More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2738 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0497  SMC family protein  48.08 
 
 		 1152 aa  811    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0163  chromosome segregation protein SMC  61.69 
 
 		 1150 aa  1117    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0716  chromosome segregation protein SMC  46.18 
 
 		 1153 aa  785    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1095  chromosome segregation protein  46.1 
 
 		 1153 aa  767    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2608  chromosome segregation protein SMC  44.44 
 
 		 1168 aa  738    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.198178  normal  0.335966 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0876  chromosome segregation protein SMC2  60.93 
 
 		 1151 aa  758    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.601564  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0613  chromosome segregation protein SMC  47.63 
 
 		 1152 aa  811    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3248  condensin subunit Smc  46.43 
 
 		 1167 aa  717    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2318  condensin subunit Smc  45.78 
 
 		 1154 aa  770    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1066  chromosome segregation protein SMC  45.65 
 
 		 1154 aa  766    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0374  chromosome segregation protein SMC  60.02 
 
 		 1151 aa  1181    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4374  chromosome segregation protein SMC  45.8 
 
 		 1154 aa  773    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.95695  normal  0.0465691 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0745  chromosome segregation protein SMC  44.21 
 
 		 1150 aa  739    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.525394  normal  0.893736 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1194  chromosome segregation protein SMC  45.96 
 
 		 1154 aa  776    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3230  chromosome segregation protein SMC  45.29 
 
 		 1170 aa  752    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2587  chromosome segregation protein SMC  62.24 
 
 		 1151 aa  1247    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000427179 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0547  chromosome segregation protein SMC  45.69 
 
 		 1153 aa  760    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.725203 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0768  condensin subunit Smc  47.74 
 
 		 1152 aa  736    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0144  chromosome segregation protein SMC  58.9 
 
 		 1170 aa  777    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0500  chromosome segregation protein SMC  48.17 
 
 		 1152 aa  813    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.169399  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4983  chromosome segregation protein SMC  45.8 
 
 		 1154 aa  756    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127534  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1981  chromosome segregation protein SMC  47.34 
 
 		 1150 aa  731    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0657  chromosome segregation protein SMC  45.69 
 
 		 1153 aa  775    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.915586  normal  0.754344 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2536  chromosome segregation protein SMC  60.26 
 
 		 1170 aa  754    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2738  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1167 aa  2228    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0699  chromosome segregation protein SMC  50.47 
 
 		 1153 aa  863    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  31.07 
 
 		 1162 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1228  condensin subunit Smc  32.92 
 
 		 1165 aa  401  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  32.26 
 
 		 1163 aa  395  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  32.12 
 
 		 1162 aa  395  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  34.04 
 
 		 1174 aa  394  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2366  chromosome segregation protein SMC  29.89 
 
 		 1145 aa  394  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00122996  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  32.99 
 
 		 1182 aa  392  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  31.2 
 
 		 1167 aa  390  1e-107  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  33.6 
 
 		 1175 aa  387  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  29.3 
 
 		 1176 aa  389  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  31.02 
 
 		 1167 aa  389  1e-106  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  31.76 
 
 		 1162 aa  384  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  32.34 
 
 		 1171 aa  385  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  31.48 
 
 		 1167 aa  384  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  31.79 
 
 		 1171 aa  383  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4276  chromosome segregation protein SMC  32.11 
 
 		 1162 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  30.88 
 
 		 1168 aa  383  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  29.3 
 
 		 1164 aa  380  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1799  condensin subunit Smc  31.23 
 
 		 1162 aa  377  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0884011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1687  chromosome segregation protein SMC  29.49 
 
 		 1140 aa  377  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0207263  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4694  chromosome segregation protein SMC  45.23 
 
 		 1140 aa  379  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  31.33 
 
 		 1167 aa  379  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0161  chromosome segregation protein SMC  32.92 
 
 		 1167 aa  375  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  32.76 
 
 		 1268 aa  373  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  28.65 
 
 		 1164 aa  361  6e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  30.06 
 
 		 1177 aa  356  1e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3824  chromosome segregation protein SMC  54.65 
 
