More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2536 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0497  SMC family protein  46.96 
 
 		 1152 aa  819    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4983  chromosome segregation protein SMC  45.72 
 
 		 1154 aa  778    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127534  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2608  chromosome segregation protein SMC  45.16 
 
 		 1168 aa  767    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.198178  normal  0.335966 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0745  chromosome segregation protein SMC  43.71 
 
 		 1150 aa  719    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.525394  normal  0.893736 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0876  chromosome segregation protein SMC2  99.22 
 
 		 1151 aa  2179    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.601564  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0547  chromosome segregation protein SMC  46.5 
 
 		 1153 aa  773    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.725203 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3248  condensin subunit Smc  46.73 
 
 		 1167 aa  717    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1095  chromosome segregation protein  47.02 
 
 		 1153 aa  793    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2318  condensin subunit Smc  46.83 
 
 		 1154 aa  785    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1066  chromosome segregation protein SMC  45.64 
 
 		 1154 aa  799    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0374  chromosome segregation protein SMC  63.34 
 
 		 1151 aa  1300    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4374  chromosome segregation protein SMC  45.15 
 
 		 1154 aa  778    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.95695  normal  0.0465691 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1194  chromosome segregation protein SMC  45.22 
 
 		 1154 aa  783    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0500  chromosome segregation protein SMC  47.7 
 
 		 1152 aa  822    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.169399  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2587  chromosome segregation protein SMC  68.11 
 
 		 1151 aa  1442    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000427179 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0716  chromosome segregation protein SMC  46.87 
 
 		 1153 aa  788    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2536  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1170 aa  2238    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0613  chromosome segregation protein SMC  46.93 
 
 		 1152 aa  822    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0699  chromosome segregation protein SMC  49.45 
 
 		 1153 aa  872    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0657  chromosome segregation protein SMC  46.47 
 
 		 1153 aa  776    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.915586  normal  0.754344 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3824  chromosome segregation protein SMC  48.07 
 
 		 1151 aa  766    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0542546 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0163  chromosome segregation protein SMC  68.49 
 
 		 1150 aa  1270    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0144  chromosome segregation protein SMC  94.53 
 
 		 1170 aa  1845    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2738  chromosome segregation protein SMC  69.86 
 
 		 1167 aa  493  1e-137  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1981  chromosome segregation protein SMC  49.12 
 
 		 1150 aa  450  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3230  chromosome segregation protein SMC  47.81 
 
 		 1170 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  33.15 
 
 		 1198 aa  409  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  31.76 
 
 		 1171 aa  406  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  33.14 
 
 		 1268 aa  399  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  30.93 
 
 		 1168 aa  395  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0161  chromosome segregation protein SMC  32.98 
 
 		 1167 aa  392  1e-107  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1346  chromosome segregation protein SMC  32.58 
 
 		 1172 aa  388  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.333304  normal  0.300514 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  33.12 
 
 		 1162 aa  389  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  31.9 
 
 		 1167 aa  389  1e-106  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  31.97 
 
 		 1167 aa  388  1e-106  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  29.53 
 
 		 1164 aa  384  1e-105  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  31.78 
 
 		 1167 aa  380  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  30.76 
 
 		 1162 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  29.35 
 
 		 1187 aa  378  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  32.5 
 
 		 1199 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  32.58 
 
 		 1199 aa  378  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4694  chromosome segregation protein SMC  43.07 
 
 		 1140 aa  368  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0768  condensin subunit Smc  56.27 
 
 		 1152 aa  369  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  28.9 
 
 		 1189 aa  365  4e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  32.72 
 
 		 1164 aa  357  5e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  26.73 
 
 		 1185 aa  350  1e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4373  chromosome segregation protein SMC  55.14 
 
 		 1153 aa  347  1e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.991905 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  28.1 
 
 		 1186 aa  343  8e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  28.65 
 
 		 1177 aa  326  2e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7655  chromosome segregation protein SMC  53.72 
 
