195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0458 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0458  S-layer domain-containing protein  100 
 
 
400 aa  795    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000061041  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0443  S-layer domain-containing protein  96 
 
 
400 aa  770    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000189503  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1096  S-layer domain-containing protein  28.6 
 
 
403 aa  117  3e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000091055  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1024  S-layer domain-containing protein  28.6 
 
 
403 aa  117  3e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000117034  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1724  S-layer domain-containing protein  26.68 
 
 
441 aa  110  6e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000217367  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0047  S-layer domain-containing protein  25.74 
 
 
468 aa  87  5e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498121  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1624  S-layer domain-containing protein  26.67 
 
 
330 aa  86.7  7e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00805095  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1771  S-layer domain-containing protein  24.29 
 
 
361 aa  85.5  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.797057  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0176  S-layer domain-containing protein  26.33 
 
 
343 aa  82.8  0.000000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000342894  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0863  S-layer domain protein  24.45 
 
 
694 aa  79  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000121904  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11770  S-layer domain protein  27.52 
 
 
255 aa  74.3  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.175649  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0715  S-layer domain-containing protein  25.59 
 
 
1036 aa  73.6  0.000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17460  S-layer domain protein  42.86 
 
 
784 aa  72.4  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0331  S-layer-like protein region  25.85 
 
 
946 aa  70.9  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.491966  hitchhiker  0.00612825 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0057  S-layer domain-containing protein  27.81 
 
 
318 aa  70.1  0.00000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000566138  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2990  S-layer domain-containing protein  26.45 
 
 
932 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000140027  normal 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3655  S-layer domain protein  45.31 
 
 
673 aa  63.9  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.2791  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18280  S-layer domain protein  31.9 
 
 
186 aa  64.3  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000785925  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0098  S-layer domain protein  45.59 
 
 
424 aa  61.2  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3023  S-layer domain-containing protein  42.25 
 
 
408 aa  60.5  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.80605  normal  0.105642 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2613  S-layer protein  24.63 
 
 
461 aa  60.1  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2803  S-layer protein  24.63 
 
 
461 aa  60.1  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0432636  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1597  S-layer-like protein region  50 
 
 
416 aa  60.1  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.408429  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0107  S-layer domain protein  41.43 
 
 
919 aa  60.1  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000309483  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2530  S-layer protein  24.14 
 
 
461 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000347347  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2811  putative S-layer protein  24.14 
 
 
461 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000374812 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  38.55 
 
 
1821 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0715  S-layer domain-containing protein  39.44 
 
 
879 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1098  hypothetical protein  30.77 
 
 
327 aa  58.5  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000190359  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  36.14 
 
 
506 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1064  crystal protein  29.06 
 
 
822 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000577462  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1274  S-layer domain protein  52.08 
 
 
485 aa  57.8  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000376078  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1931  S-layer region-like  47.46 
 
 
606 aa  57  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.575111  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1839  S-layer domain protein  40.3 
 
 
575 aa  55.8  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0714  Ig domain-containing protein  31.82 
 
 
807 aa  55.5  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000270996  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1556  S-layer domain-containing protein  41.54 
 
 
536 aa  54.7  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0013554 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1180  S-layer domain protein  35.8 
 
 
220 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0776761  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1717  hypothetical protein  26.05 
 
 
315 aa  54.7  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000692892  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0789  S-layer protein sap precursor  35.21 
 
 
814 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0200088  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3337  S-layer protein  37.31 
 
 
492 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2853  putative S-layer protein  40 
 
 
461 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000112389  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3645  putative S-layer protein  37.31 
 
 
492 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4159  S-layer domain protein  35.8 
 
 
220 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.767768  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3425  S-layer protein  37.31 
 
 
510 aa  53.5  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3695  s-layer protein  37.31 
 
 
510 aa  53.5  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3386  S-layer protein  37.31 
 
 
510 aa  53.1  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.903804  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3321  S-layer domain-containing protein  37.31 
 
 
492 aa  53.5  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.752822  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1065  S-layer protein EA1  35.21 
 
 
859 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000432724  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0841  S-layer protein Sap  35.21 
 
