More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2270 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_0613  chromosome segregation protein SMC  43.08 
 
 		 1152 aa  702    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0497  SMC family protein  42.5 
 
 		 1152 aa  696    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1981  chromosome segregation protein SMC  43.43 
 
 		 1150 aa  655    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0547  chromosome segregation protein SMC  41.85 
 
 		 1153 aa  663    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.725203 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2318  condensin subunit Smc  42.12 
 
 		 1154 aa  676    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2608  chromosome segregation protein SMC  41.44 
 
 		 1168 aa  678    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.198178  normal  0.335966 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0699  chromosome segregation protein SMC  44.69 
 
 		 1153 aa  701    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0657  chromosome segregation protein SMC  42.17 
 
 		 1153 aa  673    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.915586  normal  0.754344 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0500  chromosome segregation protein SMC  42.77 
 
 		 1152 aa  695    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.169399  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1066  chromosome segregation protein SMC  41.57 
 
 		 1154 aa  693    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0955  chromosome segregation protein SMC  55.26 
 
 		 1147 aa  865    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.235362  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0374  chromosome segregation protein SMC  42.13 
 
 		 1151 aa  685    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1194  chromosome segregation protein SMC  41.27 
 
 		 1154 aa  697    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4694  chromosome segregation protein SMC  58.02 
 
 		 1140 aa  990    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2587  chromosome segregation protein SMC  42.26 
 
 		 1151 aa  690    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000427179 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2270  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1147 aa  2175    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0716  chromosome segregation protein SMC  41.95 
 
 		 1153 aa  679    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0745  chromosome segregation protein SMC  42.72 
 
 		 1150 aa  649    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.525394  normal  0.893736 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1095  chromosome segregation protein  42.33 
 
 		 1153 aa  691    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3824  chromosome segregation protein SMC  42.01 
 
 		 1151 aa  649    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0542546 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4983  chromosome segregation protein SMC  41.86 
 
 		 1154 aa  695    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127534  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2738  chromosome segregation protein SMC  45.49 
 
 		 1167 aa  401  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  29.66 
 
 		 1169 aa  397  1e-109  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  31.43 
 
 		 1167 aa  394  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  29.52 
 
 		 1169 aa  391  1e-107  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  28.49 
 
 		 1164 aa  390  1e-106  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  31.28 
 
 		 1167 aa  387  1e-106  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  31.28 
 
 		 1167 aa  388  1e-106  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  28.97 
 
 		 1176 aa  387  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  30.56 
 
 		 1168 aa  385  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  28.24 
 
 		 1164 aa  380  1e-103  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0161  chromosome segregation protein SMC  32.83 
 
 		 1167 aa  378  1e-103  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  31.21 
 
 		 1167 aa  374  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  29.61 
 
 		 1173 aa  376  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2379  chromosome segregation protein SMC  28.3 
 
 		 1141 aa  347  6e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.882333  unclonable  0.00000367062 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0163  chromosome segregation protein SMC  43.6 
 
 		 1150 aa  341  5.9999999999999996e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  25.12 
 
 		 1185 aa  336  1e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  30.51 
 
 		 1179 aa  329  2.0000000000000001e-88  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4374  chromosome segregation protein SMC  50 
 
 		 1154 aa  328  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.95695  normal  0.0465691 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3230  chromosome segregation protein SMC  48.77 
 
 		 1170 aa  318  5e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3248  condensin subunit Smc  50.79 
 
 		 1167 aa  316  1.9999999999999998e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  27.42 
 
 		 1177 aa  310  1.0000000000000001e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7655  chromosome segregation protein SMC  59.03 
 
 		 1148 aa  308  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00190533  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0768  condensin subunit Smc  61.07 
 
 		 1152 aa  303  1e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6942  chromosome segregation protein SMC  65.25 
 
 		 1144 aa  294  6e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0702595 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2199  condensin subunit Smc  64.93 
 
