243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1724 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1724  S-layer domain-containing protein  100 
 
 		 441 aa  870    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000217367  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0176  S-layer domain-containing protein  26.74 
 
 		 343 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000342894  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0443  S-layer domain-containing protein  26.75 
 
 		 400 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000189503  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0458  S-layer domain-containing protein  26.68 
 
 		 400 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000061041  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1771  S-layer domain-containing protein  30.74 
 
 		 361 aa  102  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.797057  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0047  S-layer domain-containing protein  24.17 
 
 		 468 aa  95.5  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498121  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1024  S-layer domain-containing protein  25.38 
 
 		 403 aa  94.7  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000117034  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1096  S-layer domain-containing protein  25.38 
 
 		 403 aa  94.7  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000091055  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1624  S-layer domain-containing protein  29.96 
 
 		 330 aa  94  4e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00805095  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1717  hypothetical protein  27.48 
 
 		 315 aa  92.4  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000692892  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0715  S-layer domain-containing protein  27.33 
 
 		 1036 aa  84.3  0.000000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2990  S-layer domain-containing protein  38.18 
 
 		 932 aa  81.3  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000140027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0331  S-layer-like protein region  28 
 
 		 946 aa  80.5  0.00000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.491966  hitchhiker  0.00612825 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0107  S-layer domain protein  27.47 
 
 		 919 aa  79.3  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000309483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3023  S-layer domain-containing protein  25.51 
 
 		 408 aa  76.3  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.80605  normal  0.105642 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0098  S-layer domain protein  57.69 
 
 		 424 aa  75.1  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17460  S-layer domain protein  35.96 
 
 		 784 aa  74.7  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1597  S-layer-like protein region  28.82 
 
 		 416 aa  72.8  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.408429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0863  S-layer domain protein  26.97 
 
 		 694 aa  71.6  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000121904  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0057  S-layer domain-containing protein  22.15 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000566138  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11770  S-layer domain protein  25 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.175649  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18280  S-layer domain protein  29.52 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000785925  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2613  S-layer protein  43.06 
 
 		 461 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2530  S-layer protein  43.06 
 
 		 461 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000347347  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3655  S-layer domain protein  42.37 
 
 		 673 aa  66.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.2791  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2803  S-layer protein  43.06 
 
 		 461 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0432636  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2811  putative S-layer protein  43.06 
 
 		 461 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000374812 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0601  hypothetical protein  48 
 
 		 546 aa  63.5  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  40 
 
 		 413 aa  62  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0534  S-layer domain-containing protein  27.94 
 
 		 466 aa  60.8  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00470893  normal  0.0913053 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2853  putative S-layer protein  40.28 
 
 		 461 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000112389  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2478  S-layer domain-containing protein  40 
 
 		 387 aa  59.7  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0177612  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  34.29 
 
 		 414 aa  59.7  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3178  hypothetical protein  45.1 
 
 		 552 aa  58.9  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.925927  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1274  S-layer domain protein  41.67 
 
 		 485 aa  58.5  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000376078  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1031  S-layer domain-containing protein  42.59 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354589  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2012  porin  32.65 
 
 		 518 aa  57.8  0.0000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0443  hypothetical protein  39.68 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1556  S-layer domain-containing protein  37.14 
 
 		 536 aa  57.8  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0013554 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1999  porin  32.65 
 
 		 524 aa  57.4  0.0000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0137122  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4827  S-layer domain-containing protein  46 
 
 		 521 aa  57  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3478  S-layer domain protein  39.66 
 
 		 548 aa  57  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0323  porin  32.65 
 
 		 513 aa  57  0.0000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222297  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0324  porin  32.65 
 
 		 510 aa  57  0.0000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1839  S-layer domain protein  35.14 
 
 		 575 aa  56.6  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08801  hypothetical protein  30.61 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3267  S-layer domain protein  40.82 
 
 		 211 aa  56.2  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.698086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4440  S-layer region-like  35.21 
 
 		 531 aa  55.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.016737  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0842  S-layer protein EA1  35.38 
 
 		 862 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00698001  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0789  S-layer protein  35.94 
 
