More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3230 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009505  BOV_0500  chromosome segregation protein SMC  51.29 
 
 		 1152 aa  1009    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.169399  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3824  chromosome segregation protein SMC  53.44 
 
 		 1151 aa  1025    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0542546 
 
 
-
 
NC_004310  BR0497  SMC family protein  51.12 
 
 		 1152 aa  1005    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4983  chromosome segregation protein SMC  76.2 
 
 		 1154 aa  1627    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127534  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1981  chromosome segregation protein SMC  56.36 
 
 		 1150 aa  998    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0745  chromosome segregation protein SMC  48.97 
 
 		 1150 aa  916    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.525394  normal  0.893736 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2608  chromosome segregation protein SMC  91.87 
 
 		 1168 aa  1964    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.198178  normal  0.335966 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2318  condensin subunit Smc  75.77 
 
 		 1154 aa  1639    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3248  condensin subunit Smc  44.28 
 
 		 1167 aa  742    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1066  chromosome segregation protein SMC  77.05 
 
 		 1154 aa  1682    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0374  chromosome segregation protein SMC  44.25 
 
 		 1151 aa  787    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4374  chromosome segregation protein SMC  78.6 
 
 		 1154 aa  1708    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.95695  normal  0.0465691 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0657  chromosome segregation protein SMC  50.34 
 
 		 1153 aa  982    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.915586  normal  0.754344 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1095  chromosome segregation protein  51.25 
 
 		 1153 aa  1019    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1194  chromosome segregation protein SMC  78.25 
 
 		 1154 aa  1687    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3230  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1170 aa  2302    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0768  condensin subunit Smc  51.46 
 
 		 1152 aa  948    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0699  chromosome segregation protein SMC  50.3 
 
 		 1153 aa  975    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0613  chromosome segregation protein SMC  50.52 
 
 		 1152 aa  991    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0163  chromosome segregation protein SMC  44.4 
 
 		 1150 aa  732    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0716  chromosome segregation protein SMC  51.11 
 
 		 1153 aa  1009    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0547  chromosome segregation protein SMC  49.7 
 
 		 1153 aa  974    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.725203 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4694  chromosome segregation protein SMC  46.25 
 
 		 1140 aa  445  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2199  condensin subunit Smc  43.07 
 
 		 1148 aa  429  1e-118  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.53129 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1506  chromosome segregation protein SMC  31.14 
 
 		 1142 aa  396  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00012681  hitchhiker  0.00000000387349 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  30.61 
 
 		 1173 aa  393  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1573  chromosome segregation protein SMC  30.85 
 
 		 1142 aa  392  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00374514  hitchhiker  0.000804403 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1567  chromosome segregation protein SMC  30.03 
 
 		 1142 aa  392  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218486  hitchhiker  0.0000000844837 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1703  chromosome segregation protein SMC  29.27 
 
 		 1138 aa  389  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00557127  hitchhiker  0.00000000707845 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  30.29 
 
 		 1164 aa  377  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0144  chromosome segregation protein SMC  57.18 
 
 		 1170 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2587  chromosome segregation protein SMC  57.1 
 
 		 1151 aa  371  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000427179 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0876  chromosome segregation protein SMC2  56.9 
 
 		 1151 aa  368  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.601564  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  27.05 
 
 		 1185 aa  364  4e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2536  chromosome segregation protein SMC  56.32 
 
 		 1170 aa  363  7.0000000000000005e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1687  chromosome segregation protein SMC  27.81 
 
 		 1140 aa  361  4e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0207263  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  30.53 
 
 		 1167 aa  361  4e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7655  chromosome segregation protein SMC  61.37 
 
 		 1148 aa  360  9.999999999999999e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00190533  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  27.41 
 
 		 1189 aa  360  9.999999999999999e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  27.68 
 
 		 1185 aa  358  3.9999999999999996e-97  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  26.78 
 
 		 1191 aa  358  5e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  29.33 
 
 		 1167 aa  354  5.9999999999999994e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  27.85 
 
