More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4373 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0497  SMC family protein  47.59 
 
 		 1152 aa  831    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0547  chromosome segregation protein SMC  44.57 
 
 		 1153 aa  773    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.725203 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4983  chromosome segregation protein SMC  45.41 
 
 		 1154 aa  797    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127534  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2608  chromosome segregation protein SMC  45.28 
 
 		 1168 aa  779    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.198178  normal  0.335966 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1095  chromosome segregation protein  44.94 
 
 		 1153 aa  783    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3248  condensin subunit Smc  45.58 
 
 		 1167 aa  714    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1066  chromosome segregation protein SMC  45.11 
 
 		 1154 aa  812    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0374  chromosome segregation protein SMC  45.5 
 
 		 1151 aa  806    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4374  chromosome segregation protein SMC  44.98 
 
 		 1154 aa  801    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.95695  normal  0.0465691 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0657  chromosome segregation protein SMC  46 
 
 		 1153 aa  797    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.915586  normal  0.754344 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1194  chromosome segregation protein SMC  44.6 
 
 		 1154 aa  805    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0699  chromosome segregation protein SMC  46.6 
 
 		 1153 aa  813    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3230  chromosome segregation protein SMC  44.59 
 
 		 1170 aa  764    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2318  condensin subunit Smc  44.76 
 
 		 1154 aa  801    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2587  chromosome segregation protein SMC  45.32 
 
 		 1151 aa  793    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000427179 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4373  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1153 aa  2216    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.991905 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1981  chromosome segregation protein SMC  45.48 
 
 		 1150 aa  704    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2199  condensin subunit Smc  48.62 
 
 		 1148 aa  810    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.53129 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0745  chromosome segregation protein SMC  43.94 
 
 		 1150 aa  756    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.525394  normal  0.893736 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3824  chromosome segregation protein SMC  45.92 
 
 		 1151 aa  780    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0542546 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0163  chromosome segregation protein SMC  46.64 
 
 		 1150 aa  745    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0500  chromosome segregation protein SMC  47.75 
 
 		 1152 aa  835    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.169399  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0613  chromosome segregation protein SMC  46.43 
 
 		 1152 aa  817    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0716  chromosome segregation protein SMC  45.79 
 
 		 1153 aa  793    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  29.25 
 
 		 1176 aa  387  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  31.06 
 
 		 1175 aa  386  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  30.06 
 
 		 1177 aa  379  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  32.36 
 
 		 1171 aa  379  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  30.37 
 
 		 1176 aa  377  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  31.72 
 
 		 1171 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  29.84 
 
 		 1176 aa  373  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  28.29 
 
 		 1187 aa  372  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0161  chromosome segregation protein SMC  32.59 
 
 		 1167 aa  369  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0768  condensin subunit Smc  56.32 
 
 		 1152 aa  369  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  30.39 
 
 		 1163 aa  364  6e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  29.7 
 
 		 1168 aa  363  1e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  32.06 
 
 		 1164 aa  359  9.999999999999999e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  32.03 
 
 		 1162 aa  358  1.9999999999999998e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0144  chromosome segregation protein SMC  55.27 
 
 		 1170 aa  353  7e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  30.64 
 
 		 1167 aa  351  4e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  30.92 
 
 		 1187 aa  351  6e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0876  chromosome segregation protein SMC2  55.14 
 
 		 1151 aa  350  9e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.601564  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2536  chromosome segregation protein SMC  55.14 
 
 		 1170 aa  348  4e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7655  chromosome segregation protein SMC  56.7 
 
 		 1148 aa  347  8e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00190533  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  26.83 
 
 		 1189 aa  345  2e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  27.04 
 
 		 1189 aa  345  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  26.29 
 
 		 1188 aa  345  2.9999999999999997e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  26.29 
 
 		 1188 aa  345  2.9999999999999997e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  26.43 
 
 		 1191 aa  343  2e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  26.95 
 
 		 1189 aa  341  5e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  26.95 
 
 		 1189 aa  341  5e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  26.87 
 
 		 1189 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  26.79 
 
 		 1189 aa  337  5.999999999999999e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  26.87 
 
 		 1189 aa  336  1e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  26.87 
 
 		 1189 aa  336  1e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  26.91 
 
 		 1189 aa  337  1e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  26.56 
 
 		 1189 aa  335  3e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  26.77 
 
 		 1148 aa  332  4e-89  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2738  chromosome segregation protein SMC  54.96 
 
 		 1167 aa  328  5e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  25.89 
 
 		 1186 aa  324  7e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  26.83 
 
 		 1177 aa  319  1e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6942  chromosome segregation protein SMC  74.62 
 
 		 1144 aa  318  4e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0702595 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  24.59 
 
 		 1185 aa  313  1e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  30.13 
 
 		 1179 aa  313  1e-83  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  26.34 
 
 		 1179 aa  310  1.0000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  26.45 
 
 		 1191 aa  302  3e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4694  chromosome segregation protein SMC  64.89 
 
 		 1140 aa  298  5e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0955  chromosome segregation protein SMC  55.33 
 
 		 1147 aa  288  4e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.235362  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2270  chromosome segregation protein SMC  58.85 
 
 		 1147 aa  288  4e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0064  SMC domain protein  42.22 
 
 		 1511 aa  276  1.0000000000000001e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0434137 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0399  chromosome segregation protein SMC  56.03 
 
 		 1165 aa  275  3e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.489923  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  24.96 
 
 		 1181 aa  262  4e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  42.47 
 
 		 1171 aa  209  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2514  chromosome segregation protein SMC  37.8 
 
 		 1170 aa  209  3e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0530303 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1457  chromosome segregation protein SMC  30.27 
 
 		 1173 aa  208  5e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2952  chromosome segregation protein SMC  41.9 
 
 		 1171 aa  206  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0128917  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1228  condensin subunit Smc  44.32 
 
 		 1165 aa  206  2e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  42.62 
 
 		 1162 aa  205  5e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  50.25 
 
 		 1199 aa  204  7e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  42.62 
 
 		 1162 aa  204  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  42.62 
 
 		 1162 aa  203  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  50.25 
 
 		 1199 aa  203  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  50.25 
 
 		 1199 aa  203  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  34.31 
 
 		 1195 aa  202  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  41.32 
 
 		 1162 aa  202  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3840  chromosome segregation protein SMC  42.19 
 
 		 1162 aa  202  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509302 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1799  condensin subunit Smc  40.16 
 
 		 1162 aa  202  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0884011  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  41.77 
 
 		 1162 aa  202  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3602  chromosome segregation protein SMC  42.62 
 
 		 1162 aa  202  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111779  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4276  chromosome segregation protein SMC  40.56 
 
 		 1162 aa  201  5e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  39.21 
 
 		 1182 aa  201  5e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1592  chromosome segregation protein SMC  40.56 
 
 		 1162 aa  201  5e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.843365  normal  0.195769 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  43.81 
 
 		 1167 aa  201  5e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  43.17 
 
 		 1167 aa  201  9e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  43.17 
 
 		 1167 aa  201  9e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1401  condensin subunit Smc  39.52 
 
 		 1168 aa  200  1.0000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.934786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1933  condensin subunit Smc  43.81 
 
 		 1195 aa  199  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00525455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1999  condensin subunit Smc  43.81 
 
 		 1195 aa  200  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1953  condensin subunit Smc  43.81 
 
 		 1195 aa  200  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  33.62 
 
 		 1175 aa  199  3e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>