67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1230 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1230  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 482 aa  979    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3555  polysaccharide deacetylase  63.62 
 
 		 487 aa  595  1e-169  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1231  polysaccharide deacetylase  54.7 
 
 		 630 aa  438  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.534738  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3554  polysaccharide deacetylase  54.09 
 
 		 630 aa  424  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0615  polysaccharide deacetylase  45.39 
 
 		 843 aa  363  3e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00286732 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1227  polysaccharide deacetylase  45.73 
 
 		 657 aa  343  5e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.18341  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2337  polysaccharide deacetylase  50.88 
 
 		 500 aa  239  5.999999999999999e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00797389  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1639  polysaccharide deacetylase domain protein  38.1 
 
 		 269 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0880  polysaccharide deacetylase  38.56 
 
 		 271 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  38.33 
 
 		 598 aa  71.2  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  32.06 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  37.19 
 
 		 321 aa  65.1  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1454  polysaccharide deacetylase  34.4 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0891104  hitchhiker  0.0000678514 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1452  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0853  polysaccharide deacetylase  30.07 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000296204  normal  0.358313 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3874  polysaccharide deacetylase  31.5 
 
 		 281 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2795  polysaccharide deacetylase  25.13 
 
 		 600 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0146758 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0146  polysaccharide deacetylase  25.62 
 
 		 266 aa  56.6  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3339  polysaccharide deacetylase  30.37 
 
 		 434 aa  56.2  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00946214 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  30 
 
 		 233 aa  55.8  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  31.3 
 
 		 255 aa  55.8  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3200  polysaccharide deacetylase  24.74 
 
 		 594 aa  54.7  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000473135  hitchhiker  0.00151321 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0040  polysaccharide deacetylase  31.15 
 
 		 258 aa  54.3  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142029 
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  29.29 
 
 		 233 aa  53.5  0.000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2320  polysaccharide deacetylase  33.61 
 
 		 313 aa  53.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4676  polysaccharide deacetylase  29.23 
 
 		 322 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0390  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 294 aa  52  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2794  polysaccharide deacetylase  28.64 
 
 		 597 aa  51.6  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0412434 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1536  polysaccharide deacetylase  29.73 
 
 		 257 aa  51.6  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0414  polysaccharide deacetylase  31.82 
 
 		 233 aa  51.2  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 271 aa  50.8  0.00005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  28.81 
 
 		 306 aa  50.4  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1579  polysaccharide deacetylase  33.71 
 
 		 262 aa  50.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  27.97 
 
 		 306 aa  49.7  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0250  polysaccharide deacetylase  37.18 
 
 		 398 aa  49.7  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2728  polysaccharide deacetylase  31.13 
 
 		 400 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2752  polysaccharide deacetylase  29.32 
 
 		 251 aa  48.9  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1686  polysaccharide deacetylase  27.69 
 
 		 255 aa  48.9  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.290278  normal  0.0457798 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2730  polysaccharide deacetylase  23.2 
 
 		 274 aa  48.9  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0136  polysaccharide deacetylase  31.45 
 
 		 316 aa  48.5  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  26.12 
 
 		 645 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 		 542 aa  48.5  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  27.5 
 
 		 289 aa  48.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2023  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 275 aa  47.8  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.385946 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0341  polysaccharide deacetylase  31.71 
 
 		 335 aa  47.8  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2876  polysaccharide deacetylase  25.81 
 
 		 257 aa  47.8  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2642  polysaccharide deacetylase  31.13 
 
 		 397 aa  47.4  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.149181  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0658  xylanase/chitin deacetylase-like protein  26.05 
 
 		 221 aa  47.4  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3089  polysaccharide deacetylase  25.95 
 
 		 239 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2823  polysaccharide deacetylase  30.19 
 
 		 400 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.42622  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1976  polysaccharide deacetylase  26.43 
 
 		 257 aa  46.2  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2723  polysaccharide deacetylase  23.14 
 
 		 265 aa  45.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0924  polysaccharide deacetylase  27.07 
 
 		 173 aa  45.8  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  29.55 
 
 		 752 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1907  polysaccharide deacetylase  24.54 
 
 		 282 aa  45.8  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0232  polysaccharide deacetylase  22.12 
 
 		 265 aa  45.8  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.621532  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  25.36 
 
 		 261 aa  45.8  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5797  polysaccharide deacetylase  29.01 
 
 		 289 aa  45.4  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  26.39 
 
 		 274 aa  44.7  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0440  polysaccharide deacetylase  27.97 
 
 		 283 aa  44.7  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522067  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3076  polysaccharide deacetylase  30.89 
 
 		 258 aa  44.3  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  27.07 
 
 		 282 aa  43.9  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0175  polysaccharide deacetylase  28.79 
 
 		 378 aa  43.5  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.122625  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1224  polysaccharide deacetylase  34.18 
 
 		 392 aa  43.5  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.533397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1736  polysaccharide deacetylase  26.32 
 
 		 249 aa  43.5  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.70256 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3012  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 263 aa  43.5  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000529365  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4456  polysaccharide deacetylase  34.57 
 
 		 253 aa  43.1  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>