 		 1151 aa  356  2e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0542546 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  28.41 
 
 		 1164 aa  350  7e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4373  chromosome segregation protein SMC  53.98 
 
 		 1153 aa  349  2e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.991905 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2199  condensin subunit Smc  63.08 
 
 		 1148 aa  332  2e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.53129 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  27.97 
 
 		 1179 aa  328  4.0000000000000003e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7655  chromosome segregation protein SMC  53.74 
 
 		 1148 aa  316  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00190533  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2270  chromosome segregation protein SMC  60.22 
 
 		 1147 aa  313  1e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  29.42 
 
 		 1179 aa  313  1e-83  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6942  chromosome segregation protein SMC  66.81 
 
 		 1144 aa  298  4e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0702595 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0064  SMC domain protein  45.63 
 
 		 1511 aa  293  9e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0434137 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0955  chromosome segregation protein SMC  50.41 
 
 		 1147 aa  290  8e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.235362  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  24.56 
 
 		 1164 aa  267  1e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0399  chromosome segregation protein SMC  56.47 
 
 		 1165 aa  263  2e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.489923  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  21.77 
 
 		 1180 aa  258  4e-67  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  36.65 
 
 		 1199 aa  223  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  32.42 
 
 		 1162 aa  219  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1573  chromosome segregation protein SMC  43.54 
 
 		 1142 aa  217  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00374514  hitchhiker  0.000804403 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1736  chromosome segregation protein SMC  42.51 
 
 		 814 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00195971  unclonable  0.00000000014199 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1880  chromosome segregation protein SMC  43.29 
 
 		 1165 aa  216  2.9999999999999995e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  51.24 
 
 		 1175 aa  215  4.9999999999999996e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  48.57 
 
 		 1198 aa  214  9e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  31.51 
 
 		 1195 aa  213  1e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  39.55 
 
 		 1162 aa  213  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  42.76 
 
 		 1190 aa  213  2e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  32.67 
 
 		 1162 aa  213  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  37.28 
 
 		 1169 aa  213  2e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2463  chromosome segregation protein SMC  49.54 
 
 		 1144 aa  212  3e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000141924  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  37.28 
 
 		 1169 aa  212  4e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2849  chromosome segregation protein SMC  48.37 
 
 		 1133 aa  209  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000354618  unclonable  0.0000000590997 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2952  chromosome segregation protein SMC  43.09 
 
 		 1171 aa  208  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0128917  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1567  chromosome segregation protein SMC  30.07 
 
 		 1142 aa  207  8e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218486  hitchhiker  0.0000000844837 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1814  chromosome segregation protein SMC  43.09 
 
 		 1181 aa  206  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  31.15 
 
 		 1191 aa  207  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  42.17 
 
 		 1174 aa  207  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1506  chromosome segregation protein SMC  30.55 
 
 		 1142 aa  206  2e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00012681  hitchhiker  0.00000000387349 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1695  chromosome segregation protein SMC  32.19 
 
 		 1170 aa  204  6e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.573512  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  38.22 
 
 		 1176 aa  204  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  30.89 
 
 		 1177 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2440  chromosome segregation SMC protein  48.36 
 
 		 1109 aa  203  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129774  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  42.28 
 
 		 1175 aa  202  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  34.63 
 
 		 1164 aa  202  3e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3590  chromosome segregation protein SMC  41.27 
 
 		 1204 aa  201  6e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968509  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2760  chromosome segregation protein SMC  40.94 
 
 		 1138 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.494661  unclonable  0.00000956134 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2898  SMC family protein  36.42 
 
 		 1145 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1703  chromosome segregation protein SMC  40.94 
 
 		 1138 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00557127  hitchhiker  0.00000000707845 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2514  chromosome segregation protein SMC  42.62 
 
 		 1170 aa  200  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0530303 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2656  chromosome segregation protein SMC  40.94 
 
 		 1138 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000574242  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3602  chromosome segregation protein SMC  41.74 
 
 		 1162 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111779  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>