More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0547 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0699  chromosome segregation protein SMC  50.95 
 
 		 1153 aa  957    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0497  SMC family protein  65.1 
 
 		 1152 aa  1293    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0613  chromosome segregation protein SMC  65.57 
 
 		 1152 aa  1303    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2608  chromosome segregation protein SMC  50.39 
 
 		 1168 aa  969    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.198178  normal  0.335966 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0500  chromosome segregation protein SMC  65.19 
 
 		 1152 aa  1297    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.169399  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3248  condensin subunit Smc  45.85 
 
 		 1167 aa  754    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2318  condensin subunit Smc  51.52 
 
 		 1154 aa  990    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1066  chromosome segregation protein SMC  51.3 
 
 		 1154 aa  999    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0374  chromosome segregation protein SMC  44.32 
 
 		 1151 aa  774    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4374  chromosome segregation protein SMC  51.26 
 
 		 1154 aa  1006    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.95695  normal  0.0465691 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1095  chromosome segregation protein  72.1 
 
 		 1153 aa  1508    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1194  chromosome segregation protein SMC  51.13 
 
 		 1154 aa  986    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3230  chromosome segregation protein SMC  49.96 
 
 		 1170 aa  957    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0547  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1153 aa  2248    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.725203 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1981  chromosome segregation protein SMC  51.42 
 
 		 1150 aa  878    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0745  chromosome segregation protein SMC  49.87 
 
 		 1150 aa  926    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.525394  normal  0.893736 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2587  chromosome segregation protein SMC  46.34 
 
 		 1151 aa  815    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000427179 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4983  chromosome segregation protein SMC  51.3 
 
 		 1154 aa  986    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127534  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0768  condensin subunit Smc  65.54 
 
 		 1152 aa  1199    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3824  chromosome segregation protein SMC  53.94 
 
 		 1151 aa  999    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0542546 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0657  chromosome segregation protein SMC  74.74 
 
 		 1153 aa  1535    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.915586  normal  0.754344 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4373  chromosome segregation protein SMC  44.53 
 
 		 1153 aa  712    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.991905 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0716  chromosome segregation protein SMC  74.65 
 
 		 1153 aa  1548    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2199  condensin subunit Smc  44.89 
 
 		 1148 aa  443  9.999999999999999e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.53129 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  32.88 
 
 		 1168 aa  409  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  32.34 
 
 		 1162 aa  403  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  32.98 
 
 		 1162 aa  400  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1573  chromosome segregation protein SMC  30.81 
 
 		 1142 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00374514  hitchhiker  0.000804403 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1567  chromosome segregation protein SMC  30.66 
 
 		 1142 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218486  hitchhiker  0.0000000844837 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  31.24 
 
 		 1171 aa  397  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2514  chromosome segregation protein SMC  33.66 
 
 		 1170 aa  399  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0530303 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1506  chromosome segregation protein SMC  31.34 
 
 		 1142 aa  398  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00012681  hitchhiker  0.00000000387349 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  31.09 
 
 		 1177 aa  397  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  32.95 
 
 		 1162 aa  393  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  32.05 
 
 		 1162 aa  391  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  32.34 
 
 		 1175 aa  391  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  32.22 
 
 		 1164 aa  389  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  30.7 
 
 		 1182 aa  385  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  28.53 
 
 		 1187 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  32.21 
 
 		 1167 aa  378  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1514  SMC family protein  30.65 
 
 		 1139 aa  380  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1457  chromosome segregation protein SMC  31.04 
 
 		 1173 aa  376  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7655  chromosome segregation protein SMC  61.67 
 
 		 1148 aa  376  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00190533  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  26.37 
 
 		 1185 aa  376  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  26.87 
 
 		 1189 aa  371  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0163  chromosome segregation protein SMC  54.14 
 
 		 1150 aa  369  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4694  chromosome segregation protein SMC  41.67 
 
 		 1140 aa  367  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  30.43 
 
 		 1190 aa  358  2.9999999999999997e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  28.2 
 
