281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0176 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0176  S-layer domain-containing protein  100 
 
 
343 aa  673    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000342894  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1771  S-layer domain-containing protein  27.76 
 
 
361 aa  117  3e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.797057  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1724  S-layer domain-containing protein  26.74 
 
 
441 aa  116  6e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000217367  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1624  S-layer domain-containing protein  25.96 
 
 
330 aa  90.1  5e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00805095  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1024  S-layer domain-containing protein  26.89 
 
 
403 aa  86.3  7e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000117034  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1096  S-layer domain-containing protein  26.89 
 
 
403 aa  86.3  7e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000091055  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0047  S-layer domain-containing protein  26.19 
 
 
468 aa  85.1  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498121  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0458  S-layer domain-containing protein  26.33 
 
 
400 aa  82.8  0.000000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000061041  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11770  S-layer domain protein  38.98 
 
 
255 aa  82.4  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.175649  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0863  S-layer domain protein  28.32 
 
 
694 aa  79.3  0.00000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000121904  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0443  S-layer domain-containing protein  26.96 
 
 
400 aa  79  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000189503  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17460  S-layer domain protein  43.21 
 
 
784 aa  79  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0715  S-layer domain-containing protein  27.71 
 
 
1036 aa  76.3  0.0000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0331  S-layer-like protein region  28.37 
 
 
946 aa  73.9  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.491966  hitchhiker  0.00612825 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2990  S-layer domain-containing protein  39.29 
 
 
932 aa  69.3  0.00000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000140027  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18280  S-layer domain protein  41.03 
 
 
186 aa  68.2  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000785925  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1274  S-layer domain protein  52.08 
 
 
485 aa  67  0.0000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000376078  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1597  S-layer-like protein region  28.26 
 
 
416 aa  65.9  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.408429  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1839  S-layer domain protein  41.18 
 
 
575 aa  65.9  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0107  S-layer domain protein  44.44 
 
 
919 aa  65.1  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000309483  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0098  S-layer domain protein  25.16 
 
 
424 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3655  S-layer domain protein  29.13 
 
 
673 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.2791  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3023  S-layer domain-containing protein  34.74 
 
 
408 aa  63.2  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.80605  normal  0.105642 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1556  S-layer domain-containing protein  40.45 
 
 
536 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0013554 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2613  S-layer protein  41.18 
 
 
461 aa  60.1  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2530  S-layer protein  41.18 
 
 
461 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000347347  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2811  putative S-layer protein  41.18 
 
 
461 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000374812 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2803  S-layer protein  41.18 
 
 
461 aa  60.1  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0432636  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2853  putative S-layer protein  39.73 
 
 
461 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000112389  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0141  hypothetical protein  36.36 
 
 
758 aa  58.9  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1180  S-layer domain protein  38.96 
 
 
220 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0776761  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2681  S-layer domain protein  46.94 
 
 
1208 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0057  S-layer domain-containing protein  42.11 
 
 
318 aa  58.5  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000566138  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4159  S-layer domain protein  38.96 
 
 
220 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.767768  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  33.04 
 
 
629 aa  58.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1075  S-layer-like domain-containing protein  33.02 
 
 
376 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4693  S-layer protein  37.66 
 
 
268 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5054  S-layer protein  37.66 
 
 
268 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4937  putative S-layer protein  37.66 
 
 
272 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1149  S-layer domain protein  33.02 
 
 
376 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4952  S-layer protein, putative  37.66 
 
 
272 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3645  putative S-layer protein  45.45 
 
 
492 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3425  S-layer protein  45.45 
 
 
510 aa  56.2  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3386  S-layer protein  45.45 
 
 
510 aa  56.2  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.903804  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3695  s-layer protein  45.45 
 
 
510 aa  56.2  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3478  S-layer domain protein  41.38 
 
 
548 aa  56.2  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3667  putative S-layer protein  44.44 
 
 
502 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.290497  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3337  S-layer protein  43.64 
 
 
492 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1043  hypothetical protein  42.11 
 
