More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1981 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1095  chromosome segregation protein  52.32 
 
 		 1153 aa  986    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0497  SMC family protein  52.51 
 
 		 1152 aa  967    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0716  chromosome segregation protein SMC  51.63 
 
 		 1153 aa  973    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4983  chromosome segregation protein SMC  56.96 
 
 		 1154 aa  1088    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127534  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1981  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1150 aa  2205    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2608  chromosome segregation protein SMC  55.82 
 
 		 1168 aa  1058    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.198178  normal  0.335966 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0745  chromosome segregation protein SMC  53.43 
 
 		 1150 aa  979    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.525394  normal  0.893736 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0547  chromosome segregation protein SMC  51.78 
 
 		 1153 aa  947    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.725203 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0500  chromosome segregation protein SMC  52.68 
 
 		 1152 aa  972    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.169399  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0657  chromosome segregation protein SMC  51.08 
 
 		 1153 aa  950    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.915586  normal  0.754344 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3248  condensin subunit Smc  47.77 
 
 		 1167 aa  743    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1066  chromosome segregation protein SMC  56.87 
 
 		 1154 aa  1106    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3824  chromosome segregation protein SMC  55.59 
 
 		 1151 aa  993    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0542546 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0374  chromosome segregation protein SMC  45.31 
 
 		 1151 aa  789    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4374  chromosome segregation protein SMC  56.35 
 
 		 1154 aa  1103    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.95695  normal  0.0465691 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1194  chromosome segregation protein SMC  56.35 
 
 		 1154 aa  1084    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3230  chromosome segregation protein SMC  56.1 
 
 		 1170 aa  1074    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2587  chromosome segregation protein SMC  46.77 
 
 		 1151 aa  826    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000427179 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0768  condensin subunit Smc  53.49 
 
 		 1152 aa  901    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0163  chromosome segregation protein SMC  46.52 
 
 		 1150 aa  714    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0699  chromosome segregation protein SMC  52.43 
 
 		 1153 aa  950    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2318  condensin subunit Smc  57.85 
 
 		 1154 aa  1105    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2199  condensin subunit Smc  45.04 
 
 		 1148 aa  721    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.53129 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0613  chromosome segregation protein SMC  52.85 
 
 		 1152 aa  996    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0144  chromosome segregation protein SMC  43.52 
 
 		 1170 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2536  chromosome segregation protein SMC  48.32 
 
 		 1170 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0876  chromosome segregation protein SMC2  48.17 
 
 		 1151 aa  458  1e-127  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.601564  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  33.31 
 
 		 1199 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  33.44 
 
 		 1199 aa  418  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  32.04 
 
 		 1176 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  31.85 
 
 		 1176 aa  414  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  31.31 
 
 		 1173 aa  414  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  33.28 
 
 		 1199 aa  416  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4694  chromosome segregation protein SMC  47.61 
 
 		 1140 aa  411  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  31.58 
 
 		 1195 aa  407  1.0000000000000001e-112  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  32.6 
 
 		 1198 aa  406  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  33.39 
 
 		 1175 aa  402  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  32.87 
 
 		 1171 aa  403  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  30.84 
 
 		 1176 aa  399  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  34.05 
 
 		 1164 aa  397  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  29.94 
 
 		 1176 aa  390  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  31.42 
 
 		 1177 aa  386  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  30.36 
 
 		 1168 aa  384  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  32.79 
 
 		 1198 aa  385  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  29.53 
 
 		 1169 aa  384  1e-105  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  31.33 
 
 		 1162 aa  382  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  31.13 
 
 		 1171 aa  383  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4373  chromosome segregation protein SMC  44.94 
 
 		 1153 aa  383  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.991905 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2019  chromosome segregation protein SMC  32.21 
 
 		 1170 aa  382  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  32.04 
 
 		 1175 aa  380  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  29.42 
 
 		 1169 aa  382  1e-104  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  31.45 
 
 		 1168 aa  383  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0161  chromosome segregation protein SMC  33.79 
 
 		 1167 aa  378  1e-103  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2366  chromosome segregation protein SMC  29.33 
 
 		 1145 aa  378  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00122996  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  27.95 
 
 		 1189 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  27.95 
 
 		 1189 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  31.35 
 
 		 1171 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  27.95 
 
 		 1189 aa  373  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  27.87 
 
 		 1189 aa  372  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  28.03 
 
 		 1189 aa  369  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  28.03 
 
 		 1189 aa  369  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  27.87 
 
 		 1189 aa  369  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  28.42 
 
 		 1189 aa  370  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  27.68 
 
 		 1189 aa  370  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  28.56 
 
 		 1189 aa  367  1e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  27.77 
 
 		 1164 aa  365  2e-99  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7655  chromosome segregation protein SMC  64.02 
 
 		 1148 aa  365  2e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00190533  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  30.6 
 
 		 1190 aa  364  5.0000000000000005e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  26.25 
 
 		 1185 aa  363  7.0000000000000005e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  32.69 
 
 		 1167 aa  364  7.0000000000000005e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  26.7 
 
 		 1189 aa  362  2e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  27.84 
 
 		 1189 aa  362  3e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  32.2 
 
 		 1167 aa  355  2.9999999999999997e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0900  chromosome segregation protein SMC  30.93 
 
 		 1150 aa  352  2e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.188992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0753  chromosome segregation protein SMC  30.93 
 
 		 1150 aa  351  4e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  26.72 
 
 		 1191 aa  348  3e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  26.78 
 
 		 1186 aa  348  5e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  25.45 
 
 		 1188 aa  347  8.999999999999999e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  25.45 
 
 		 1188 aa  347  8.999999999999999e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  26.73 
 
 		 1190 aa  346  1e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  24.05 
 
 		 1178 aa  342  2.9999999999999998e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  28.58 
 
 		 1177 aa  340  8e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  27.1 
 
 		 1184 aa  340  9.999999999999999e-92  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  27.64 
 
 		 1187 aa  337  1e-90  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  27.64 
 
 		 1174 aa  336  1e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2738  chromosome segregation protein SMC  56.61 
 
 		 1167 aa  335  2e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  26.58 
 
 		 1186 aa  334  6e-90  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  26.17 
 
 		 1186 aa  325  2e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  27.16 
 
 		 1179 aa  311  5.9999999999999995e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6942  chromosome segregation protein SMC  69.07 
 
 		 1144 aa  311  6.999999999999999e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0702595 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0955  chromosome segregation protein SMC  50.53 
 
 		 1147 aa  310  9e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.235362  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  29.52 
 
 		 1179 aa  299  3e-79  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2270  chromosome segregation protein SMC  56.07 
 
 		 1147 aa  295  5e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0064  SMC domain protein  48.63 
 
 		 1511 aa  292  3e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0434137 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  26.88 
 
 		 1181 aa  282  3e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  29.25 
 
 		 1403 aa  281  4e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  22.87 
 
 		 1180 aa  278  4e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0399  chromosome segregation protein SMC  46.89 
 
 		 1165 aa  276  1.0000000000000001e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.489923  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  30.64 
 
 		 1163 aa  224  4.9999999999999996e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2463  chromosome segregation protein SMC  50.46 
 
 		 1144 aa  217  9.999999999999999e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000141924  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>