 		 1148 aa  293  2e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.53129 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0144  chromosome segregation protein SMC  60.89 
 
 		 1170 aa  291  6e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0876  chromosome segregation protein SMC2  60.57 
 
 		 1151 aa  290  2e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.601564  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2536  chromosome segregation protein SMC  60.57 
 
 		 1170 aa  288  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0064  SMC domain protein  65.53 
 
 		 1511 aa  283  2e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0434137 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4373  chromosome segregation protein SMC  58.85 
 
 		 1153 aa  281  6e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.991905 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0399  chromosome segregation protein SMC  57.71 
 
 		 1165 aa  278  6e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.489923  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  29.19 
 
 		 1403 aa  271  5e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  26.22 
 
 		 1181 aa  251  6e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  30.1 
 
 		 1191 aa  217  9.999999999999999e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  33.6 
 
 		 1175 aa  216  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1457  chromosome segregation protein SMC  37.85 
 
 		 1173 aa  214  4.9999999999999996e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  47.01 
 
 		 1176 aa  214  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1401  condensin subunit Smc  50.97 
 
 		 1168 aa  213  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.934786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0679  chromosome segregation protein SMC  51.22 
 
 		 1168 aa  212  3e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  50.5 
 
 		 1168 aa  211  8e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1880  chromosome segregation protein SMC  50.75 
 
 		 1165 aa  210  1e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1695  chromosome segregation protein SMC  31.51 
 
 		 1170 aa  209  2e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.573512  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  49.51 
 
 		 1171 aa  209  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  52.26 
 
 		 1175 aa  209  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  49.25 
 
 		 1176 aa  208  4e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  38.38 
 
 		 1301 aa  208  4e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  49.51 
 
 		 1171 aa  207  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  49.25 
 
 		 1176 aa  207  7e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  31.28 
 
 		 1162 aa  207  7e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  51.18 
 
 		 1175 aa  207  8e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  32.17 
 
 		 1190 aa  207  8e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  35.46 
 
 		 1199 aa  207  9e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  47.72 
 
 		 1164 aa  207  9e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  43.5 
 
 		 1177 aa  207  1e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3590  chromosome segregation protein SMC  38.13 
 
 		 1204 aa  206  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968509  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  49.77 
 
 		 1174 aa  204  9e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  38.37 
 
 		 1199 aa  204  9e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  38.12 
 
 		 1199 aa  203  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  33.21 
 
 		 1191 aa  203  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1228  condensin subunit Smc  47.44 
 
 		 1165 aa  204  9.999999999999999e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2019  chromosome segregation protein SMC  31.65 
 
 		 1170 aa  204  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  49.77 
 
 		 1174 aa  204  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  32.51 
 
 		 1162 aa  203  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  50 
 
 		 1177 aa  203  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  30.26 
 
 		 1195 aa  202  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3246  chromosome segregation protein SMC  31.18 
 
 		 1170 aa  202  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.318712  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2366  chromosome segregation protein SMC  45.16 
 
 		 1145 aa  202  3e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00122996  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2502  chromosome segregation protein SMC  31.18 
 
 		 1170 aa  202  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.240456  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2446  chromosome segregation protein SMC  31.18 
 
 		 1170 aa  202  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.889983  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  30.88 
 
 		 1162 aa  202  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1563  chromosome segregation protein SMC  31.18 
 
 		 1170 aa  201  5e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.438222  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  43.44 
 
 		 1198 aa  201  5e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  31.89 
 
 		 1174 aa  201  6e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4276  chromosome segregation protein SMC  41.49 
 
 		 1162 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2898  SMC family protein  48.24 
 
 		 1145 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  31.29 
 
 		 1268 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2065  chromosome segregation protein SMC  31.03 
 
 		 1200 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1337  chromosome segregation protein SMC  31.03 
 
 		 1202 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1567  chromosome segregation protein SMC  47.74 
 
 		 1142 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218486  hitchhiker  0.0000000844837 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>