51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0534 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0519  S-layer domain protein  84.12 
 
 		 466 aa  788    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.28861  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0534  S-layer domain-containing protein  100 
 
 		 466 aa  921    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00470893  normal  0.0913053 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1597  S-layer-like protein region  26.51 
 
 		 416 aa  69.7  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.408429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1771  S-layer domain-containing protein  24.9 
 
 		 361 aa  64.3  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.797057  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0331  S-layer-like protein region  28.57 
 
 		 946 aa  64.3  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.491966  hitchhiker  0.00612825 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0098  S-layer domain protein  29.69 
 
 		 424 aa  62.8  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3023  S-layer domain-containing protein  27.09 
 
 		 408 aa  62.8  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.80605  normal  0.105642 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0863  S-layer domain protein  30.77 
 
 		 694 aa  62  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000121904  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1724  S-layer domain-containing protein  27.94 
 
 		 441 aa  60.8  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000217367  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0715  S-layer domain-containing protein  47.17 
 
 		 1036 aa  59.3  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1096  S-layer domain-containing protein  27.31 
 
 		 403 aa  57.8  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000091055  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1024  S-layer domain-containing protein  27.31 
 
 		 403 aa  57.8  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000117034  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0047  S-layer domain-containing protein  24.91 
 
 		 468 aa  56.6  0.0000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498121  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0107  S-layer domain protein  25.63 
 
 		 919 aa  56.2  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000309483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11770  S-layer domain protein  26.49 
 
 		 255 aa  54.7  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.175649  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2990  S-layer domain-containing protein  27.19 
 
 		 932 aa  53.5  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000140027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0458  S-layer domain-containing protein  27.59 
 
 		 400 aa  52  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000061041  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1624  S-layer domain-containing protein  40 
 
 		 330 aa  52.4  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00805095  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17460  S-layer domain protein  28.16 
 
 		 784 aa  50.1  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3655  S-layer domain protein  30.05 
 
 		 673 aa  50.1  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.2791  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0176  S-layer domain-containing protein  40.98 
 
 		 343 aa  50.1  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000342894  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18280  S-layer domain protein  27.46 
 
 		 186 aa  48.9  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000785925  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  33.73 
 
 		 413 aa  48.5  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1031  S-layer domain-containing protein  36.26 
 
 		 225 aa  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354589  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0443  S-layer domain-containing protein  24.9 
 
 		 400 aa  47.8  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000189503  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1556  S-layer domain-containing protein  50 
 
 		 536 aa  47.8  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0013554 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1069  Carbohydrate-selective porin OprB  29.75 
 
 		 658 aa  47  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000390313  unclonable  0.000000000285099 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1227  S-layer protein, putative  36.26 
 
 		 219 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3135  hypothetical protein  54.05 
 
 		 624 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.189969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1180  S-layer domain protein  32.69 
 
 		 220 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0776761  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0239  hypothetical protein  29.59 
 
 		 563 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000660522  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4247  S-layer domain protein  30.71 
 
 		 629 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000142849  unclonable  0.000000000425549 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4159  S-layer domain protein  30.83 
 
 		 220 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.767768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1285  putative S-layer protein  36.26 
 
 		 219 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0266369  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  42.11 
 
 		 693 aa  44.7  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0755  hypothetical protein  42.5 
 
 		 1756 aa  45.1  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0517989  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1714  S-layer domain-containing protein  55.26 
 
 		 573 aa  44.7  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0324  porin  51.06 
 
 		 510 aa  44.7  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2012  porin  51.06 
 
 		 518 aa  45.1  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1999  porin  51.06 
 
 		 524 aa  44.7  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0137122  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0323  porin  51.06 
 
 		 513 aa  44.7  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222297  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3648  Carbohydrate-selective porin OprB  29.71 
 
 		 622 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000847402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0443  hypothetical protein  42.11 
 
 		 413 aa  43.9  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2214  S-layer domain protein  29.6 
 
 		 643 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000900458  normal  0.0461421 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4059  S-layer region-like  28.97 
 
 		 581 aa  43.9  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000841951  normal  0.105376 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  51.35 
 
 		 1029 aa  43.5  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4145  S-layer domain-containing protein  38.33 
 
 		 601 aa  43.5  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1095  porin  47.06 
 
 		 475 aa  43.5  0.008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.319287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1591  porin  47.06 
 
 		 528 aa  43.5  0.009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411467  hitchhiker  0.00286278 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1227  polysaccharide deacetylase  47.62 
 
 		 657 aa  43.1  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.18341  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  41.51 
 
 		 414 aa  43.1  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>