More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0955 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2318  condensin subunit Smc  40.17 
 
 		 1154 aa  639    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4983  chromosome segregation protein SMC  40.71 
 
 		 1154 aa  664    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127534  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1066  chromosome segregation protein SMC  40.63 
 
 		 1154 aa  680    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0955  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1147 aa  2184    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.235362  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0374  chromosome segregation protein SMC  41.27 
 
 		 1151 aa  656    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4374  chromosome segregation protein SMC  41.37 
 
 		 1154 aa  677    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.95695  normal  0.0465691 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1194  chromosome segregation protein SMC  40.95 
 
 		 1154 aa  676    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3230  chromosome segregation protein SMC  39.92 
 
 		 1170 aa  637    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0699  chromosome segregation protein SMC  43.08 
 
 		 1153 aa  653    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0613  chromosome segregation protein SMC  41.89 
 
 		 1152 aa  643    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0497  SMC family protein  41.63 
 
 		 1152 aa  633  1e-180  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2608  chromosome segregation protein SMC  39.72 
 
 		 1168 aa  635  1e-180  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.198178  normal  0.335966 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0500  chromosome segregation protein SMC  41.53 
 
 		 1152 aa  632  1e-180  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.169399  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0547  chromosome segregation protein SMC  41.78 
 
 		 1153 aa  620  1e-176  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.725203 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1095  chromosome segregation protein  40.59 
 
 		 1153 aa  617  1e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0716  chromosome segregation protein SMC  42.17 
 
 		 1153 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0657  chromosome segregation protein SMC  41.47 
 
 		 1153 aa  597  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.915586  normal  0.754344 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1981  chromosome segregation protein SMC  41.24 
 
 		 1150 aa  593  1e-168  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0745  chromosome segregation protein SMC  40.82 
 
 		 1150 aa  590  1e-167  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.525394  normal  0.893736 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0163  chromosome segregation protein SMC  41.68 
 
 		 1150 aa  574  1.0000000000000001e-162  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4694  chromosome segregation protein SMC  52.88 
 
 		 1140 aa  537  1e-151  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2270  chromosome segregation protein SMC  64.39 
 
 		 1147 aa  463  1e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  30.34 
 
 		 1169 aa  422  1e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  30.16 
 
 		 1169 aa  415  1e-114  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  29.94 
 
 		 1176 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  31.55 
 
 		 1167 aa  400  1e-109  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1695  chromosome segregation protein SMC  31.79 
 
 		 1170 aa  398  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.573512  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  31.55 
 
 		 1167 aa  398  1e-109  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  31.05 
 
 		 1162 aa  380  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1799  condensin subunit Smc  31.01 
 
 		 1162 aa  378  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0884011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  31.29 
 
 		 1162 aa  380  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  30.82 
 
 		 1167 aa  378  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  31.74 
 
 		 1167 aa  374  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  31.01 
 
 		 1162 aa  373  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  29.16 
 
 		 1168 aa  372  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  28.09 
 
 		 1164 aa  367  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2587  chromosome segregation protein SMC  40.76 
 
 		 1151 aa  362  2e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000427179 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  31.77 
 
 		 1164 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0768  condensin subunit Smc  41.1 
 
 		 1152 aa  346  2e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2738  chromosome segregation protein SMC  41.23 
 
 		 1167 aa  335  4e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3248  condensin subunit Smc  48.6 
 
 		 1167 aa  313  1e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  31.32 
 
 		 1187 aa  311  5.9999999999999995e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0399  chromosome segregation protein SMC  38.53 
 
 		 1165 aa  306  1.0000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.489923  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7655  chromosome segregation protein SMC  68.22 
 
 		 1148 aa  301  4e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00190533  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3824  chromosome segregation protein SMC  58.01 
 
 		 1151 aa  299  2e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0542546 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0064  SMC domain protein  44.47 
 
 		 1511 aa  293  9e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0434137 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0144  chromosome segregation protein SMC  66.03 
 
 		 1170 aa  288  4e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0876  chromosome segregation protein SMC2  66.02 
 
 		 1151 aa  285  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.601564  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2536  chromosome segregation protein SMC  66.02 
 
 		 1170 aa  285  5.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6942  chromosome segregation protein SMC  69.16 
 
 		 1144 aa  284  8.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0702595 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4373  chromosome segregation protein SMC  60.42 
 
