More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0064 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0064  SMC domain protein  100 
 
 		 1511 aa  2850    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0434137 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0399  chromosome segregation protein SMC  61.02 
 
 		 1165 aa  388  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.489923  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3248  condensin subunit Smc  51.65 
 
 		 1167 aa  316  1.9999999999999998e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1194  chromosome segregation protein SMC  40.49 
 
 		 1154 aa  309  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0500  chromosome segregation protein SMC  43.69 
 
 		 1152 aa  308  6e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.169399  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2587  chromosome segregation protein SMC  42.58 
 
 		 1151 aa  306  2.0000000000000002e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000427179 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1066  chromosome segregation protein SMC  41.74 
 
 		 1154 aa  306  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0497  SMC family protein  43.47 
 
 		 1152 aa  305  4.0000000000000003e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4374  chromosome segregation protein SMC  44.5 
 
 		 1154 aa  305  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.95695  normal  0.0465691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2318  condensin subunit Smc  44.71 
 
 		 1154 aa  305  5.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0768  condensin subunit Smc  47.75 
 
 		 1152 aa  303  1e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0374  chromosome segregation protein SMC  49.86 
 
 		 1151 aa  303  2e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4983  chromosome segregation protein SMC  41.56 
 
 		 1154 aa  303  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127534  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3824  chromosome segregation protein SMC  46.93 
 
 		 1151 aa  297  1e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0542546 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0613  chromosome segregation protein SMC  42.69 
 
 		 1152 aa  297  1e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3230  chromosome segregation protein SMC  43.36 
 
 		 1170 aa  296  3e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0163  chromosome segregation protein SMC  44.04 
 
 		 1150 aa  295  4e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0699  chromosome segregation protein SMC  64.15 
 
 		 1153 aa  295  5e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2608  chromosome segregation protein SMC  41.21 
 
 		 1168 aa  295  6e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.198178  normal  0.335966 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4694  chromosome segregation protein SMC  60.52 
 
 		 1140 aa  295  7e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0716  chromosome segregation protein SMC  40.94 
 
 		 1153 aa  291  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0547  chromosome segregation protein SMC  43.02 
 
 		 1153 aa  291  6e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.725203 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0144  chromosome segregation protein SMC  48.58 
 
 		 1170 aa  289  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1981  chromosome segregation protein SMC  53.21 
 
 		 1150 aa  287  9e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0876  chromosome segregation protein SMC2  57.87 
 
 		 1151 aa  285  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.601564  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0657  chromosome segregation protein SMC  40.96 
 
 		 1153 aa  285  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.915586  normal  0.754344 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2536  chromosome segregation protein SMC  57.87 
 
 		 1170 aa  285  6.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0955  chromosome segregation protein SMC  57.45 
 
 		 1147 aa  283  1e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.235362  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2738  chromosome segregation protein SMC  57.66 
 
 		 1167 aa  282  3e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1095  chromosome segregation protein  44.99 
 
 		 1153 aa  281  5e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2270  chromosome segregation protein SMC  65.53 
 
 		 1147 aa  281  6e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2199  condensin subunit Smc  55.93 
 
 		 1148 aa  274  1e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.53129 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4373  chromosome segregation protein SMC  54.43 
 
 		 1153 aa  271  5.9999999999999995e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.991905 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7655  chromosome segregation protein SMC  61.72 
 
 		 1148 aa  270  1e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00190533  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0745  chromosome segregation protein SMC  55.22 
 
 		 1150 aa  264  8.999999999999999e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.525394  normal  0.893736 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6942  chromosome segregation protein SMC  58.47 
 
 		 1144 aa  256  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0702595 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1401  condensin subunit Smc  43.79 
 
 		 1168 aa  224  9.999999999999999e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.934786  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  45.58 
 
 		 1175 aa  223  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  43.51 
 
 		 1204 aa  221  7.999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  42.86 
 
 		 1177 aa  220  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  42.92 
 
 		 1176 aa  220  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1703  chromosome segregation protein SMC  43.43 
 
 		 1138 aa  219  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00557127  hitchhiker  0.00000000707845 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2366  chromosome segregation protein SMC  42.91 
 
 		 1145 aa  219  4e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00122996  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  42.79 
 
 		 1176 aa  219  4e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2760  chromosome segregation protein SMC  43.43 
 
 		 1138 aa  219  4e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.494661  unclonable  0.00000956134 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2656  chromosome segregation protein SMC  43.43 
 
