More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6942 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_4983  chromosome segregation protein SMC  52.68 
 
 
1154 aa  950    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127534  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0500  chromosome segregation protein SMC  54.51 
 
 
1152 aa  939    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.169399  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1981  chromosome segregation protein SMC  54.89 
 
 
1150 aa  867    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1095  chromosome segregation protein  51.9 
 
 
1153 aa  902    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0497  SMC family protein  54.42 
 
 
1152 aa  939    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3824  chromosome segregation protein SMC  55.6 
 
 
1151 aa  939    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0542546 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0613  chromosome segregation protein SMC  53.71 
 
 
1152 aa  946    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2608  chromosome segregation protein SMC  50.99 
 
 
1168 aa  920    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.198178  normal  0.335966 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0699  chromosome segregation protein SMC  49.1 
 
 
1153 aa  848    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0657  chromosome segregation protein SMC  51.72 
 
 
1153 aa  898    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.915586  normal  0.754344 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0716  chromosome segregation protein SMC  51.95 
 
 
1153 aa  912    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3248  condensin subunit Smc  48.27 
 
 
1167 aa  713    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1066  chromosome segregation protein SMC  51.83 
 
 
1154 aa  972    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0374  chromosome segregation protein SMC  45.78 
 
 
1151 aa  746    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4374  chromosome segregation protein SMC  51.04 
 
 
1154 aa  960    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.95695  normal  0.0465691 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1194  chromosome segregation protein SMC  52.29 
 
 
1154 aa  956    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3230  chromosome segregation protein SMC  51.08 
 
 
1170 aa  924    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2587  chromosome segregation protein SMC  45.97 
 
 
1151 aa  788    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000427179 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6942  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 
1144 aa  2053    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0702595 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0768  condensin subunit Smc  53.69 
 
 
1152 aa  874    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0547  chromosome segregation protein SMC  52.75 
 
 
1153 aa  927    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.725203 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0745  chromosome segregation protein SMC  51.3 
 
 
1150 aa  899    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.525394  normal  0.893736 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0163  chromosome segregation protein SMC  46.55 
 
 
1150 aa  678    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2318  condensin subunit Smc  50.39 
 
 
1154 aa  941    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7655  chromosome segregation protein SMC  76.88 
 
 
1148 aa  609  1e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00190533  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0144  chromosome segregation protein SMC  44.3 
 
 
1170 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0876  chromosome segregation protein SMC2  49.1 
 
 
1151 aa  443  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.601564  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2199  condensin subunit Smc  47.25 
 
 
1148 aa  436  1e-120  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.53129 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2536  chromosome segregation protein SMC  48.51 
 
 
1170 aa  432  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4694  chromosome segregation protein SMC  49.92 
 
 
1140 aa  423  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  32.66 
 
 
1176 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  32.82 
 
 
1176 aa  399  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  33.73 
 
 
1175 aa  396  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  32.74 
 
 
1176 aa  393  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  33.04 
 
 
1175 aa  388  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  32.55 
 
 
1171 aa  388  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  28.12 
 
 
1187 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  33.17 
 
 
1171 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  31.81 
 
 
1173 aa  379  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  33.2 
 
 
1198 aa  371  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  31.47 
 
 
1167 aa  367  1e-100  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  31.42 
 
 
1167 aa  367  1e-100  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  33.09 
 
 
1268 aa  363  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  27.51 
 
 
1185 aa  360  8e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4373  chromosome segregation protein SMC  54.97 
 
 
1153 aa  354  5e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.991905 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  32.56 
 
 
1167 aa  347  5e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  25.02 
 
 
1190 aa  343  2e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  28.87 
 
 
1177 aa  341  4e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  29.78 
 
 
1198 aa  341  5e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  27.48 
 
 
1179 aa  339  1.9999999999999998e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  26.54 
 
 
1186 aa  333  1e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2270  chromosome segregation protein SMC  61.01 
 