 		 1153 aa  280  1e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.991905 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2199  condensin subunit Smc  46.1 
 
 		 1148 aa  275  4.0000000000000004e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.53129 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1457  chromosome segregation protein SMC  49.07 
 
 		 1173 aa  226  3e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3590  chromosome segregation protein SMC  34.04 
 
 		 1204 aa  222  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968509  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1814  chromosome segregation protein SMC  50 
 
 		 1181 aa  220  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2952  chromosome segregation protein SMC  50.46 
 
 		 1171 aa  219  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0128917  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1228  condensin subunit Smc  50 
 
 		 1165 aa  218  4e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0679  chromosome segregation protein SMC  48.39 
 
 		 1168 aa  218  5.9999999999999996e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0501  chromosome segregation protein SMC  47.25 
 
 		 1152 aa  218  7e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  49.54 
 
 		 1175 aa  216  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1401  condensin subunit Smc  47.39 
 
 		 1168 aa  217  9.999999999999999e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.934786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  49.08 
 
 		 1182 aa  217  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  48.56 
 
 		 1171 aa  216  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  26.86 
 
 		 1190 aa  216  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  49.77 
 
 		 1164 aa  216  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1563  chromosome segregation protein SMC  52.53 
 
 		 1170 aa  216  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.438222  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3246  chromosome segregation protein SMC  52.53 
 
 		 1170 aa  216  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.318712  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  52.53 
 
 		 1268 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2502  chromosome segregation protein SMC  52.53 
 
 		 1170 aa  216  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.240456  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  48.56 
 
 		 1171 aa  215  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2065  chromosome segregation protein SMC  52.53 
 
 		 1200 aa  216  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2446  chromosome segregation protein SMC  52.53 
 
 		 1170 aa  216  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.889983  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1337  chromosome segregation protein SMC  52.53 
 
 		 1202 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  47.01 
 
 		 1176 aa  215  4.9999999999999996e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1270  chromosome segregation protein SMC  48.56 
 
 		 1171 aa  214  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845906  normal  0.0711674 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1334  chromosome segregation protein SMC  48.56 
 
 		 1171 aa  214  7e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0218063  normal  0.637516 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  48.9 
 
 		 1175 aa  214  7e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  48.85 
 
 		 1174 aa  214  7.999999999999999e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  48.85 
 
 		 1174 aa  214  7.999999999999999e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2059  chromosome segregation protein SMC  51.52 
 
 		 1142 aa  214  7.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.365444  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2516  chromosome segregation protein SMC  48.84 
 
 		 1138 aa  214  9e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0576231  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1928  chromosome segregation protein SMC  51.52 
 
 		 1170 aa  214  9e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.5125  normal  0.122807 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1250  chromosome segregation protein SMC  51.52 
 
 		 1206 aa  213  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  47.71 
 
 		 1175 aa  213  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5336  chromosome segregation protein SMC  51.01 
 
 		 1170 aa  212  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.119827 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  31.75 
 
 		 1190 aa  212  3e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6051  chromosome segregation protein SMC  51.01 
 
 		 1170 aa  212  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2046  chromosome segregation protein SMC  51.01 
 
 		 1170 aa  212  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.884019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2026  chromosome segregation protein SMC  51.01 
 
 		 1170 aa  212  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.676203  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  43.61 
 
 		 1199 aa  211  5e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  43.61 
 
 		 1199 aa  211  5e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1703  chromosome segregation protein SMC  39.16 
 
 		 1138 aa  211  5e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00557127  hitchhiker  0.00000000707845 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4276  chromosome segregation protein SMC  36.34 
 
 		 1162 aa  211  6e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1592  chromosome segregation protein SMC  36.34 
 
 		 1162 aa  211  6e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.843365  normal  0.195769 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2681  chromosome segregation protein SMC  39.16 
 
 		 1138 aa  211  6e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000886702  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  50.25 
 
 		 1176 aa  211  7e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2760  chromosome segregation protein SMC  39.16 
 
 		 1138 aa  211  7e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.494661  unclonable  0.00000956134 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2656  chromosome segregation protein SMC  39.16 
 
 		 1138 aa  211  7e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000574242  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  39.05 
 
 		 1301 aa  211  8e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  33.93 
 
 		 1175 aa  211  9e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>