 		 1138 aa  219  4e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000574242  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2681  chromosome segregation protein SMC  43.43 
 
 		 1138 aa  218  5e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000886702  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  44.08 
 
 		 1169 aa  218  8e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  50.99 
 
 		 1176 aa  218  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  34.62 
 
 		 1177 aa  218  9.999999999999999e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1514  SMC family protein  43.8 
 
 		 1139 aa  217  9.999999999999999e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  50.99 
 
 		 1176 aa  217  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  28.11 
 
 		 1190 aa  217  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  42.98 
 
 		 1176 aa  216  2.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  41.19 
 
 		 1199 aa  216  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  43.67 
 
 		 1169 aa  216  3.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2898  SMC family protein  42.91 
 
 		 1145 aa  214  7e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  41.19 
 
 		 1199 aa  214  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  40.62 
 
 		 1199 aa  214  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  43.04 
 
 		 1187 aa  214  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1506  chromosome segregation protein SMC  45.85 
 
 		 1142 aa  214  1e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00012681  hitchhiker  0.00000000387349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1567  chromosome segregation protein SMC  45.85 
 
 		 1142 aa  214  1e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218486  hitchhiker  0.0000000844837 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1573  chromosome segregation protein SMC  45.85 
 
 		 1142 aa  213  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00374514  hitchhiker  0.000804403 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  33.81 
 
 		 1174 aa  213  2e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  44.72 
 
 		 1168 aa  212  4e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  28.31 
 
 		 1190 aa  212  4e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  29.53 
 
 		 1191 aa  212  4e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  48.83 
 
 		 1198 aa  212  5e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2463  chromosome segregation protein SMC  49.27 
 
 		 1144 aa  211  7e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000141924  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  43.56 
 
 		 1164 aa  211  8e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  44.49 
 
 		 1190 aa  211  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  33.08 
 
 		 1179 aa  210  1e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1736  chromosome segregation protein SMC  42.08 
 
 		 814 aa  211  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00195971  unclonable  0.00000000014199 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  31.35 
 
 		 1177 aa  209  3e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  42.19 
 
 		 1185 aa  209  4e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0753  chromosome segregation protein SMC  47.95 
 
 		 1150 aa  208  5e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0900  chromosome segregation protein SMC  47.95 
 
 		 1150 aa  208  5e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.188992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2192  chromosome segregation protein SMC  46.4 
 
 		 1234 aa  207  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  42.26 
 
 		 1173 aa  207  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2379  chromosome segregation protein SMC  42.08 
 
 		 1141 aa  207  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.882333  unclonable  0.00000367062 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2440  chromosome segregation SMC protein  40.25 
 
 		 1109 aa  206  2e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129774  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  44.86 
 
 		 1189 aa  206  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  47.91 
 
 		 1164 aa  207  2e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  41.77 
 
 		 1185 aa  207  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2059  chromosome segregation protein SMC  46.32 
 
 		 1142 aa  205  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.365444  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2046  chromosome segregation protein SMC  46.32 
 
 		 1170 aa  205  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.884019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1928  chromosome segregation protein SMC  46.32 
 
 		 1170 aa  205  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.5125  normal  0.122807 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6051  chromosome segregation protein SMC  46.32 
 
 		 1170 aa  205  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2026  chromosome segregation protein SMC  46.32 
 
 		 1170 aa  205  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.676203  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5336  chromosome segregation protein SMC  46.32 
 
 		 1170 aa  205  7e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.119827 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  42.11 
 
 		 1164 aa  204  8e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1732  chromosome segregation protein SMC  45.37 
 
 		 1167 aa  204  9e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2019  chromosome segregation protein SMC  46.32 
 
 		 1170 aa  204  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2516  chromosome segregation protein SMC  44.16 
 
 		 1138 aa  204  9.999999999999999e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0576231  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1687  chromosome segregation protein SMC  44.5 
 
 		 1140 aa  204  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0207263  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1563  chromosome segregation protein SMC  46.29 
 
 		 1170 aa  203  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.438222  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1337  chromosome segregation protein SMC  46.29 
 
 		 1202 aa  203  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2065  chromosome segregation protein SMC  46.29 
 
 		 1200 aa  203  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2502  chromosome segregation protein SMC  46.29 
 
 		 1170 aa  203  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.240456  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3246  chromosome segregation protein SMC  46.29 
 
 		 1170 aa  203  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.318712  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>