More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3248 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0716  chromosome segregation protein SMC  44.34 
 
 		 1153 aa  723    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0497  SMC family protein  46 
 
 		 1152 aa  771    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4373  chromosome segregation protein SMC  44.63 
 
 		 1153 aa  660    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.991905 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2608  chromosome segregation protein SMC  45.01 
 
 		 1168 aa  764    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.198178  normal  0.335966 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1095  chromosome segregation protein  44.82 
 
 		 1153 aa  742    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0699  chromosome segregation protein SMC  47.18 
 
 		 1153 aa  809    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0163  chromosome segregation protein SMC  46.51 
 
 		 1150 aa  729    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0657  chromosome segregation protein SMC  44.68 
 
 		 1153 aa  725    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.915586  normal  0.754344 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3248  condensin subunit Smc  100 
 
 		 1167 aa  2186    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2318  condensin subunit Smc  44.29 
 
 		 1154 aa  792    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1066  chromosome segregation protein SMC  44.74 
 
 		 1154 aa  783    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3824  chromosome segregation protein SMC  44.98 
 
 		 1151 aa  721    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0542546 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0374  chromosome segregation protein SMC  45.05 
 
 		 1151 aa  771    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4374  chromosome segregation protein SMC  44.56 
 
 		 1154 aa  783    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.95695  normal  0.0465691 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0745  chromosome segregation protein SMC  43.36 
 
 		 1150 aa  689    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.525394  normal  0.893736 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1194  chromosome segregation protein SMC  44.96 
 
 		 1154 aa  766    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3230  chromosome segregation protein SMC  44.7 
 
 		 1170 aa  752    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0613  chromosome segregation protein SMC  46.44 
 
 		 1152 aa  785    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2587  chromosome segregation protein SMC  44.66 
 
 		 1151 aa  775    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000427179 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0768  condensin subunit Smc  46.26 
 
 		 1152 aa  711    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0500  chromosome segregation protein SMC  46.53 
 
 		 1152 aa  771    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.169399  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2199  condensin subunit Smc  44.28 
 
 		 1148 aa  682    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.53129 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0547  chromosome segregation protein SMC  46.02 
 
 		 1153 aa  777    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.725203 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4983  chromosome segregation protein SMC  45.18 
 
 		 1154 aa  766    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127534  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  31.63 
 
 		 1176 aa  404  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  33.66 
 
 		 1167 aa  399  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  32.56 
 
 		 1173 aa  394  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  32.18 
 
 		 1162 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  28.31 
 
 		 1187 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4694  chromosome segregation protein SMC  45.08 
 
 		 1140 aa  387  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1506  chromosome segregation protein SMC  31.08 
 
 		 1142 aa  389  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00012681  hitchhiker  0.00000000387349 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  32.98 
 
 		 1162 aa  385  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  28.65 
 
 		 1164 aa  380  1e-104  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  28.28 
 
 		 1164 aa  375  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  32.92 
 
 		 1167 aa  373  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  25.35 
 
 		 1191 aa  373  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  32.44 
 
 		 1185 aa  370  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  32.41 
 
 		 1198 aa  373  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  32.68 
 
 		 1198 aa  371  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  31.98 
 
 		 1171 aa  368  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  31.6 
 
 		 1171 aa  369  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  32.53 
 
 		 1175 aa  365  3e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2026  chromosome segregation protein SMC  32.87 
 
 		 1170 aa  363  7.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.676203  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2046  chromosome segregation protein SMC  32.84 
 
 		 1170 aa  363  8e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.884019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1250  chromosome segregation protein SMC  32.44 
 
 		 1206 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0144  chromosome segregation protein SMC  50.86 
 
 		 1170 aa  333  9e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  25.93 
 
 		 1186 aa  331  6e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  25.08 
 
 		 1177 aa  326  1e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2536  chromosome segregation protein SMC  53.07 
 
 		 1170 aa  320  7e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  30.26 
 
 		 1179 aa  320  9e-86  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  27.27 
 