 
814 aa  53.1  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0822684  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0885  s-layer protein sap  35.21 
 
 
814 aa  53.1  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1227  S-layer protein, putative  41.07 
 
 
219 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  32.39 
 
 
414 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3365  S-layer region-like  37.88 
 
 
539 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.382297  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1285  putative S-layer protein  41.07 
 
 
219 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0266369  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4465  carbohydrate-selective porin OprB  31.3 
 
 
572 aa  52.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00227345  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3667  putative S-layer protein  37.31 
 
 
502 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.290497  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2303  S-layer domain protein  54.05 
 
 
1018 aa  52  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2510  S-layer region-like  37.88 
 
 
574 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000393409  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0327  S-layer-like domain-containing protein  42 
 
 
857 aa  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0534  S-layer domain-containing protein  27.59 
 
 
466 aa  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00470893  normal  0.0913053 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  28.21 
 
 
413 aa  51.2  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0200  hypothetical protein  37.88 
 
 
533 aa  51.2  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2681  S-layer domain protein  38.27 
 
 
1208 aa  51.2  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08801  hypothetical protein  29.25 
 
 
188 aa  51.6  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  36.51 
 
 
558 aa  50.8  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4247  S-layer domain protein  41.07 
 
 
629 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000142849  unclonable  0.000000000425549 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2155  S-layer-like domain-containing protein  36.59 
 
 
631 aa  50.8  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1031  S-layer domain-containing protein  42.59 
 
 
225 aa  50.4  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354589  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  50 
 
 
1029 aa  50.8  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1448  Carbohydrate-selective porin OprB  44.44 
 
 
604 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2214  S-layer domain protein  39.29 
 
 
643 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000900458  normal  0.0461421 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0823  S-layer domain protein  35.96 
 
 
578 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000211926  normal  0.0522919 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4440  S-layer region-like  36.36 
 
 
531 aa  50.1  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.016737  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1069  Carbohydrate-selective porin OprB  41.07 
 
 
658 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000390313  unclonable  0.000000000285099 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0842  S-layer protein EA1  29.91 
 
 
862 aa  50.1  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00698001  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0887  s-layer protein ea1  29.91 
 
 
862 aa  50.1  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000735579  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3779  carbohydrate-selective porin OprB  36.36 
 
 
561 aa  50.1  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000785609  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3648  Carbohydrate-selective porin OprB  39.29 
 
 
622 aa  49.7  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000847402  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1999  porin  29.58 
 
 
524 aa  49.7  0.00009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0137122  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1485  putative internalin  46.67 
 
 
766 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1444  internalin, putative  46.67 
 
 
755 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101045  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1889  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.5 
 
 
414 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000270589  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1245  NEAr transporter  39.13 
 
 
766 aa  49.3  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2677  carbohydrate-selective porin OprB  38.71 
 
 
571 aa  49.3  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1938  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  37.5 
 
 
414 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000112204  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0790  S-layer protein, EA1 protein  33.8 
 
 
861 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0118731  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2737  carbohydrate-selective porin OprB  37.88 
 
 
542 aa  49.3  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2012  porin  46.15 
 
 
518 aa  49.3  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1575  porin  28.05 
 
 
514 aa  48.9  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415305  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0243  hypothetical protein  39.33 
 
 
685 aa  49.3  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1234  carbohydrate-selective porin OprB  42 
 
 
639 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.373435  normal 
 
 
-
 
NC_011720  BbuZS7_AC14  repeat motif-containing protein  33.57 
 
 
213 aa  49.7  0.0001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.577398  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1890  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  40 
 
 
470 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00294488  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1122  S-layer domain protein  34.33 
 
 
261 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0601  hypothetical protein  40 
 
 
546 aa  48.5  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4140  S-layer region-like  39.39 
 
 
600 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0020254  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1501  Carbohydrate-selective porin OprB  40.68 
 
 
641 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.9541800000000004e-24 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1863  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 4  37.5 
 
 
459 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27744e-53 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1991  hypothetical protein  31 
 
 
625 aa  48.5  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.897372  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3604  Carbohydrate-selective porin OprB  39.34 
 
 
591 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0134108 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>