More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0768 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4373  chromosome segregation protein SMC  46.81 
 
 		 1153 aa  756    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.991905 
 
 
-
 
NC_004310  BR0497  SMC family protein  71.01 
 
 		 1152 aa  1438    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0613  chromosome segregation protein SMC  70.05 
 
 		 1152 aa  1420    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2608  chromosome segregation protein SMC  51.24 
 
 		 1168 aa  990    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.198178  normal  0.335966 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0547  chromosome segregation protein SMC  65.54 
 
 		 1153 aa  1313    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.725203 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3824  chromosome segregation protein SMC  54.31 
 
 		 1151 aa  1028    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0542546 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0716  chromosome segregation protein SMC  63.51 
 
 		 1153 aa  1293    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0699  chromosome segregation protein SMC  54.22 
 
 		 1153 aa  1018    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3248  condensin subunit Smc  46.65 
 
 		 1167 aa  759    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2318  condensin subunit Smc  52.69 
 
 		 1154 aa  1004    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1066  chromosome segregation protein SMC  52.63 
 
 		 1154 aa  1041    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0374  chromosome segregation protein SMC  46.31 
 
 		 1151 aa  849    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4374  chromosome segregation protein SMC  52.35 
 
 		 1154 aa  1039    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.95695  normal  0.0465691 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0745  chromosome segregation protein SMC  50.91 
 
 		 1150 aa  939    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.525394  normal  0.893736 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1194  chromosome segregation protein SMC  53.21 
 
 		 1154 aa  1032    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3230  chromosome segregation protein SMC  51.67 
 
 		 1170 aa  988    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1095  chromosome segregation protein  64.64 
 
 		 1153 aa  1300    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0768  condensin subunit Smc  100 
 
 		 1152 aa  2224    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0657  chromosome segregation protein SMC  63.25 
 
 		 1153 aa  1270    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.915586  normal  0.754344 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4983  chromosome segregation protein SMC  53.47 
 
 		 1154 aa  1028    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127534  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2199  condensin subunit Smc  43.54 
 
 		 1148 aa  717    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.53129 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0500  chromosome segregation protein SMC  71.09 
 
 		 1152 aa  1440    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.169399  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1981  chromosome segregation protein SMC  53.67 
 
 		 1150 aa  891    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  31.16 
 
 		 1169 aa  418  9.999999999999999e-116  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  30.91 
 
 		 1169 aa  418  9.999999999999999e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  33.17 
 
 		 1199 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  34 
 
 		 1199 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  33.17 
 
 		 1199 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  31.16 
 
 		 1177 aa  409  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  32.93 
 
 		 1162 aa  410  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  32.46 
 
 		 1167 aa  404  1e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  32.73 
 
 		 1162 aa  406  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  32.12 
 
 		 1162 aa  404  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  32.46 
 
 		 1167 aa  404  1e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  32.55 
 
 		 1176 aa  403  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4694  chromosome segregation protein SMC  45.12 
 
 		 1140 aa  403  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  30.98 
 
 		 1168 aa  397  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  31.19 
 
 		 1176 aa  399  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2366  chromosome segregation protein SMC  30.3 
 
 		 1145 aa  394  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00122996  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  31.71 
 
 		 1162 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1799  condensin subunit Smc  31.02 
 
 		 1162 aa  396  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0884011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  32.65 
 
 		 1198 aa  392  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  32.49 
 
 		 1171 aa  389  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  30.41 
 
 		 1173 aa  387  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  31.34 
 
 		 1171 aa  388  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1270  chromosome segregation protein SMC  30.98 
 
 		 1171 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845906  normal  0.0711674 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  30.76 
 
 		 1167 aa  386  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  29.5 
 
 		 1164 aa  382  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  29.32 
 
 		 1164 aa  379  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2587  chromosome segregation protein SMC  50.12 
 
 		 1151 aa  379  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000427179 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0163  chromosome segregation protein SMC  50.7 
 
