More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0745 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1095  chromosome segregation protein  48.81 
 
 		 1153 aa  891    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0497  SMC family protein  49.05 
 
 		 1152 aa  924    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0716  chromosome segregation protein SMC  49.62 
 
 		 1153 aa  923    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0745  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1150 aa  2268    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.525394  normal  0.893736 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0613  chromosome segregation protein SMC  50.13 
 
 		 1152 aa  936    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1981  chromosome segregation protein SMC  53.26 
 
 		 1150 aa  916    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2318  condensin subunit Smc  50.17 
 
 		 1154 aa  956    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2608  chromosome segregation protein SMC  48.89 
 
 		 1168 aa  914    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.198178  normal  0.335966 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0657  chromosome segregation protein SMC  49.87 
 
 		 1153 aa  914    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.915586  normal  0.754344 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0163  chromosome segregation protein SMC  43.62 
 
 		 1150 aa  692    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0547  chromosome segregation protein SMC  50.13 
 
 		 1153 aa  911    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.725203 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1066  chromosome segregation protein SMC  49.44 
 
 		 1154 aa  930    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0374  chromosome segregation protein SMC  43.42 
 
 		 1151 aa  753    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4374  chromosome segregation protein SMC  49.7 
 
 		 1154 aa  931    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.95695  normal  0.0465691 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1194  chromosome segregation protein SMC  50.34 
 
 		 1154 aa  949    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3230  chromosome segregation protein SMC  48.89 
 
 		 1170 aa  901    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0500  chromosome segregation protein SMC  49.13 
 
 		 1152 aa  928    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.169399  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2587  chromosome segregation protein SMC  42.44 
 
 		 1151 aa  746    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000427179 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4983  chromosome segregation protein SMC  49.7 
 
 		 1154 aa  934    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127534  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0768  condensin subunit Smc  50.35 
 
 		 1152 aa  869    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3824  chromosome segregation protein SMC  60.12 
 
 		 1151 aa  1157    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0542546 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0699  chromosome segregation protein SMC  48.43 
 
 		 1153 aa  889    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2199  condensin subunit Smc  42.66 
 
 		 1148 aa  420  1e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.53129 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1457  chromosome segregation protein SMC  30.58 
 
 		 1173 aa  385  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4373  chromosome segregation protein SMC  44.53 
 
 		 1153 aa  382  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.991905 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  32.04 
 
 		 1176 aa  375  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4694  chromosome segregation protein SMC  40.87 
 
 		 1140 aa  374  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  31.79 
 
 		 1174 aa  370  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  31.68 
 
 		 1174 aa  366  1e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  29.44 
 
 		 1187 aa  366  1e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0876  chromosome segregation protein SMC2  52.59 
 
 		 1151 aa  343  1e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.601564  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0144  chromosome segregation protein SMC  51.44 
 
 		 1170 aa  339  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2536  chromosome segregation protein SMC  51.72 
 
 		 1170 aa  337  9e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  26.89 
 
 		 1190 aa  330  8e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  25.93 
 
 		 1185 aa  326  1e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7655  chromosome segregation protein SMC  58.9 
 
 		 1148 aa  325  4e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00190533  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2738  chromosome segregation protein SMC  50.97 
 
 		 1167 aa  319  2e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6942  chromosome segregation protein SMC  66.94 
 
 		 1144 aa  312  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0702595 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3248  condensin subunit Smc  48.99 
 
 		 1167 aa  305  3.0000000000000004e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2270  chromosome segregation protein SMC  49.48 
 
 		 1147 aa  302  3e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0955  chromosome segregation protein SMC  48.27 
 
 		 1147 aa  296  2e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.235362  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0399  chromosome segregation protein SMC  55.9 
 
 		 1165 aa  266  2e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.489923  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0064  SMC domain protein  45.81 
 
 		 1511 aa  265  4.999999999999999e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0434137 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  26.47 
 
 		 1181 aa  261  7e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  32.11 
 
 		 1164 aa  220  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  44.44 
 
 		 1195 aa  219  2.9999999999999998e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  45.53 
 
