More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0374 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_0613  chromosome segregation protein SMC  44.58 
 
 		 1152 aa  820    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0497  SMC family protein  45.6 
 
 		 1152 aa  831    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4373  chromosome segregation protein SMC  45.73 
 
 		 1153 aa  719    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.991905 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0657  chromosome segregation protein SMC  43.72 
 
 		 1153 aa  754    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.915586  normal  0.754344 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0144  chromosome segregation protein SMC  62.38 
 
 		 1170 aa  1205    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2608  chromosome segregation protein SMC  44.97 
 
 		 1168 aa  766    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.198178  normal  0.335966 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4983  chromosome segregation protein SMC  44.35 
 
 		 1154 aa  762    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127534  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1095  chromosome segregation protein  44.85 
 
 		 1153 aa  778    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0876  chromosome segregation protein SMC2  59.29 
 
 		 1151 aa  792    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.601564  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3824  chromosome segregation protein SMC  45.32 
 
 		 1151 aa  771    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0542546 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3248  condensin subunit Smc  45.21 
 
 		 1167 aa  722    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1066  chromosome segregation protein SMC  44.5 
 
 		 1154 aa  787    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0374  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1151 aa  2246    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4374  chromosome segregation protein SMC  43.42 
 
 		 1154 aa  773    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.95695  normal  0.0465691 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1194  chromosome segregation protein SMC  43.78 
 
 		 1154 aa  780    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2318  condensin subunit Smc  44.24 
 
 		 1154 aa  766    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0500  chromosome segregation protein SMC  45.68 
 
 		 1152 aa  835    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.169399  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2587  chromosome segregation protein SMC  60.82 
 
 		 1151 aa  1310    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000427179 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0699  chromosome segregation protein SMC  47.62 
 
 		 1153 aa  860    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0163  chromosome segregation protein SMC  61.95 
 
 		 1150 aa  1166    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2199  condensin subunit Smc  42.34 
 
 		 1148 aa  684    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.53129 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0547  chromosome segregation protein SMC  43.98 
 
 		 1153 aa  755    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.725203 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0745  chromosome segregation protein SMC  43.61 
 
 		 1150 aa  744    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.525394  normal  0.893736 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2536  chromosome segregation protein SMC  59.29 
 
 		 1170 aa  785    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0716  chromosome segregation protein SMC  44.85 
 
 		 1153 aa  765    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2738  chromosome segregation protein SMC  67.74 
 
 		 1167 aa  464  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1981  chromosome segregation protein SMC  45.97 
 
 		 1150 aa  449  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1228  condensin subunit Smc  31.91 
 
 		 1165 aa  405  1e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  32.35 
 
 		 1175 aa  403  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  31.11 
 
 		 1177 aa  398  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  30.72 
 
 		 1167 aa  396  1e-108  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  30.72 
 
 		 1167 aa  395  1e-108  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  29.81 
 
 		 1164 aa  390  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2952  chromosome segregation protein SMC  31.55 
 
 		 1171 aa  390  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0128917  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  30.81 
 
 		 1174 aa  388  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  28.57 
 
 		 1169 aa  387  1e-106  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  31.75 
 
 		 1198 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  31.92 
 
 		 1198 aa  385  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  30.09 
 
 		 1162 aa  381  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  29.69 
 
 		 1167 aa  382  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  28.45 
 
 		 1169 aa  382  1e-104  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  30.66 
 
 		 1175 aa  379  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  30.67 
 
 		 1190 aa  379  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  30.57 
 
 		 1174 aa  379  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  30.22 
 
 		 1171 aa  375  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2019  chromosome segregation protein SMC  31.41 
 
 		 1170 aa  374  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4694  chromosome segregation protein SMC  41.1 
 
 		 1140 aa  365  4e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  30.84 
 
 		 1167 aa  364  4e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0768  condensin subunit Smc  54.39 
 
 		 1152 aa  364  4e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3230  chromosome segregation protein SMC  51.13 
 
 		 1170 aa  357  1e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  27.62 
 
 		 1185 aa  340  7e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  26.35 
 
 		 1172 aa  335  3e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  27.21 
 
 		 1186 aa  333  1e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  28.51 
 
 		 1179 aa  323  9.999999999999999e-87  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7655  chromosome segregation protein SMC  50.42 
 
 		 1148 aa  318  3e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00190533  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0064  SMC domain protein  47.23 
 
 		 1511 aa  313  1e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0434137 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  27.97 
 
 		 1186 aa  308  3e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2270  chromosome segregation protein SMC  49.61 
 
 		 1147 aa  302  2e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0955  chromosome segregation protein SMC  47.86 
 
 		 1147 aa  292  2e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.235362  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  27.16 
 
 		 1181 aa  286  2.0000000000000002e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6942  chromosome segregation protein SMC  60.43 
 
 		 1144 aa  285  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0702595 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0399  chromosome segregation protein SMC  45.45 
 
 		 1165 aa  268  4e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.489923  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  38.23 
 
 		 1199 aa  232  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  38 
 
 		 1199 aa  230  1e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  48.85 
 
 		 1198 aa  226  2e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  37.76 
 
 		 1199 aa  226  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  36.2 
 
 		 1175 aa  219  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2366  chromosome segregation protein SMC  47.64 
 
 		 1145 aa  218  5e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00122996  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  51.71 
 
 		 1176 aa  217  8e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  52.2 
 
 		 1176 aa  217  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2516  chromosome segregation protein SMC  29.41 
 
 		 1138 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0576231  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  31.25 
 
 		 1182 aa  214  9e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  40.54 
 
 		 1176 aa  213  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1457  chromosome segregation protein SMC  29.66 
 
 		 1173 aa  213  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  35.58 
 
 		 1164 aa  212  4e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  36.67 
 
 		 1164 aa  211  5e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1687  chromosome segregation protein SMC  28.07 
 
 		 1140 aa  211  5e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0207263  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1514  SMC family protein  46.32 
 
 		 1139 aa  211  5e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3602  chromosome segregation protein SMC  43.15 
 
 		 1162 aa  211  7e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  42.86 
 
 		 1176 aa  210  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  43.48 
 
 		 1168 aa  209  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1592  chromosome segregation protein SMC  42.74 
 
 		 1162 aa  209  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.843365  normal  0.195769 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  43.15 
 
 		 1162 aa  209  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4276  chromosome segregation protein SMC  42.74 
 
 		 1162 aa  209  3e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  42.25 
 
 		 1164 aa  209  3e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  43.15 
 
 		 1162 aa  209  4e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  43.28 
 
 		 1162 aa  208  4e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  30.92 
 
 		 1195 aa  208  4e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3840  chromosome segregation protein SMC  42.32 
 
 		 1162 aa  207  7e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509302 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  43.28 
 
 		 1164 aa  206  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  37.91 
 
 		 1175 aa  207  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1401  condensin subunit Smc  28.99 
 
 		 1168 aa  206  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.934786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  35.8 
 
 		 1162 aa  206  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  43.15 
 
 		 1163 aa  205  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  40.4 
 
 		 1171 aa  205  4e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  46.85 
 
 		 1187 aa  205  4e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2514  chromosome segregation protein SMC  42.23 
 
 		 1170 aa  205  4e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0530303 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2463  chromosome segregation protein SMC  47.47 
 
 		 1144 aa  205  4e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000141924  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2656  chromosome segregation protein SMC  41.42 
 
 		 1138 aa  204  5e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000574242  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  25.44 
 
 		 1171 aa  204  5e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>