More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1227 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1227  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
657 aa  1338    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.18341  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0615  polysaccharide deacetylase  54.05 
 
 
843 aa  440  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00286732 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1231  polysaccharide deacetylase  51.14 
 
 
630 aa  405  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.534738  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3554  polysaccharide deacetylase  50.11 
 
 
630 aa  388  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1230  polysaccharide deacetylase  45.73 
 
 
482 aa  362  2e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3555  polysaccharide deacetylase  44.44 
 
 
487 aa  326  1e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3178  S-layer domain-containing protein  58.33 
 
 
1518 aa  207  4e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  unclonable  0.0033347  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2337  polysaccharide deacetylase  40.91 
 
 
500 aa  205  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00797389  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3184  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  51.28 
 
 
1687 aa  187  8e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1243  heme peroxidase  53.44 
 
 
1625 aa  185  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.941188  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  51.85 
 
 
1129 aa  183  8.000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3167  S-layer domain-containing protein  51.05 
 
 
637 aa  182  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3166  Allergen V5/Tpx-1 family protein  47.89 
 
 
461 aa  179  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3165  Allergen V5/Tpx-1 family protein  51.31 
 
 
568 aa  178  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.845212  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4145  S-layer domain-containing protein  42.08 
 
 
601 aa  175  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3169  S-layer domain-containing protein  47.74 
 
 
533 aa  173  7.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0880  polysaccharide deacetylase  37.55 
 
 
271 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1639  polysaccharide deacetylase domain protein  33.06 
 
 
269 aa  135  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4171  LGFP repeat protein  40.32 
 
 
617 aa  130  9.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.621321 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  31.84 
 
 
1821 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2613  S-layer protein  34.48 
 
 
461 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2811  putative S-layer protein  34.48 
 
 
461 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000374812 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2530  S-layer protein  34.48 
 
 
461 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000347347  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2803  S-layer protein  34.48 
 
 
461 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0432636  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  31.67 
 
 
506 aa  84  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3123  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.08 
 
 
640 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00188421  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2853  putative S-layer protein  32.37 
 
 
461 aa  82  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000112389  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2680  S-layer domain-containing protein  31.07 
 
 
1174 aa  78.6  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  31.98 
 
 
693 aa  78.2  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0151  S-layer domain ribonuclease  32.95 
 
 
1131 aa  77.8  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.965938  hitchhiker  0.000000320353 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0077  S-layer protein  32.56 
 
 
697 aa  77.4  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0803176  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0121  S-layer domain-containing ribonuclease  32.95 
 
 
1131 aa  77.4  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104142 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1043  hypothetical protein  28.32 
 
 
754 aa  76.6  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3124  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.32 
 
 
471 aa  77  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0129818  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1205  putative S-layer protein  31.49 
 
 
223 aa  75.1  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.567806 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1048  S-layer protein  31.49 
 
 
223 aa  75.1  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000983689  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1127  S-layer protein  31.49 
 
 
223 aa  75.1  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.600339  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1431  S-layer domain-containing protein  33.52 
 
 
458 aa  74.7  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2108  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.89 
 
 
995 aa  74.7  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557195  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2129  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.54 
 
 
1328 aa  73.9  0.000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0900  S-layer protein  32.7 
 
 
578 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000625317  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0559  S-layer domain protein  28.57 
 
 
1168 aa  73.6  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  35.25 
 
 
598 aa  73.6  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  40.37 
 
 
333 aa  73.2  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0903  S-layer protein  33.71 
 
 
379 aa  72  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000949153  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1026  S-layer protein  31.76 
 
 
223 aa  72  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00354744  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2364  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.57 
 
 
1234 aa  72  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00562436  hitchhiker  0.0000368528 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1225  S-layer protein, putative  30.39 
 
 
223 aa  71.2  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2160  S-layer protein  33.53 
 
 
383 aa  70.9  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.028807  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2315  S-layer protein  33.53 
 