 		 1204 aa  358  3.9999999999999996e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  26.53 
 
 		 1190 aa  355  2.9999999999999997e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0876  chromosome segregation protein SMC2  53.24 
 
 		 1151 aa  353  8e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.601564  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2536  chromosome segregation protein SMC  53.24 
 
 		 1170 aa  351  3e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0144  chromosome segregation protein SMC  52.87 
 
 		 1170 aa  351  4e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  28.06 
 
 		 1189 aa  348  3e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  27.91 
 
 		 1174 aa  348  3e-94  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  27.54 
 
 		 1189 aa  347  7e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  27.54 
 
 		 1189 aa  347  7e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  27.74 
 
 		 1189 aa  346  1e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  27.91 
 
 		 1189 aa  345  2e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  27.91 
 
 		 1189 aa  344  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  27.91 
 
 		 1189 aa  344  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  27.83 
 
 		 1189 aa  343  9e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6942  chromosome segregation protein SMC  68.36 
 
 		 1144 aa  336  2e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0702595 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2738  chromosome segregation protein SMC  50.6 
 
 		 1167 aa  333  1e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  30.58 
 
 		 1179 aa  323  9.999999999999999e-87  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  27.3 
 
 		 1185 aa  322  3e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  28.14 
 
 		 1179 aa  320  9e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05690  chromosome segregation protein SMC  30.14 
 
 		 1184 aa  310  1.0000000000000001e-82  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.188799  normal  0.418307 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  26.27 
 
 		 1170 aa  305  3.0000000000000004e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  25.81 
 
 		 1170 aa  304  7.000000000000001e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0955  chromosome segregation protein SMC  49.61 
 
 		 1147 aa  301  6e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.235362  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2270  chromosome segregation protein SMC  56.36 
 
 		 1147 aa  300  8e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0064  SMC domain protein  42.29 
 
 		 1511 aa  297  6e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0434137 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  23.28 
 
 		 1180 aa  294  6e-78  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  30.51 
 
 		 1403 aa  292  3e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0399  chromosome segregation protein SMC  45.3 
 
 		 1165 aa  273  2e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.489923  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  23.49 
 
 		 1164 aa  268  2.9999999999999995e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  23.89 
 
 		 1153 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  32.07 
 
 		 1167 aa  234  5e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  32.07 
 
 		 1167 aa  234  6e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  31.35 
 
 		 1167 aa  223  1.9999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  52.53 
 
 		 1176 aa  221  7e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  47.54 
 
 		 1199 aa  221  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  47.72 
 
 		 1199 aa  221  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2898  SMC family protein  44.17 
 
 		 1145 aa  220  8.999999999999998e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1799  condensin subunit Smc  32.12 
 
 		 1162 aa  220  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0884011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2849  chromosome segregation protein SMC  50.68 
 
 		 1133 aa  219  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000354618  unclonable  0.0000000590997 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  35.59 
 
 		 1195 aa  219  2e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  30.03 
 
 		 1175 aa  219  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1736  chromosome segregation protein SMC  49.77 
 
 		 814 aa  219  2.9999999999999998e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00195971  unclonable  0.00000000014199 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  47.12 
 
 		 1199 aa  218  5e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2366  chromosome segregation protein SMC  44.88 
 
 		 1145 aa  217  9e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00122996  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3590  chromosome segregation protein SMC  49.78 
 
 		 1204 aa  216  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968509  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2192  chromosome segregation protein SMC  50.23 
 
 		 1234 aa  216  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  30.37 
 
 		 1171 aa  215  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  39.12 
 
 		 1169 aa  215  4.9999999999999996e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  39.65 
 
 		 1169 aa  214  5.999999999999999e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2516  chromosome segregation protein SMC  47.6 
 
 		 1138 aa  213  1e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0576231  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1228  condensin subunit Smc  30.7 
 
 		 1165 aa  213  2e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  30.04 
 
 		 1176 aa  213  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>