52 
 
 		 1153 aa  989    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.725203 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1981  chromosome segregation protein SMC  57.85 
 
 		 1150 aa  1025    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0745  chromosome segregation protein SMC  50.04 
 
 		 1150 aa  956    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.525394  normal  0.893736 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0657  chromosome segregation protein SMC  51.52 
 
 		 1153 aa  983    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.915586  normal  0.754344 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4694  chromosome segregation protein SMC  44.59 
 
 		 1140 aa  431  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  31.06 
 
 		 1173 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1228  condensin subunit Smc  31.92 
 
 		 1165 aa  398  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  31.52 
 
 		 1175 aa  398  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  31.11 
 
 		 1175 aa  390  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  30.92 
 
 		 1176 aa  392  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1573  chromosome segregation protein SMC  30.75 
 
 		 1142 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00374514  hitchhiker  0.000804403 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  31.29 
 
 		 1176 aa  385  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1506  chromosome segregation protein SMC  30.62 
 
 		 1142 aa  385  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00012681  hitchhiker  0.00000000387349 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  31.17 
 
 		 1162 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  28.37 
 
 		 1169 aa  383  1e-104  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  28.21 
 
 		 1169 aa  383  1e-104  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2366  chromosome segregation protein SMC  28.48 
 
 		 1145 aa  377  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00122996  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  28.58 
 
 		 1189 aa  374  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  28.66 
 
 		 1189 aa  376  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  28.5 
 
 		 1189 aa  373  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  28.5 
 
 		 1189 aa  373  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  30.76 
 
 		 1171 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  29.84 
 
 		 1190 aa  369  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  31.5 
 
 		 1198 aa  366  1e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  30.47 
 
 		 1198 aa  365  4e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  27.18 
 
 		 1185 aa  359  9.999999999999999e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  28.15 
 
 		 1187 aa  359  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0161  chromosome segregation protein SMC  30.95 
 
 		 1167 aa  359  1.9999999999999998e-97  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7655  chromosome segregation protein SMC  61.01 
 
 		 1148 aa  358  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00190533  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  29.98 
 
 		 1167 aa  355  2.9999999999999997e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0144  chromosome segregation protein SMC  53.63 
 
 		 1170 aa  354  5e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  27.4 
 
 		 1189 aa  353  1e-95  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0876  chromosome segregation protein SMC2  54.67 
 
 		 1151 aa  353  1e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.601564  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  26.29 
 
 		 1190 aa  353  2e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4373  chromosome segregation protein SMC  53.35 
 
 		 1153 aa  352  2e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.991905 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0900  chromosome segregation protein SMC  30.85 
 
 		 1150 aa  352  3e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.188992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0753  chromosome segregation protein SMC  30.85 
 
 		 1150 aa  351  4e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2536  chromosome segregation protein SMC  53.8 
 
 		 1170 aa  350  7e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  26.69 
 
 		 1188 aa  347  7e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  26.69 
 
 		 1188 aa  347  7e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  27.75 
 
 		 1174 aa  347  8.999999999999999e-94  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  30.1 
 
 		 1162 aa  345  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  30.22 
 
 		 1167 aa  344  4e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  29.11 
 
 		 1177 aa  342  2.9999999999999998e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  27.04 
 
 		 1187 aa  339  1.9999999999999998e-91  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  26.97 
 
 		 1186 aa  338  2.9999999999999997e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  25.36 
 
 		 1190 aa  333  1e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0501  chromosome segregation protein SMC  28.14 
 
 		 1152 aa  332  3e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  27.41 
 
 		 1179 aa  326  1e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2738  chromosome segregation protein SMC  53.39 
 
 		 1167 aa  323  9.999999999999999e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6942  chromosome segregation protein SMC  66.53 
 
 		 1144 aa  320  7.999999999999999e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0702595 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  25.49 
 
 		 1177 aa  318  4e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  28.58 
 
 		 1194 aa  301  4e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0064  SMC domain protein  44.2 
 
 		 1511 aa  301  5e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0434137 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0955  chromosome segregation protein SMC  50.43 
 
 		 1147 aa  296  1e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.235362  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  26.66 
 
 		 1191 aa  296  2e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  28.36 
 
 		 1179 aa  293  9e-78  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2270  chromosome segregation protein SMC  54.68 
 
 		 1147 aa  293  1e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  26.37 
 
 		 1181 aa  289  2e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1291  chromosome segregation protein SMC  30.23 
 
 		 1198 aa  286  1.0000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.898682 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  30.03 
 
 		 1403 aa  283  1e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  24.4 
 
 		 1175 aa  282  3e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  24.44 
 
 		 1164 aa  279  3e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0399  chromosome segregation protein SMC  56.33 
 
 		 1165 aa  273  1e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.489923  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  22.53 
 
 		 1180 aa  266  2e-69  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2638  chromosome segregation protein SMC  27.7 
 
 		 1308 aa  265  3e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  26.98 
 
 		 1134 aa  237  9e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  52.56 
 
 		 1195 aa  223  9.999999999999999e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3590  chromosome segregation protein SMC  48.42 
 
 		 1204 aa  221  5e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968509  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  48.87 
 
 		 1199 aa  219  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2516  chromosome segregation protein SMC  45.88 
 
 		 1138 aa  218  4e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0576231  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2463  chromosome segregation protein SMC  50.46 
 
 		 1144 aa  218  5e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000141924  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1732  chromosome segregation protein SMC  40.63 
 
 		 1167 aa  216  2.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  47.71 
 
 		 1175 aa  214  7e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  30.09 
 
 		 1185 aa  214  7e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  48.6 
 
 		 1182 aa  214  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  27.62 
 
 		 1189 aa  213  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2952  chromosome segregation protein SMC  48.61 
 
 		 1171 aa  213  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0128917  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0679  chromosome segregation protein SMC  48.47 
 
 		 1168 aa  213  2e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  27.98 
 
 		 1189 aa  213  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>