126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1095 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1095  porin  100 
 
 		 475 aa  969    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.319287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2366  porin  85.2 
 
 		 561 aa  771    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.231063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11091  porin  63.42 
 
 		 555 aa  570  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.559273 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0323  porin  55.63 
 
 		 513 aa  422  1e-117  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222297  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0324  porin  54.35 
 
 		 510 aa  414  1e-114  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2367  porin  55.41 
 
 		 500 aa  413  1e-114  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26321  porin  53.13 
 
 		 543 aa  414  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1591  porin  53.64 
 
 		 528 aa  409  1e-113  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411467  hitchhiker  0.00286278 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1575  porin  54.12 
 
 		 514 aa  394  1e-108  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415305  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1999  porin  51.93 
 
 		 524 aa  390  1e-107  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0137122  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14071  porin  50.66 
 
 		 531 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2012  porin  46.09 
 
 		 518 aa  342  9e-93  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08801  hypothetical protein  71.98 
 
 		 188 aa  255  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0833  porin  50.83 
 
 		 544 aa  235  1.0000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039396  hitchhiker  0.000166509 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12581  hypothetical protein  36.58 
 
 		 515 aa  233  5e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00206869 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12591  hypothetical protein  35.1 
 
 		 515 aa  228  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.375416  hitchhiker  0.00229564 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2510  S-layer region-like  37.79 
 
 		 574 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000393409  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0838  carbohydrate-selective porin OprB  45.74 
 
 		 550 aa  209  6e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.832217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1464  porin  36.9 
 
 		 531 aa  208  1e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000540569  normal  0.0535262 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0200  hypothetical protein  39.66 
 
 		 533 aa  204  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2737  carbohydrate-selective porin OprB  46.13 
 
 		 542 aa  204  2e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08291  hypothetical protein  36 
 
 		 450 aa  203  5e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0885219  hitchhiker  0.0000555529 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4466  carbohydrate-selective porin OprB  41.79 
 
 		 491 aa  201  3e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.666985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1234  carbohydrate-selective porin OprB  42.25 
 
 		 639 aa  199  6e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.373435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1463  porin  40.31 
 
 		 543 aa  199  7.999999999999999e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000578184  normal  0.0560138 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3365  S-layer region-like  46.83 
 
 		 539 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.382297  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4465  carbohydrate-selective porin OprB  50.43 
 
 		 572 aa  197  3e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00227345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1069  Carbohydrate-selective porin OprB  48.41 
 
 		 658 aa  192  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000390313  unclonable  0.000000000285099 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1635  porin; major outer membrane protein  40 
 
 		 548 aa  191  2.9999999999999997e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00492408  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3648  Carbohydrate-selective porin OprB  47.96 
 
 		 622 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000847402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1607  porin; major outer membrane protein  35.03 
 
 		 518 aa  190  5e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.657278 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4536  S-layer region-like  43.06 
 
 		 624 aa  188  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3779  carbohydrate-selective porin OprB  48.47 
 
 		 561 aa  188  2e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000785609  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4059  S-layer region-like  42.76 
 
 		 581 aa  187  5e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000841951  normal  0.105376 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4440  S-layer region-like  46.12 
 
 		 531 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.016737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4247  S-layer domain protein  47.41 
 
 		 629 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000142849  unclonable  0.000000000425549 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2214  S-layer domain protein  44.91 
 
 		 643 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000900458  normal  0.0461421 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2174  S-layer region-like  44.77 
 
 		 530 aa  177  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.721353  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2677  carbohydrate-selective porin OprB  35.39 
 
 		 571 aa  176  8e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4567  carbohydrate-selective porin OprB  39.62 
 
 		 529 aa  176  9e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.316045  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1448  Carbohydrate-selective porin OprB  44.31 
 
 		 604 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0239  hypothetical protein  41.84 
 
 		 563 aa  172  7.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000660522  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4223  Carbohydrate-selective porin OprB  38.87 
 
 		 581 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.747154 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4184  Carbohydrate-selective porin OprB  38.87 
 
 		 581 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0823  S-layer domain protein  51.63 
 
 		 578 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000211926  normal  0.0522919 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0443  Carbohydrate-selective porin OprB  41.57 
 
 		 666 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000473343  normal  0.0116841 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0432  Carbohydrate-selective porin OprB  41.57 
 
 		 666 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2328  Carbohydrate-selective porin OprB  46.29 
 
