More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4983 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0657  chromosome segregation protein SMC  50.87 
 
 		 1153 aa  983    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.915586  normal  0.754344 
 
 
-
 
NC_004310  BR0497  SMC family protein  52.13 
 
 		 1152 aa  1011    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3824  chromosome segregation protein SMC  54.35 
 
 		 1151 aa  1031    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0542546 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2608  chromosome segregation protein SMC  75.17 
 
 		 1168 aa  1618    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.198178  normal  0.335966 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0716  chromosome segregation protein SMC  51.66 
 
 		 1153 aa  1013    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0699  chromosome segregation protein SMC  51.18 
 
 		 1153 aa  974    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4983  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1154 aa  2263    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127534  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3248  condensin subunit Smc  45.52 
 
 		 1167 aa  750    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2318  condensin subunit Smc  76.34 
 
 		 1154 aa  1618    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1066  chromosome segregation protein SMC  88.39 
 
 		 1154 aa  1930    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0374  chromosome segregation protein SMC  44.11 
 
 		 1151 aa  790    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4374  chromosome segregation protein SMC  79.9 
 
 		 1154 aa  1734    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.95695  normal  0.0465691 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1194  chromosome segregation protein SMC  87.95 
 
 		 1154 aa  1906    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3230  chromosome segregation protein SMC  76.11 
 
 		 1170 aa  1613    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1981  chromosome segregation protein SMC  56.96 
 
 		 1150 aa  1019    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2587  chromosome segregation protein SMC  44.88 
 
 		 1151 aa  813    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000427179 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0745  chromosome segregation protein SMC  49.7 
 
 		 1150 aa  934    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.525394  normal  0.893736 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0768  condensin subunit Smc  53.19 
 
 		 1152 aa  947    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0500  chromosome segregation protein SMC  52.22 
 
 		 1152 aa  1011    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.169399  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0547  chromosome segregation protein SMC  51.09 
 
 		 1153 aa  985    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.725203 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2199  condensin subunit Smc  43.7 
 
 		 1148 aa  739    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.53129 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0613  chromosome segregation protein SMC  51.66 
 
 		 1152 aa  995    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0163  chromosome segregation protein SMC  45.64 
 
 		 1150 aa  731    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1095  chromosome segregation protein  51.6 
 
 		 1153 aa  1023    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4694  chromosome segregation protein SMC  45.92 
 
 		 1140 aa  431  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  32.3 
 
 		 1175 aa  403  9.999999999999999e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  31.78 
 
 		 1171 aa  395  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  29.93 
 
 		 1176 aa  392  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  31.76 
 
 		 1182 aa  389  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1567  chromosome segregation protein SMC  29.07 
 
 		 1142 aa  384  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218486  hitchhiker  0.0000000844837 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2681  chromosome segregation protein SMC  29.24 
 
 		 1138 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000886702  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  31.48 
 
 		 1199 aa  382  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1506  chromosome segregation protein SMC  28.99 
 
 		 1142 aa  382  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00012681  hitchhiker  0.00000000387349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1573  chromosome segregation protein SMC  29.45 
 
 		 1142 aa  382  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00374514  hitchhiker  0.000804403 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  31.54 
 
 		 1171 aa  379  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  30.29 
 
 		 1190 aa  377  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  30.06 
 
 		 1162 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2366  chromosome segregation protein SMC  29.02 
 
 		 1145 aa  378  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00122996  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  26.08 
 
 		 1191 aa  376  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  30.01 
 
 		 1162 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2019  chromosome segregation protein SMC  32.04 
 
 		 1170 aa  368  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  28.1 
 
 		 1189 aa  369  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  28.51 
 
 		 1189 aa  368  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7655  chromosome segregation protein SMC  62.89 
 
 		 1148 aa  367  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00190533  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  30.89 
 
