More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0144 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009505  BOV_0500  chromosome segregation protein SMC  47.55 
 
 
1152 aa  824    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.169399  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2536  chromosome segregation protein SMC  93.75 
 
 
1170 aa  1298    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0163  chromosome segregation protein SMC  68.29 
 
 
1150 aa  1278    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0497  SMC family protein  47.36 
 
 
1152 aa  819    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0144  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 
1170 aa  2237    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1095  chromosome segregation protein  46.72 
 
 
1153 aa  790    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2608  chromosome segregation protein SMC  44.59 
 
 
1168 aa  758    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.198178  normal  0.335966 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4983  chromosome segregation protein SMC  45.49 
 
 
1154 aa  770    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127534  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0876  chromosome segregation protein SMC2  93.73 
 
 
1151 aa  1273    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.601564  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0547  chromosome segregation protein SMC  46.38 
 
 
1153 aa  768    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.725203 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3248  condensin subunit Smc  46.82 
 
 
1167 aa  715    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1066  chromosome segregation protein SMC  44.89 
 
 
1154 aa  791    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0374  chromosome segregation protein SMC  62.76 
 
 
1151 aa  1294    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4374  chromosome segregation protein SMC  44.97 
 
 
1154 aa  772    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.95695  normal  0.0465691 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1194  chromosome segregation protein SMC  44.6 
 
 
1154 aa  779    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0745  chromosome segregation protein SMC  43.54 
 
 
1150 aa  721    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.525394  normal  0.893736 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2587  chromosome segregation protein SMC  68.46 
 
 
1151 aa  1450    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000427179 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0716  chromosome segregation protein SMC  46.66 
 
 
1153 aa  783    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0613  chromosome segregation protein SMC  46.9 
 
 
1152 aa  823    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2199  condensin subunit Smc  45.21 
 
 
1148 aa  699    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.53129 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2318  condensin subunit Smc  46.36 
 
 
1154 aa  785    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0699  chromosome segregation protein SMC  49.24 
 
 
1153 aa  866    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0657  chromosome segregation protein SMC  45.52 
 
 
1153 aa  766    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.915586  normal  0.754344 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3824  chromosome segregation protein SMC  47.73 
 
 
1151 aa  763    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0542546 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2738  chromosome segregation protein SMC  68.3 
 
 
1167 aa  482  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3230  chromosome segregation protein SMC  48.21 
 
 
1170 aa  450  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1981  chromosome segregation protein SMC  48.57 
 
 
1150 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  32.02 
 
 
1177 aa  410  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  32.12 
 
 
1171 aa  412  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  33.09 
 
 
1182 aa  408  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  31.39 
 
 
1171 aa  405  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  33.94 
 
 
1268 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  32.82 
 
 
1198 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  32.26 
 
 
1176 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  33.36 
 
 
1162 aa  395  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1346  chromosome segregation protein SMC  32.27 
 
 
1172 aa  392  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.333304  normal  0.300514 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0161  chromosome segregation protein SMC  32.25 
 
 
1167 aa  391  1e-107  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  29.99 
 
 
1164 aa  391  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1270  chromosome segregation protein SMC  32.24 
 
 
1171 aa  391  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845906  normal  0.0711674 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  31.8 
 
 
1175 aa  389  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  30.56 
 
 
1168 aa  388  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  30.45 
 
 
1164 aa  386  1e-105  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  30.2 
 
 
1164 aa  384  1e-105  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  29.57 
 
 
1187 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  31.26 
 
 
1167 aa  384  1e-105  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  31.26 
 
 
1167 aa  384  1e-105  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  32.11 
 
 
1167 aa  386  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1687  chromosome segregation protein SMC  29.95 
 
 
1140 aa  377  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0207263  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  31.3 
 
 
1162 aa  375  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  28.72 
 
 
1189 aa  367  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  28.87 
 
 
1189 aa  368  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4694  chromosome segregation protein SMC  42.15 
 
 
1140 aa  369  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  31.73 
 
 
1175 aa  366  1e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0768  condensin subunit Smc  56.34 
 
 
1152 aa  366  1e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  31.41 
 
 
1167 aa  366  2e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  27.16 
 
 
1185 aa  358  5e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4373  chromosome segregation protein SMC  55.14 
 
 
1153 aa  348  4e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.991905 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  27.07 
 
 
1186 aa  337  1e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  28.92 
 
 
1177 aa  336  2e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7655  chromosome segregation protein SMC  52.62 
 
 
1148 aa  322  3e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00190533  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  23.51 
 
 
1177 aa  309  2.0000000000000002e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0064  SMC domain protein  46.02 
 
 
1511 aa  296  2e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0434137 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  30.57 
 
 
1403 aa  294  6e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2270  chromosome segregation protein SMC  58.06 
 
 
1147 aa  293  1e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0955  chromosome segregation protein SMC  49.19 
 
 
1147 aa  290  9e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.235362  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6942  chromosome segregation protein SMC  62.5 
 
 
1144 aa  286  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0702595 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0399  chromosome segregation protein SMC  46.22 
 
 
1165 aa  258  5e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.489923  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1814  chromosome segregation protein SMC  40.62 
 
 
1181 aa  228  4e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1514  SMC family protein  49.13 
 
 
1139 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192441  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  22.65 
 
 
1153 aa  221  6e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  36 
 
 
1199 aa  220  1e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  35.83 
 
 
1199 aa  219  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  39.13 
 
 
1195 aa  216  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  35.47 
 
 
1199 aa  217  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  30.64 
 
 
1176 aa  216  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  48.61 
 
 
1190 aa  216  1.9999999999999998e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  39.75 
 
 
1176 aa  216  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  49.76 
 
 
1198 aa  216  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1880  chromosome segregation protein SMC  47.83 
 
 
1165 aa  215  2.9999999999999995e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2952  chromosome segregation protein SMC  43.98 
 
 
1171 aa  214  7e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0128917  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  44.53 
 
 
1301 aa  214  1e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  43.16 
 
 
1176 aa  211  9e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  38.24 
 
 
1169 aa  210  1e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  43.37 
 
 
1171 aa  209  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  29.17 
 
 
1169 aa  210  2e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  42.62 
 
 
1191 aa  209  3e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  48.84 
 
 
1187 aa  208  5e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1250  chromosome segregation protein SMC  45.92 
 
 
1206 aa  208  6e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2366  chromosome segregation protein SMC  47.47 
 
 
1145 aa  207  8e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00122996  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  31.57 
 
 
1189 aa  207  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  31.57 
 
 
1189 aa  207  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  39.13 
 
 
1176 aa  207  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  47.19 
 
 
1198 aa  207  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0679  chromosome segregation protein SMC  38.87 
 
 
1168 aa  207  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  41.5 
 
 
1174 aa  206  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1337  chromosome segregation protein SMC  45.49 
 
 
1202 aa  206  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2065  chromosome segregation protein SMC  45.49 
 
 
1200 aa  206  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  41.5 
 
 
1174 aa  206  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3602  chromosome segregation protein SMC  43.15 
 
 
1162 aa  206  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111779  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  43.7 
 
 
1162 aa  206  3e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>