 		 1150 aa  376  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0876  chromosome segregation protein SMC2  54.75 
 
 		 1151 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.601564  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0144  chromosome segregation protein SMC  55.03 
 
 		 1170 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  31.8 
 
 		 1167 aa  371  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2536  chromosome segregation protein SMC  55.03 
 
 		 1170 aa  372  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0161  chromosome segregation protein SMC  31.86 
 
 		 1167 aa  369  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7655  chromosome segregation protein SMC  60.56 
 
 		 1148 aa  369  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00190533  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  28.71 
 
 		 1189 aa  364  4e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  26.59 
 
 		 1185 aa  363  1e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  26.2 
 
 		 1189 aa  361  4e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0900  chromosome segregation protein SMC  31.84 
 
 		 1150 aa  355  4e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.188992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0753  chromosome segregation protein SMC  31.84 
 
 		 1150 aa  354  5.9999999999999994e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  26.35 
 
 		 1188 aa  350  8e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  26.35 
 
 		 1188 aa  350  8e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  26.35 
 
 		 1190 aa  345  2e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2738  chromosome segregation protein SMC  54.42 
 
 		 1167 aa  341  5e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  26.78 
 
 		 1186 aa  338  1.9999999999999998e-91  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0955  chromosome segregation protein SMC  41.1 
 
 		 1147 aa  330  7e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.235362  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  27.56 
 
 		 1186 aa  330  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  26.96 
 
 		 1184 aa  328  4.0000000000000003e-88  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6942  chromosome segregation protein SMC  68.4 
 
 		 1144 aa  328  5e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0702595 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  32.09 
 
 		 1194 aa  322  3.9999999999999996e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2270  chromosome segregation protein SMC  58.63 
 
 		 1147 aa  310  6.999999999999999e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0064  SMC domain protein  45.45 
 
 		 1511 aa  309  2.0000000000000002e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0434137 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  26.89 
 
 		 1179 aa  303  1e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  26.27 
 
 		 1170 aa  292  3e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0399  chromosome segregation protein SMC  57.76 
 
 		 1165 aa  280  1e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.489923  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  29.72 
 
 		 1162 aa  227  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  50 
 
 		 1176 aa  224  7e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1736  chromosome segregation protein SMC  50 
 
 		 814 aa  220  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00195971  unclonable  0.00000000014199 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  36.51 
 
 		 1162 aa  219  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1346  chromosome segregation protein SMC  38.62 
 
 		 1172 aa  218  7e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.333304  normal  0.300514 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  48.28 
 
 		 1195 aa  217  8e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2192  chromosome segregation protein SMC  32.99 
 
 		 1234 aa  217  8e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  45.98 
 
 		 1164 aa  217  9.999999999999999e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  50.23 
 
 		 1164 aa  216  2.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  33.01 
 
 		 1268 aa  213  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  35.86 
 
 		 1176 aa  213  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  45.78 
 
 		 1164 aa  214  1e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3602  chromosome segregation protein SMC  35.15 
 
 		 1162 aa  213  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3840  chromosome segregation protein SMC  36.62 
 
 		 1162 aa  213  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509302 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  42.52 
 
 		 1198 aa  213  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  45.57 
 
 		 1163 aa  212  3e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1928  chromosome segregation protein SMC  41.73 
 
 		 1170 aa  212  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.5125  normal  0.122807 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  41.37 
 
 		 1171 aa  212  4e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1592  chromosome segregation protein SMC  36.62 
 
 		 1162 aa  212  4e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.843365  normal  0.195769 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4276  chromosome segregation protein SMC  36.62 
 
 		 1162 aa  211  5e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2026  chromosome segregation protein SMC  41.73 
 
 		 1170 aa  211  5e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.676203  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1563  chromosome segregation protein SMC  41.73 
 
 		 1170 aa  211  6e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.438222  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5336  chromosome segregation protein SMC  41.73 
 
 		 1170 aa  211  6e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.119827 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>