More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0497 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0497  SMC family protein  100 
 
 		 1152 aa  2251    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0613  chromosome segregation protein SMC  88.18 
 
 		 1152 aa  1858    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4373  chromosome segregation protein SMC  47.57 
 
 		 1153 aa  772    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.991905 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0699  chromosome segregation protein SMC  53.66 
 
 		 1153 aa  1013    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4983  chromosome segregation protein SMC  52.22 
 
 		 1154 aa  996    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127534  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2608  chromosome segregation protein SMC  50.68 
 
 		 1168 aa  973    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.198178  normal  0.335966 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0745  chromosome segregation protein SMC  49.05 
 
 		 1150 aa  912    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.525394  normal  0.893736 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1981  chromosome segregation protein SMC  52.51 
 
 		 1150 aa  889    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0547  chromosome segregation protein SMC  65.1 
 
 		 1153 aa  1306    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.725203 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3248  condensin subunit Smc  46 
 
 		 1167 aa  769    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0500  chromosome segregation protein SMC  99.83 
 
 		 1152 aa  2244    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.169399  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1066  chromosome segregation protein SMC  51.7 
 
 		 1154 aa  1006    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0374  chromosome segregation protein SMC  46.11 
 
 		 1151 aa  833    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1095  chromosome segregation protein  63.45 
 
 		 1153 aa  1284    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4374  chromosome segregation protein SMC  52.18 
 
 		 1154 aa  1033    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.95695  normal  0.0465691 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0657  chromosome segregation protein SMC  65.31 
 
 		 1153 aa  1330    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.915586  normal  0.754344 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1194  chromosome segregation protein SMC  52.48 
 
 		 1154 aa  1002    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3230  chromosome segregation protein SMC  51.03 
 
 		 1170 aa  979    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0768  condensin subunit Smc  71.01 
 
 		 1152 aa  1335    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2318  condensin subunit Smc  52.56 
 
 		 1154 aa  1018    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0716  chromosome segregation protein SMC  65.39 
 
 		 1153 aa  1347    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0163  chromosome segregation protein SMC  46.43 
 
 		 1150 aa  788    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3824  chromosome segregation protein SMC  53.47 
 
 		 1151 aa  1004    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0542546 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  29.56 
 
 		 1169 aa  421  1e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  29.89 
 
 		 1169 aa  419  9.999999999999999e-116  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  32.17 
 
 		 1167 aa  416  1e-114  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  32.2 
 
 		 1167 aa  414  1e-114  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2199  condensin subunit Smc  44.18 
 
 		 1148 aa  412  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.53129 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  31.99 
 
 		 1177 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  31.84 
 
 		 1162 aa  395  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  31.96 
 
 		 1171 aa  394  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4694  chromosome segregation protein SMC  42 
 
 		 1140 aa  394  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  31.45 
 
 		 1167 aa  390  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0161  chromosome segregation protein SMC  33.31 
 
 		 1167 aa  392  1e-107  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1270  chromosome segregation protein SMC  31.83 
 
 		 1171 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845906  normal  0.0711674 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  31.79 
 
 		 1167 aa  389  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  32.48 
 
 		 1175 aa  384  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  27.32 
 
 		 1185 aa  382  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  31.47 
 
 		 1171 aa  382  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  29.07 
 
 		 1187 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  27.99 
 
 		 1164 aa  375  1e-102  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  28.59 
 
 		 1164 aa  374  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0144  chromosome segregation protein SMC  55.74 
 
 		 1170 aa  372  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0876  chromosome segregation protein SMC2  54.62 
 
 		 1151 aa  367  1e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.601564  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2536  chromosome segregation protein SMC  54.75 
 
 		 1170 aa  363  9e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  28.25 
 
 		 1189 aa  362  2e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  28.25 
 
 		 1189 aa  362  2e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2587  chromosome segregation protein SMC  48.79 
 
 		 1151 aa  361  4e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000427179 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  28.17 
 
 		 1189 aa  360  9.999999999999999e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  28.17 
 
 		 1189 aa  360  9.999999999999999e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7655  chromosome segregation protein SMC  62.69 
 
 		 1148 aa  358  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00190533  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  28.73 
 