 		 1186 aa  319  2e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0876  chromosome segregation protein SMC2  51.9 
 
 		 1151 aa  318  3e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.601564  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0064  SMC domain protein  47.6 
 
 		 1511 aa  314  4.999999999999999e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0434137 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2270  chromosome segregation protein SMC  61.45 
 
 		 1147 aa  302  3e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1981  chromosome segregation protein SMC  62 
 
 		 1150 aa  301  4e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7655  chromosome segregation protein SMC  62.55 
 
 		 1148 aa  300  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00190533  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0955  chromosome segregation protein SMC  50.27 
 
 		 1147 aa  298  3e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.235362  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2738  chromosome segregation protein SMC  50.83 
 
 		 1167 aa  289  2e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  26.26 
 
 		 1181 aa  287  7e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0399  chromosome segregation protein SMC  61.47 
 
 		 1165 aa  287  9e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.489923  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6942  chromosome segregation protein SMC  61.26 
 
 		 1144 aa  275  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0702595 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  25.94 
 
 		 1170 aa  274  6e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1573  chromosome segregation protein SMC  29.14 
 
 		 1142 aa  231  9e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00374514  hitchhiker  0.000804403 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  31.23 
 
 		 1195 aa  222  3e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  35.17 
 
 		 1169 aa  219  2e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  51.52 
 
 		 1176 aa  219  2.9999999999999998e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2898  SMC family protein  43.88 
 
 		 1145 aa  219  2.9999999999999998e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  34.93 
 
 		 1169 aa  219  2.9999999999999998e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1567  chromosome segregation protein SMC  43.88 
 
 		 1142 aa  219  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218486  hitchhiker  0.0000000844837 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2760  chromosome segregation protein SMC  43.88 
 
 		 1138 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.494661  unclonable  0.00000956134 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2656  chromosome segregation protein SMC  43.88 
 
 		 1138 aa  217  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000574242  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1703  chromosome segregation protein SMC  43.88 
 
 		 1138 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00557127  hitchhiker  0.00000000707845 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2681  chromosome segregation protein SMC  43.88 
 
 		 1138 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000886702  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1514  SMC family protein  44.73 
 
 		 1139 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2366  chromosome segregation protein SMC  43.88 
 
 		 1145 aa  215  3.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00122996  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2463  chromosome segregation protein SMC  42.32 
 
 		 1144 aa  215  3.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000141924  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  44.84 
 
 		 1167 aa  214  7.999999999999999e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  44.84 
 
 		 1167 aa  214  7.999999999999999e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  45.99 
 
 		 1163 aa  213  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1695  chromosome segregation protein SMC  42.62 
 
 		 1170 aa  212  3e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.573512  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  38.94 
 
 		 1176 aa  212  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2849  chromosome segregation protein SMC  43.88 
 
 		 1133 aa  212  4e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000354618  unclonable  0.0000000590997 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  45.8 
 
 		 1164 aa  212  4e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  43.23 
 
 		 1176 aa  211  9e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  43.23 
 
 		 1176 aa  211  9e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  41.05 
 
 		 1175 aa  210  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1687  chromosome segregation protein SMC  43.04 
 
 		 1140 aa  209  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0207263  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2516  chromosome segregation protein SMC  42.98 
 
 		 1138 aa  209  3e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0576231  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1228  condensin subunit Smc  32.92 
 
 		 1165 aa  209  4e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  44.93 
 
 		 1301 aa  208  4e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  39.25 
 
 		 1162 aa  208  5e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  35.9 
 
 		 1187 aa  208  6e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  43.46 
 
 		 1164 aa  208  6e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  44.39 
 
 		 1179 aa  207  1e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  36.9 
 
 		 1174 aa  206  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3602  chromosome segregation protein SMC  44.4 
 
 		 1162 aa  206  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  33.85 
 
 		 1194 aa  205  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  43.5 
 
 		 1168 aa  205  3e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3840  chromosome segregation protein SMC  43.97 
 
 		 1162 aa  205  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509302 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  36.65 
 
 		 1168 aa  205  5e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>