 
383 aa  70.9  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144535  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2340  putative S-layer protein  33.53 
 
 
383 aa  70.9  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2795  polysaccharide deacetylase  26.36 
 
 
600 aa  70.9  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0146758 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0881  S-layer domain-containing protein  30.99 
 
 
578 aa  70.5  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000484445  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.95 
 
 
1029 aa  70.5  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2998  S-layer domain-containing protein  33.09 
 
 
926 aa  70.1  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  28.26 
 
 
932 aa  70.5  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3466  Excalibur domain-containing protein  29.61 
 
 
272 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1180  S-layer domain protein  28.49 
 
 
220 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0776761  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0077  S-layer domain protein  30.18 
 
 
1710 aa  68.6  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0818  hypothetical protein  31.46 
 
 
717 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4159  S-layer domain protein  28.49 
 
 
220 aa  68.6  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.767768  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0755  hypothetical protein  28 
 
 
1756 aa  68.6  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0517989  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0327  S-layer-like domain-containing protein  30.88 
 
 
857 aa  68.6  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4676  polysaccharide deacetylase  35.38 
 
 
322 aa  68.6  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1505  S-layer-like domain-containing protein  30 
 
 
223 aa  68.2  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1282  putative S-layer protein  29.83 
 
 
223 aa  67.8  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106151  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4952  S-layer protein, putative  30.11 
 
 
272 aa  67.4  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1207  putative S-layer protein  29.61 
 
 
219 aa  67.4  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.341169 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  31.08 
 
 
1226 aa  67.4  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3093  S-layer domain-containing protein  37.19 
 
 
935 aa  67  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4937  putative S-layer protein  30.11 
 
 
272 aa  67  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4632  Excalibur domain-containing protein  30.86 
 
 
266 aa  67  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4550  S-layer protein  30.29 
 
 
276 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1284  putative S-layer protein  30.17 
 
 
219 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0896591  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4693  S-layer protein  29.55 
 
 
268 aa  66.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1149  S-layer domain protein  31.58 
 
 
376 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5054  S-layer protein  29.55 
 
 
268 aa  66.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1208  putative S-layer protein  28.41 
 
 
218 aa  65.5  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.447852 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0916  S-layer protein  30.7 
 
 
577 aa  65.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0018351  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1050  S-layer protein  28.41 
 
 
218 aa  65.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0884  S-layer protein  30.19 
 
 
578 aa  65.9  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000197101  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1019  putative S-layer protein  30.05 
 
 
577 aa  65.5  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0271963  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0981  s-layer protein  30.7 
 
 
577 aa  65.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000154114  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1130  S-layer protein  28.41 
 
 
218 aa  65.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0431486  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1226  S-layer protein, putative  29.61 
 
 
275 aa  65.1  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.686146  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1227  S-layer protein, putative  28.09 
 
 
219 aa  65.1  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1028  S-layer protein  29.78 
 
 
220 aa  65.1  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.317814  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  32.02 
 
 
1847 aa  65.1  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2794  polysaccharide deacetylase  30.97 
 
 
597 aa  65.1  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0412434 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4285  S-layer domain protein  30.05 
 
 
577 aa  65.1  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00013823  normal  0.102971 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1030  S-layer domain-containing protein  29.38 
 
 
218 aa  64.7  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1027  S-layer protein  30.17 
 
 
219 aa  64.7  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0927071  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1285  putative S-layer protein  28.09 
 
 
219 aa  64.7  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0266369  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0656  hypothetical protein  32.91 
 
 
660 aa  64.7  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000140636  hitchhiker  0.000000360107 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1075  S-layer-like domain-containing protein  30.99 
 
 
376 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3425  S-layer protein  29.41 
 
 
510 aa  63.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3122  S-layer-like domain-containing protein  25.6 
 
 
692 aa  63.2  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1129  S-layer protein  28.57 
 
 
219 aa  63.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.401991  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3695  s-layer protein  29.41 
 
 
510 aa  63.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  29.41 
 
 
444 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>