 		 1189 aa  351  4e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  27.27 
 
 		 1190 aa  344  7e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  26.23 
 
 		 1185 aa  343  1e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6942  chromosome segregation protein SMC  72.34 
 
 		 1144 aa  333  1e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0702595 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2738  chromosome segregation protein SMC  51.21 
 
 		 1167 aa  331  5.0000000000000004e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  28.12 
 
 		 1186 aa  329  2.0000000000000001e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0955  chromosome segregation protein SMC  38.15 
 
 		 1147 aa  313  9e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.235362  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2270  chromosome segregation protein SMC  57.04 
 
 		 1147 aa  307  6e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0064  SMC domain protein  43.47 
 
 		 1511 aa  302  2e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0434137 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0399  chromosome segregation protein SMC  46.88 
 
 		 1165 aa  281  5e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.489923  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  22.9 
 
 		 1180 aa  278  6e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  22.27 
 
 		 1153 aa  257  9e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  39.24 
 
 		 1199 aa  229  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  39.24 
 
 		 1199 aa  229  3e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2898  SMC family protein  50.44 
 
 		 1145 aa  227  1e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  32.91 
 
 		 1268 aa  226  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  38.9 
 
 		 1199 aa  225  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  50.22 
 
 		 1176 aa  225  4e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  45.9 
 
 		 1164 aa  224  4.9999999999999996e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2019  chromosome segregation protein SMC  33.17 
 
 		 1170 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  34.02 
 
 		 1198 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2502  chromosome segregation protein SMC  33.17 
 
 		 1170 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.240456  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2446  chromosome segregation protein SMC  33.17 
 
 		 1170 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.889983  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1563  chromosome segregation protein SMC  32.62 
 
 		 1170 aa  223  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.438222  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2366  chromosome segregation protein SMC  44.91 
 
 		 1145 aa  222  3e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00122996  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  30.08 
 
 		 1162 aa  222  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  46.84 
 
 		 1164 aa  222  3e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2065  chromosome segregation protein SMC  33.33 
 
 		 1200 aa  222  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3246  chromosome segregation protein SMC  33.33 
 
 		 1170 aa  222  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.318712  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  53.03 
 
 		 1176 aa  221  5e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1337  chromosome segregation protein SMC  33.33 
 
 		 1202 aa  221  5e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6051  chromosome segregation protein SMC  44.49 
 
 		 1170 aa  220  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2026  chromosome segregation protein SMC  44.49 
 
 		 1170 aa  221  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.676203  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5336  chromosome segregation protein SMC  42.18 
 
 		 1170 aa  220  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.119827 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1736  chromosome segregation protein SMC  50.45 
 
 		 814 aa  219  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00195971  unclonable  0.00000000014199 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2046  chromosome segregation protein SMC  44.49 
 
 		 1170 aa  219  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.884019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2379  chromosome segregation protein SMC  35.4 
 
 		 1141 aa  219  2.9999999999999998e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.882333  unclonable  0.00000367062 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2849  chromosome segregation protein SMC  50.93 
 
 		 1133 aa  219  2.9999999999999998e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000354618  unclonable  0.0000000590997 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2192  chromosome segregation protein SMC  32.69 
 
 		 1234 aa  219  2.9999999999999998e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  26.63 
 
 		 1171 aa  219  2.9999999999999998e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1567  chromosome segregation protein SMC  33.92 
 
 		 1142 aa  219  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218486  hitchhiker  0.0000000844837 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2760  chromosome segregation protein SMC  48.68 
 
 		 1138 aa  218  4e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.494661  unclonable  0.00000956134 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2656  chromosome segregation protein SMC  48.89 
 
 		 1138 aa  218  4e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000574242  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2681  chromosome segregation protein SMC  48.89 
 
 		 1138 aa  218  5e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000886702  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1928  chromosome segregation protein SMC  44.09 
 
 		 1170 aa  218  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.5125  normal  0.122807 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1346  chromosome segregation protein SMC  32.6 
 
 		 1172 aa  218  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.333304  normal  0.300514 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1703  chromosome segregation protein SMC  49.08 
 
 		 1138 aa  218  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00557127  hitchhiker  0.00000000707845 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1228  condensin subunit Smc  31.9 
 
 		 1165 aa  217  9.999999999999999e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  50.91 
 
 		 1168 aa  217  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>