 		 880 aa  55.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.229168  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0200  hypothetical protein  35.21 
 
 		 533 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0887  s-layer protein ea1  35.38 
 
 		 862 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000735579  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0243  hypothetical protein  37.31 
 
 		 685 aa  55.5  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  37.5 
 
 		 1821 aa  54.7  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3365  S-layer region-like  38.71 
 
 		 539 aa  54.7  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.382297  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1575  porin  31.63 
 
 		 514 aa  55.1  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415305  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1714  S-layer domain-containing protein  37.5 
 
 		 573 aa  54.3  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2510  S-layer region-like  35.21 
 
 		 574 aa  54.3  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000393409  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4228  hypothetical protein  47.73 
 
 		 693 aa  54.7  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0087  S-layer domain protein  45.1 
 
 		 1223 aa  54.3  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1591  porin  31.63 
 
 		 528 aa  54.7  0.000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411467  hitchhiker  0.00286278 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2367  porin  31.63 
 
 		 500 aa  54.3  0.000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  51.11 
 
 		 629 aa  54.3  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2303  S-layer domain protein  48.84 
 
 		 1018 aa  54.3  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3779  carbohydrate-selective porin OprB  35.21 
 
 		 561 aa  54.7  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000785609  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26321  porin  30.61 
 
 		 543 aa  54.3  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0790  S-layer protein, EA1 protein  33.85 
 
 		 861 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0118731  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11091  porin  30.61 
 
 		 555 aa  54.3  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.559273 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0120  S-layer domain protein  34.33 
 
 		 767 aa  53.9  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  37.25 
 
 		 558 aa  53.5  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2155  S-layer-like domain-containing protein  32.39 
 
 		 631 aa  53.5  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1931  S-layer region-like  34.85 
 
 		 606 aa  53.5  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.575111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2366  porin  31.63 
 
 		 561 aa  53.1  0.000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.231063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1180  S-layer domain protein  41.82 
 
 		 220 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0776761  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46 
 
 		 1029 aa  53.1  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1095  porin  31.63 
 
 		 475 aa  53.1  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.319287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4159  S-layer domain protein  41.82 
 
 		 220 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.767768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0673  S-layer domain protein  36.67 
 
 		 431 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3648  Carbohydrate-selective porin OprB  23.79 
 
 		 622 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000847402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1065  S-layer protein EA1  32.31 
 
 		 859 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000432724  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  34.21 
 
 		 760 aa  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3962  putative internalin  34.21 
 
 		 760 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.769038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14071  porin  29.59 
 
 		 531 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0124  s-layer protein  26.13 
 
 		 652 aa  51.6  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3135  hypothetical protein  43.18 
 
 		 624 aa  51.2  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.189969  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2737  carbohydrate-selective porin OprB  33.8 
 
 		 542 aa  51.6  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1234  carbohydrate-selective porin OprB  38.33 
 
 		 639 aa  51.6  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.373435  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1050  S-layer protein  41.07 
 
 		 218 aa  51.2  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76784  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3132  S-layer domain protein  34.78 
 
 		 478 aa  51.2  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000238751  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2214  S-layer domain protein  25 
 
 		 643 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000900458  normal  0.0461421 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1208  putative S-layer protein  41.07 
 
 		 218 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.447852 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1130  S-layer protein  41.07 
 
 		 218 aa  51.2  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0431486  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1448  Carbohydrate-selective porin OprB  33.33 
 
 		 604 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4247  S-layer domain protein  33.33 
 
 		 629 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000142849  unclonable  0.000000000425549 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0484  S-layer domain-containing protein  30.51 
 
 		 586 aa  50.8  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000124996  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2561  S-layer protein  32.84 
 
 		 189 aa  50.4  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0213857  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0259  hypothetical protein  36.21 
 
 		 669 aa  50.4  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1245  NEAr transporter  44 
 
 		 766 aa  50.4  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1285  putative S-layer protein  37.5 
 
 		 219 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0266369  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1069  Carbohydrate-selective porin OprB  33.33 
 
 		 658 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000390313  unclonable  0.000000000285099 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>