 		 586 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2379  Carbohydrate-selective porin OprB  46.29 
 
 		 586 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.934978 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0793  Carbohydrate-selective porin OprB  40.47 
 
 		 551 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1931  S-layer region-like  36.42 
 
 		 606 aa  156  6e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.575111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1501  Carbohydrate-selective porin OprB  41.38 
 
 		 641 aa  156  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.9541800000000004e-24 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4140  S-layer region-like  35.01 
 
 		 600 aa  155  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0020254  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3603  Carbohydrate-selective porin OprB  36.34 
 
 		 593 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0055182 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4515  carbohydrate-selective porin OprB  37.61 
 
 		 589 aa  149  8e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0777365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3604  Carbohydrate-selective porin OprB  34.57 
 
 		 591 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0134108 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1471  Carbohydrate-selective porin OprB  40.17 
 
 		 632 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.633309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1445  Carbohydrate-selective porin OprB  40.85 
 
 		 645 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4705  Carbohydrate-selective porin OprB  42.78 
 
 		 550 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12401  porin  36.8 
 
 		 449 aa  132  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.137225  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1923  S-layer domain protein  41.27 
 
 		 527 aa  129  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0684445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0023  major outer membrane protein  37.4 
 
 		 568 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.500646  normal  0.0378832 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16211  porin-like protein  28.79 
 
 		 415 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.191112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0777  porin-like protein  28.62 
 
 		 414 aa  112  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2437  hypothetical protein  35 
 
 		 508 aa  111  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0721  porin precursor-like  34.34 
 
 		 440 aa  110  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1264  porin-like  29.51 
 
 		 437 aa  99.8  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13641  porin-like protein  31.03 
 
 		 432 aa  96.3  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1515  hypothetical protein  32.34 
 
 		 384 aa  92.8  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.116312  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1122  S-layer domain protein  41.28 
 
 		 261 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13341  porin  26.34 
 
 		 426 aa  90.1  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1028  hypothetical protein  26.1 
 
 		 409 aa  88.6  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2542  S-layer domain protein  37.18 
 
 		 262 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89792  normal  0.0876667 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3571  S-layer domain protein  37.18 
 
 		 262 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13551  porin-like protein  29.36 
 
 		 432 aa  85.5  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.564802  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18981  hypothetical protein  26.56 
 
 		 390 aa  82  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1512  hypothetical protein  30.67 
 
 		 431 aa  71.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.486809  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1131  porin precursor-like  31.28 
 
 		 371 aa  64.3  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00125322  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1274  S-layer domain protein  35.11 
 
 		 485 aa  63.5  0.000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000376078  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12271  porin  31.72 
 
 		 385 aa  63.5  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.319358  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1597  S-layer-like protein region  37.5 
 
 		 416 aa  62.4  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.408429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12121  porin  27.53 
 
 		 383 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19301  hypothetical protein  30.41 
 
 		 336 aa  61.6  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.665373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1057  porin-like protein  30.05 
 
 		 335 aa  60.1  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12111  hypothetical protein  27.05 
 
 		 415 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2990  S-layer domain-containing protein  35.35 
 
 		 932 aa  59.3  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000140027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1757  porin-like protein  30.11 
 
 		 332 aa  58.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0331  S-layer-like protein region  30.13 
 
 		 946 aa  57.4  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.491966  hitchhiker  0.00612825 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0107  S-layer domain protein  36.46 
 
 		 919 aa  57  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000309483  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3655  S-layer domain protein  35.34 
 
 		 673 aa  56.2  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.2791  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0715  S-layer domain-containing protein  31.76 
 
 		 1036 aa  56.6  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3023  S-layer domain-containing protein  38.46 
 
 		 408 aa  54.3  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.80605  normal  0.105642 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1724  S-layer domain-containing protein  31.63 
 
 		 441 aa  53.5  0.000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000217367  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12261  porin  57.14 
 
 		 399 aa  53.5  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04791  hypothetical protein  29.51 
 
 		 333 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0282732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1771  S-layer domain-containing protein  41.67 
 
 		 361 aa  52.4  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.797057  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17460  S-layer domain protein  34.29 
 
 		 784 aa  52.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0243  hypothetical protein  51.06 
 
 		 685 aa  51.2  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12271  porin  30.6 
 
 		 355 aa  50.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11770  S-layer domain protein  34.88 
 
 		 255 aa  50.8  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.175649  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>