More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2608 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0497  SMC family protein  50.77 
 
 
1152 aa  992    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0699  chromosome segregation protein SMC  50.34 
 
 
1153 aa  974    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1095  chromosome segregation protein  51.54 
 
 
1153 aa  1016    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2608  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 
1168 aa  2290    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.198178  normal  0.335966 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0163  chromosome segregation protein SMC  44.7 
 
 
1150 aa  739    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3248  condensin subunit Smc  44.62 
 
 
1167 aa  738    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2318  condensin subunit Smc  75.6 
 
 
1154 aa  1628    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1066  chromosome segregation protein SMC  76.88 
 
 
1154 aa  1684    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0374  chromosome segregation protein SMC  44.66 
 
 
1151 aa  791    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4374  chromosome segregation protein SMC  78 
 
 
1154 aa  1697    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.95695  normal  0.0465691 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0657  chromosome segregation protein SMC  50.21 
 
 
1153 aa  975    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.915586  normal  0.754344 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1194  chromosome segregation protein SMC  77.74 
 
 
1154 aa  1687    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0745  chromosome segregation protein SMC  48.89 
 
 
1150 aa  920    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.525394  normal  0.893736 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3230  chromosome segregation protein SMC  91.87 
 
 
1170 aa  1950    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0716  chromosome segregation protein SMC  51.07 
 
 
1153 aa  1003    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0768  condensin subunit Smc  51.03 
 
 
1152 aa  934    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0500  chromosome segregation protein SMC  50.86 
 
 
1152 aa  995    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.169399  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0547  chromosome segregation protein SMC  50.39 
 
 
1153 aa  980    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.725203 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0613  chromosome segregation protein SMC  50.09 
 
 
1152 aa  971    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3824  chromosome segregation protein SMC  53.44 
 
 
1151 aa  1023    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0542546 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1981  chromosome segregation protein SMC  55.82 
 
 
1150 aa  972    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4983  chromosome segregation protein SMC  75.34 
 
 
1154 aa  1624    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127534  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2199  condensin subunit Smc  43.43 
 
 
1148 aa  427  1e-118  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.53129 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4694  chromosome segregation protein SMC  45.04 
 
 
1140 aa  428  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  30.28 
 
 
1173 aa  389  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  28.02 
 
 
1169 aa  382  1e-104  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  27.94 
 
 
1169 aa  379  1e-103  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2366  chromosome segregation protein SMC  29.89 
 
 
1145 aa  380  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00122996  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  27.76 
 
 
1187 aa  376  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  27.96 
 
 
1189 aa  376  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  30.9 
 
 
1167 aa  375  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  28.24 
 
 
1189 aa  375  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  29.16 
 
 
1301 aa  367  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  27.44 
 
 
1189 aa  365  3e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  27.44 
 
 
1189 aa  365  3e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  30.91 
 
 
1167 aa  364  4e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  27.44 
 
 
1189 aa  364  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  27.27 
 
 
1189 aa  363  8e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  27.27 
 
 
1189 aa  363  8e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  27.36 
 
 
1189 aa  363  1e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2587  chromosome segregation protein SMC  55.71 
 
 
1151 aa  363  1e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000427179 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  27.25 
 
 
1189 aa  361  4e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0144  chromosome segregation protein SMC  54.37 
 
 
1170 aa  357  8.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7655  chromosome segregation protein SMC  60.75 
 
 
1148 aa  354  5e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00190533  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2536  chromosome segregation protein SMC  54.93 
 
 
1170 aa  353  8.999999999999999e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0876  chromosome segregation protein SMC2  54.31 
 
 
1151 aa  352  2e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.601564  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  27.05 
 
 
1185 aa  351  4e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  26.86 
 
 
1185 aa  347  5e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4373  chromosome segregation protein SMC  53.44 
 
 
1153 aa  347  6e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.991905 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0753  chromosome segregation protein SMC  30.6 
 
 
1150 aa  345  2e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0900  chromosome segregation protein SMC  30.6 
 
 
1150 aa  345  2.9999999999999997e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.188992  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  25.93 
 
 
1190 aa  343  1e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  28.12 
 
 
1177 aa  342  2.9999999999999998e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  27.13 
 
 
1186 aa  331  4e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2738  chromosome segregation protein SMC  54.67 
 
 
1167 aa  326  2e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  24.94 
 
 
1190 aa  325  3e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6942  chromosome segregation protein SMC  65.74 
 
 
1144 aa  320  1e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0702595 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0955  chromosome segregation protein SMC  48.96 
 
 
1147 aa  313  1e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.235362  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  27.02 
 
 
1179 aa  313  2e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  28.72 
 
 
1179 aa  307  1.0000000000000001e-81  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2270  chromosome segregation protein SMC  55.76 
 
 
1147 aa  300  1e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  26.73 
 
 
1181 aa  299  2e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0064  SMC domain protein  42.35 
 
 
1511 aa  298  4e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0434137 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  29.55 
 
 
1403 aa  284  9e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  25.12 
 
 
1170 aa  283  1e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  24.88 
 
 
1164 aa  280  1e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0399  chromosome segregation protein SMC  55.13 
 
 
1165 aa  275  4.0000000000000004e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.489923  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  22.28 
 
 
1180 aa  273  1e-71  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  23.2 
 
 
1153 aa  263  2e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  38.41 
 
 
1175 aa  227  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1514  SMC family protein  50.43 
 
 
1139 aa  224  6e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192441  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  51.71 
 
 
1176 aa  223  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  46.64 
 
 
1195 aa  223  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  48.21 
 
 
1190 aa  222  3.9999999999999997e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  50.97 
 
 
1176 aa  221  5e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  47.71 
 
 
1174 aa  220  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  47.71 
 
 
1174 aa  220  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2516  chromosome segregation protein SMC  49.77 
 
 
1138 aa  219  2.9999999999999998e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0576231  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  36.96 
 
 
1175 aa  218  7e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2514  chromosome segregation protein SMC  44.26 
 
 
1170 aa  215  3.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0530303 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  46.85 
 
 
1198 aa  215  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1814  chromosome segregation protein SMC  44.67 
 
 
1181 aa  214  9e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2952  chromosome segregation protein SMC  47.53 
 
 
1171 aa  213  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0128917  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  52.68 
 
 
1164 aa  213  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  47.47 
 
 
1199 aa  212  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  49.77 
 
 
1164 aa  211  4e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1736  chromosome segregation protein SMC  48.85 
 
 
814 aa  211  5e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00195971  unclonable  0.00000000014199 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  49.77 
 
 
1164 aa  211  6e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5336  chromosome segregation protein SMC  46.85 
 
 
1170 aa  209  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.119827 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2046  chromosome segregation protein SMC  46.85 
 
 
1170 aa  209  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.884019  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6051  chromosome segregation protein SMC  46.85 
 
 
1170 aa  209  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2026  chromosome segregation protein SMC  46.85 
 
 
1170 aa  209  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.676203  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  49.29 
 
 
1177 aa  209  4e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  42.68 
 
 
1171 aa  209  4e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  47.66 
 
 
1168 aa  208  5e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2059  chromosome segregation protein SMC  46.85 
 
 
1142 aa  207  8e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.365444  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  43.21 
 
 
1175 aa  207  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1928  chromosome segregation protein SMC  46.85 
 
 
1170 aa  207  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.5125  normal  0.122807 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1250  chromosome segregation protein SMC  46.85 
 
 
1206 aa  207  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  48.06 
 
 
1176 aa  207  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>