 		 1148 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00190533  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2199  condensin subunit Smc  51.38 
 
 		 1148 aa  298  3e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.53129 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0064  SMC domain protein  45.96 
 
 		 1511 aa  293  9e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0434137 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2270  chromosome segregation protein SMC  57.76 
 
 		 1147 aa  293  1e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0955  chromosome segregation protein SMC  50.13 
 
 		 1147 aa  291  3e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.235362  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  30.45 
 
 		 1403 aa  289  2.9999999999999996e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6942  chromosome segregation protein SMC  62.5 
 
 		 1144 aa  288  4e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0702595 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0399  chromosome segregation protein SMC  53.02 
 
 		 1165 aa  256  2.0000000000000002e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.489923  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1814  chromosome segregation protein SMC  40.98 
 
 		 1181 aa  228  7e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  40 
 
 		 1176 aa  222  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  49.07 
 
 		 1190 aa  218  4e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  49.76 
 
 		 1198 aa  217  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  38.59 
 
 		 1195 aa  216  2.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1880  chromosome segregation protein SMC  48.85 
 
 		 1165 aa  215  3.9999999999999995e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2952  chromosome segregation protein SMC  43.98 
 
 		 1171 aa  215  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0128917  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  41.11 
 
 		 1175 aa  213  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  38.56 
 
 		 1169 aa  213  1e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  49.76 
 
 		 1177 aa  213  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  38.56 
 
 		 1169 aa  213  1e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  39.53 
 
 		 1176 aa  213  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  33.39 
 
 		 1182 aa  213  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1506  chromosome segregation protein SMC  48.84 
 
 		 1142 aa  213  2e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00012681  hitchhiker  0.00000000387349 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  43.59 
 
 		 1176 aa  213  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0679  chromosome segregation protein SMC  37.65 
 
 		 1168 aa  212  3e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1567  chromosome segregation protein SMC  48.84 
 
 		 1142 aa  212  3e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218486  hitchhiker  0.0000000844837 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  35.61 
 
 		 1199 aa  211  5e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  49.77 
 
 		 1187 aa  211  5e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1573  chromosome segregation protein SMC  48.84 
 
 		 1142 aa  211  5e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00374514  hitchhiker  0.000804403 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  43.37 
 
 		 1171 aa  210  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1736  chromosome segregation protein SMC  37.61 
 
 		 814 aa  210  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00195971  unclonable  0.00000000014199 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2366  chromosome segregation protein SMC  47.47 
 
 		 1145 aa  209  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00122996  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  46.44 
 
 		 1198 aa  208  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1250  chromosome segregation protein SMC  45.92 
 
 		 1206 aa  208  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  41.5 
 
 		 1174 aa  207  8e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  41.5 
 
 		 1174 aa  207  8e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3602  chromosome segregation protein SMC  43.15 
 
 		 1162 aa  207  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2065  chromosome segregation protein SMC  45.49 
 
 		 1200 aa  207  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  42.21 
 
 		 1191 aa  207  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  44.8 
 
 		 1175 aa  207  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1337  chromosome segregation protein SMC  45.49 
 
 		 1202 aa  207  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  43.39 
 
 		 1171 aa  206  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  43.7 
 
 		 1162 aa  206  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3590  chromosome segregation protein SMC  39.56 
 
 		 1204 aa  206  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968509  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  35.76 
 
 		 1163 aa  206  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1592  chromosome segregation protein SMC  43.15 
 
 		 1162 aa  205  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.843365  normal  0.195769 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1695  chromosome segregation protein SMC  43.28 
 
 		 1170 aa  205  4e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.573512  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4276  chromosome segregation protein SMC  43.15 
 
 		 1162 aa  204  6e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  42.31 
 
 		 1176 aa  204  7e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  45.87 
 
 		 1175 aa  204  7e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  42.31 
 
 		 1176 aa  204  7e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2446  chromosome segregation protein SMC  45.22 
 
 		 1170 aa  204  8e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.889983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>