 		 1164 aa  214  7e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  31.66 
 
 		 1176 aa  214  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1228  condensin subunit Smc  31.27 
 
 		 1165 aa  213  2e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  36.03 
 
 		 1176 aa  213  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2366  chromosome segregation protein SMC  50.23 
 
 		 1145 aa  210  1e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00122996  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  44.64 
 
 		 1167 aa  209  2e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  44.64 
 
 		 1167 aa  209  2e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  48.44 
 
 		 1199 aa  209  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  48.44 
 
 		 1199 aa  209  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  48.44 
 
 		 1199 aa  209  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  50.7 
 
 		 1182 aa  209  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1573  chromosome segregation protein SMC  50.46 
 
 		 1142 aa  209  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00374514  hitchhiker  0.000804403 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  48.18 
 
 		 1198 aa  207  9e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2681  chromosome segregation protein SMC  49.54 
 
 		 1138 aa  207  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000886702  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  42.32 
 
 		 1177 aa  207  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  44.64 
 
 		 1167 aa  207  1e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  40.25 
 
 		 1173 aa  206  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  30.61 
 
 		 1198 aa  205  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  36.36 
 
 		 1175 aa  205  4e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1736  chromosome segregation protein SMC  51.74 
 
 		 814 aa  204  8e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00195971  unclonable  0.00000000014199 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  42.09 
 
 		 1164 aa  204  9e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1928  chromosome segregation protein SMC  36.91 
 
 		 1170 aa  204  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.5125  normal  0.122807 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  41.6 
 
 		 1176 aa  204  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  37.92 
 
 		 1198 aa  203  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5336  chromosome segregation protein SMC  36.91 
 
 		 1170 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.119827 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1270  chromosome segregation protein SMC  45.78 
 
 		 1171 aa  203  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845906  normal  0.0711674 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2026  chromosome segregation protein SMC  36.91 
 
 		 1170 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.676203  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2046  chromosome segregation protein SMC  36.91 
 
 		 1170 aa  202  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.884019  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1334  chromosome segregation protein SMC  35.65 
 
 		 1171 aa  202  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0218063  normal  0.637516 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1346  chromosome segregation protein SMC  37.25 
 
 		 1172 aa  202  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.333304  normal  0.300514 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  41.51 
 
 		 1403 aa  201  5e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2446  chromosome segregation protein SMC  38.13 
 
 		 1170 aa  201  5e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.889983  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1563  chromosome segregation protein SMC  38.13 
 
 		 1170 aa  201  5e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.438222  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2502  chromosome segregation protein SMC  38.13 
 
 		 1170 aa  201  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.240456  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6051  chromosome segregation protein SMC  36.91 
 
 		 1170 aa  201  6e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1250  chromosome segregation protein SMC  36.58 
 
 		 1206 aa  201  6e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  33.74 
 
 		 1204 aa  201  6e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  42.92 
 
 		 1175 aa  201  7.999999999999999e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  34.74 
 
 		 1301 aa  200  1.0000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2514  chromosome segregation protein SMC  39.16 
 
 		 1170 aa  200  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0530303 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  37.08 
 
 		 1171 aa  200  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2952  chromosome segregation protein SMC  40.85 
 
 		 1171 aa  200  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0128917  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  50.24 
 
 		 1164 aa  200  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  50.24 
 
 		 1164 aa  200  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2065  chromosome segregation protein SMC  37.79 
 
 		 1200 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1401  condensin subunit Smc  39.7 
 
 		 1168 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.934786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  42.58 
 
 		 1187 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3246  chromosome segregation protein SMC  37.79 
 
 		 1170 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.318712  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1337  chromosome segregation protein SMC  37.79 
 
 		 1202 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  34.46 
 
 		 1171 aa  199  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  37.79 
 
 		 1268 aa  199  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0161  chromosome segregation protein SMC  46.7 
 
 		 1167 aa  198  4.0000000000000005e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2019  chromosome segregation protein SMC  37.79 
 
 		 1170 aa  198  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  34.33 
 
 		 1171 aa  198  4.0000000000000005e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>