 		 1164 aa  366  2e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  28.29 
 
 		 1189 aa  364  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  28.73 
 
 		 1189 aa  364  5.0000000000000005e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  28.73 
 
 		 1189 aa  364  5.0000000000000005e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  28.29 
 
 		 1189 aa  364  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  28.29 
 
 		 1189 aa  364  6e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  28.57 
 
 		 1189 aa  364  6e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  28.29 
 
 		 1189 aa  363  1e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  27.09 
 
 		 1185 aa  362  2e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  29.56 
 
 		 1167 aa  358  1.9999999999999998e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  28.13 
 
 		 1189 aa  358  2.9999999999999997e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4373  chromosome segregation protein SMC  54.49 
 
 		 1153 aa  356  1e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.991905 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  28.46 
 
 		 1187 aa  353  1e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0876  chromosome segregation protein SMC2  53.16 
 
 		 1151 aa  348  4e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.601564  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0144  chromosome segregation protein SMC  52.3 
 
 		 1170 aa  347  8e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  26.48 
 
 		 1189 aa  346  2e-93  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  28.17 
 
 		 1189 aa  345  2e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2536  chromosome segregation protein SMC  52.3 
 
 		 1170 aa  345  4e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  27.73 
 
 		 1185 aa  344  5e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0955  chromosome segregation protein SMC  41.93 
 
 		 1147 aa  343  2e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.235362  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0900  chromosome segregation protein SMC  30.51 
 
 		 1150 aa  342  2e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.188992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0753  chromosome segregation protein SMC  30.51 
 
 		 1150 aa  341  4e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  25.88 
 
 		 1190 aa  341  4e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  29.83 
 
 		 1167 aa  341  4e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  26.67 
 
 		 1186 aa  339  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  26.27 
 
 		 1188 aa  340  9.999999999999999e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  26.27 
 
 		 1188 aa  340  9.999999999999999e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  26.32 
 
 		 1185 aa  338  1.9999999999999998e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2738  chromosome segregation protein SMC  51.59 
 
 		 1167 aa  335  3e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  27.74 
 
 		 1187 aa  334  7.000000000000001e-90  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6942  chromosome segregation protein SMC  68.13 
 
 		 1144 aa  329  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0702595 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  25.49 
 
 		 1190 aa  325  3e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  25.95 
 
 		 1177 aa  318  4e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  27.96 
 
 		 1179 aa  312  2.9999999999999997e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2270  chromosome segregation protein SMC  56.47 
 
 		 1147 aa  302  2e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0064  SMC domain protein  41.54 
 
 		 1511 aa  295  3e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0434137 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  24.67 
 
 		 1164 aa  282  3e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  26.02 
 
 		 1181 aa  280  1e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  23.12 
 
 		 1180 aa  269  2.9999999999999995e-70  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0399  chromosome segregation protein SMC  55.46 
 
 		 1165 aa  266  2e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.489923  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  28.77 
 
 		 1403 aa  265  3e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  23.06 
 
 		 1153 aa  251  6e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3590  chromosome segregation protein SMC  34.94 
 
 		 1204 aa  229  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968509  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  38.04 
 
 		 1175 aa  227  8e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  47.51 
 
 		 1174 aa  220  8.999999999999998e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  47.51 
 
 		 1174 aa  220  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  52.53 
 
 		 1176 aa  220  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  26.35 
 
 		 1188 aa  219  2e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2516  chromosome segregation protein SMC  50.23 
 
 		 1138 aa  219  2e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0576231  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  50.72 
 
 		 1176 aa  218  5e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  48.86 
 
 		 1199 aa  218  7e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1514  SMC family protein  48.89 
 
 		 1139 aa  218  7e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  48.4 
 
 		 1198 aa  217  8e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  48.86 
 
 		 1199 aa  217  8e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  34.8 
 
 		 1175 aa  215  2.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2952  chromosome segregation protein SMC  47.53 
 
 		 1171 aa  214  7.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0128917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>