 		 1189 aa  351  5e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  26.51 
 
 		 1190 aa  350  7e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  26.93 
 
 		 1186 aa  350  7e-95  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  27.77 
 
 		 1189 aa  350  8e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4373  chromosome segregation protein SMC  53.72 
 
 		 1153 aa  350  9e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.991905 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  26.95 
 
 		 1189 aa  350  1e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  28.08 
 
 		 1189 aa  348  2e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  27.65 
 
 		 1189 aa  349  2e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  26.66 
 
 		 1188 aa  348  2e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  28.08 
 
 		 1189 aa  348  2e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  26.66 
 
 		 1188 aa  348  2e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  27.46 
 
 		 1177 aa  345  2.9999999999999997e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0900  chromosome segregation protein SMC  29.97 
 
 		 1150 aa  344  5.999999999999999e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.188992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0753  chromosome segregation protein SMC  29.97 
 
 		 1150 aa  343  1e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2738  chromosome segregation protein SMC  55.52 
 
 		 1167 aa  334  6e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  25.2 
 
 		 1190 aa  330  1.0000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6942  chromosome segregation protein SMC  66.93 
 
 		 1144 aa  322  3e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0702595 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  27.8 
 
 		 1179 aa  313  1e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0955  chromosome segregation protein SMC  48.41 
 
 		 1147 aa  311  6.999999999999999e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.235362  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  27.44 
 
 		 1181 aa  300  1e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0064  SMC domain protein  41.24 
 
 		 1511 aa  297  9e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0434137 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2270  chromosome segregation protein SMC  64.49 
 
 		 1147 aa  296  1e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  25.71 
 
 		 1164 aa  295  3e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  29.74 
 
 		 1403 aa  291  4e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  28.51 
 
 		 1179 aa  290  8e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  22.23 
 
 		 1180 aa  280  1e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0399  chromosome segregation protein SMC  56.47 
 
 		 1165 aa  277  7e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.489923  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1514  SMC family protein  50 
 
 		 1139 aa  226  3e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  46.25 
 
 		 1195 aa  222  3e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  37.35 
 
 		 1175 aa  221  5e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  52.02 
 
 		 1176 aa  221  8.999999999999998e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  52.53 
 
 		 1176 aa  220  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2463  chromosome segregation protein SMC  51.39 
 
 		 1144 aa  219  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000141924  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  36.87 
 
 		 1175 aa  219  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1814  chromosome segregation protein SMC  45.31 
 
 		 1181 aa  216  2.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2952  chromosome segregation protein SMC  45.87 
 
 		 1171 aa  214  7e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0128917  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  47.25 
 
 		 1174 aa  214  9e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  49.53 
 
 		 1164 aa  213  1e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  47.25 
 
 		 1174 aa  213  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  27.11 
 
 		 1301 aa  213  1e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  49.53 
 
 		 1164 aa  213  2e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  47.73 
 
 		 1199 aa  213  2e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  47.73 
 
 		 1199 aa  213  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  47.73 
 
 		 1199 aa  213  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  46.22 
 
 		 1198 aa  213  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0651  SMC domain-containing protein  22.92 
 
 		 1174 aa  212  3e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.721251 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  27.38 
 
 		 1185 aa  211  8e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1736  chromosome segregation protein SMC  48.39 
 
 		 814 aa  210  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00195971  unclonable  0.00000000014199 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  30.32 
 
 		 1167 aa  209  2e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1228  condensin subunit Smc  32.97 
 
 		 1165 aa  210  2e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2514  chromosome segregation protein SMC  43.83 
 
 		 1170 aa  209  3e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0530303 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  47.51 
 
 		 1164 aa  209  3e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  30.17 
 
 		 1167 aa  208  4e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  47.2 
 
 		 1168 aa  207  9e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  51.63 
 
 		 1185 aa  207  1e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6051  chromosome segregation protein SMC  45.15 
 
 		 1170 aa  206  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2046  chromosome segregation protein SMC  45.15 
 
 		 1170 aa  206  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.884019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2026  chromosome segregation protein SMC  45.15 
 
 		 1170 aa  206  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.676203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>