 
754 aa  55.5  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4632  Excalibur domain-containing protein  37.66 
 
 
266 aa  55.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2155  S-layer-like domain-containing protein  41.54 
 
 
631 aa  54.7  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4247  S-layer domain protein  45.45 
 
 
629 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000142849  unclonable  0.000000000425549 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0903  S-layer protein  48.94 
 
 
379 aa  55.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000949153  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4918  putative S-layer protein  36.36 
 
 
272 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1234  carbohydrate-selective porin OprB  33.33 
 
 
639 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.373435  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3321  S-layer domain-containing protein  37.18 
 
 
492 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.752822  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4550  S-layer protein  36.36 
 
 
276 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1069  Carbohydrate-selective porin OprB  45.45 
 
 
658 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000390313  unclonable  0.000000000285099 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1031  S-layer domain-containing protein  38.89 
 
 
225 aa  54.3  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354589  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  28.42 
 
 
413 aa  53.9  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1714  S-layer domain-containing protein  38.46 
 
 
573 aa  53.9  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3603  Carbohydrate-selective porin OprB  40 
 
 
593 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0055182 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3604  Carbohydrate-selective porin OprB  40 
 
 
591 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0134108 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1501  Carbohydrate-selective porin OprB  38.46 
 
 
641 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.9541800000000004e-24 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1227  S-layer protein, putative  41.07 
 
 
219 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1471  Carbohydrate-selective porin OprB  36.67 
 
 
632 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.633309  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1285  putative S-layer protein  41.07 
 
 
219 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0266369  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2214  S-layer domain protein  43.64 
 
 
643 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000900458  normal  0.0461421 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1931  S-layer region-like  30.69 
 
 
606 aa  53.9  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.575111  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2160  S-layer protein  26.92 
 
 
383 aa  53.5  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.028807  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3093  S-layer protein  36.36 
 
 
360 aa  53.5  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000122253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2340  putative S-layer protein  26.92 
 
 
383 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2990  S-layer protein  36.36 
 
 
360 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000541964  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0823  S-layer domain protein  43.64 
 
 
578 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000211926  normal  0.0522919 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3315  putative S-layer protein  36.36 
 
 
360 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2315  S-layer protein  26.92 
 
 
383 aa  53.5  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144535  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3338  S-layer protein  36.36 
 
 
360 aa  53.5  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656673  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3648  Carbohydrate-selective porin OprB  43.64 
 
 
622 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000847402  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1445  Carbohydrate-selective porin OprB  36.67 
 
 
645 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0327  S-layer-like domain-containing protein  42 
 
 
857 aa  53.1  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1798  hypothetical protein  31.87 
 
 
218 aa  53.1  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.351482  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  41.43 
 
 
693 aa  53.1  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3466  Excalibur domain-containing protein  26.1 
 
 
272 aa  53.1  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  42.31 
 
 
1821 aa  53.1  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0243  hypothetical protein  36.59 
 
 
685 aa  53.1  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  37.04 
 
 
506 aa  52.8  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0432  Carbohydrate-selective porin OprB  38.33 
 
 
666 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0443  Carbohydrate-selective porin OprB  38.33 
 
 
666 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000473343  normal  0.0116841 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4705  Carbohydrate-selective porin OprB  28 
 
 
550 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1028  S-layer protein  40 
 
 
220 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.317814  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  28.42 
 
 
414 aa  52  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0077  S-layer domain protein  31.16 
 
 
1710 aa  52  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1448  Carbohydrate-selective porin OprB  41.82 
 
 
604 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0793  Carbohydrate-selective porin OprB  41.67 
 
 
551 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0151  S-layer domain ribonuclease  42.11 
 
 
1131 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.965938  hitchhiker  0.000000320353 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.57 
 
 
1029 aa  51.6  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0239  hypothetical protein  28.33 
 
 
563 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000660522  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0259  hypothetical protein  39.73 
 
 
669 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27195  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0120  S-layer domain protein  40.38 
 
 
767 aa  51.2  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0121  S-layer domain-containing ribonuclease  42.11 
 
 
1131 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104142 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>