 
1147 aa  325  4e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2738  chromosome segregation protein SMC  56.32 
 
 
1167 aa  324  5e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  24.57 
 
 
1185 aa  322  1.9999999999999998e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0955  chromosome segregation protein SMC  55.19 
 
 
1147 aa  314  6.999999999999999e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.235362  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0064  SMC domain protein  44.57 
 
 
1511 aa  305  5.000000000000001e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0434137 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  25.86 
 
 
1191 aa  281  6e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  31.57 
 
 
1403 aa  280  9e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  21.7 
 
 
1180 aa  279  2e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0399  chromosome segregation protein SMC  47.37 
 
 
1165 aa  272  2e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.489923  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  26.07 
 
 
1181 aa  263  2e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1228  condensin subunit Smc  34.03 
 
 
1165 aa  228  7e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31729  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3590  chromosome segregation protein SMC  37.66 
 
 
1204 aa  226  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968509  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2681  chromosome segregation protein SMC  47.08 
 
 
1138 aa  224  7e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000886702  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2760  chromosome segregation protein SMC  47.08 
 
 
1138 aa  224  7e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.494661  unclonable  0.00000956134 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2656  chromosome segregation protein SMC  47.08 
 
 
1138 aa  224  7e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000574242  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  49.34 
 
 
1182 aa  223  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1703  chromosome segregation protein SMC  46.67 
 
 
1138 aa  223  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00557127  hitchhiker  0.00000000707845 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1514  SMC family protein  48.55 
 
 
1139 aa  223  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192441  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  33.92 
 
 
1162 aa  222  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  48.91 
 
 
1176 aa  222  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2379  chromosome segregation protein SMC  29.62 
 
 
1141 aa  221  7.999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.882333  unclonable  0.00000367062 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  45.85 
 
 
1195 aa  218  4e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2366  chromosome segregation protein SMC  46.25 
 
 
1145 aa  217  8e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00122996  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  50.92 
 
 
1199 aa  218  8e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  50.46 
 
 
1199 aa  216  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  50 
 
 
1199 aa  215  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2463  chromosome segregation protein SMC  47.19 
 
 
1144 aa  213  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000141924  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2516  chromosome segregation protein SMC  49.08 
 
 
1138 aa  212  4e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0576231  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  50.48 
 
 
1164 aa  211  7e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1736  chromosome segregation protein SMC  48.23 
 
 
814 aa  210  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00195971  unclonable  0.00000000014199 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  47.71 
 
 
1198 aa  209  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2849  chromosome segregation protein SMC  49.28 
 
 
1133 aa  209  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000354618  unclonable  0.0000000590997 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  45.21 
 
 
1164 aa  210  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2898  SMC family protein  35.13 
 
 
1145 aa  209  3e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  45.06 
 
 
1164 aa  208  4e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  45.06 
 
 
1164 aa  208  5e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2192  chromosome segregation protein SMC  34.94 
 
 
1234 aa  208  6e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3840  chromosome segregation protein SMC  42.24 
 
 
1162 aa  207  7e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.509302 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  47.89 
 
 
1190 aa  207  7e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1592  chromosome segregation protein SMC  42.24 
 
 
1162 aa  207  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.843365  normal  0.195769 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1506  chromosome segregation protein SMC  31.75 
 
 
1142 aa  207  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00012681  hitchhiker  0.00000000387349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1573  chromosome segregation protein SMC  29.58 
 
 
1142 aa  207  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00374514  hitchhiker  0.000804403 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4276  chromosome segregation protein SMC  42.29 
 
 
1162 aa  206  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  31.75 
 
 
1171 aa  206  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1687  chromosome segregation protein SMC  48.18 
 
 
1140 aa  205  3e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0207263  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  34.54 
 
 
1175 aa  205  4e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  40.16 
 
 
1168 aa  205  4e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3602  chromosome segregation protein SMC  42.29 
 
 
1162 aa  205  4e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111779  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  43.84 
 
 
1167 aa  204  6e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>