More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0327 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0327  S-layer-like domain-containing protein  100 
 
 		 857 aa  1736    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2155  S-layer-like domain-containing protein  38.79 
 
 		 631 aa  228  3e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  43.84 
 
 		 2313 aa  182  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3079  cellulosome anchoring protein, cohesin region  42.31 
 
 		 688 aa  164  6e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3080  cellulosome anchoring protein, cohesin region  43.81 
 
 		 447 aa  162  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1505  S-layer-like domain-containing protein  32.48 
 
 		 223 aa  103  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4955  S-layer domain protein  38.82 
 
 		 914 aa  99.8  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  34.15 
 
 		 4630 aa  97.8  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4972  S-layer-like domain-containing protein  39.74 
 
 		 939 aa  97.8  9e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  34.9 
 
 		 1821 aa  96.3  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  35.06 
 
 		 1321 aa  95.9  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1963  hypothetical protein  36.18 
 
 		 518 aa  93.6  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1991  hypothetical protein  35.67 
 
 		 625 aa  91.7  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.897372  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0077  S-layer domain protein  34.64 
 
 		 1710 aa  91.3  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3478  S-layer domain protein  38.96 
 
 		 548 aa  90.9  9e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2681  S-layer domain protein  32.05 
 
 		 1208 aa  90.5  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03370  S-layer domain protein  37.41 
 
 		 396 aa  89  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  34.23 
 
 		 506 aa  89  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  33.76 
 
 		 693 aa  87.4  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0792  cell wall hydrolase/autolysin  34.9 
 
 		 530 aa  87  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000364595  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3498  S-layer domain protein  39.06 
 
 		 457 aa  86.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  29.41 
 
 		 932 aa  86.3  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2351  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.89 
 
 		 410 aa  85.9  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000872091  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2268  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.89 
 
 		 410 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000138501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2528  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.89 
 
 		 410 aa  85.9  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000564272  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2015  S-layer domain protein  30.56 
 
 		 288 aa  85.9  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.859332  normal  0.142835 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2310  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.33 
 
 		 410 aa  85.5  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.2191900000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2998  S-layer domain-containing protein  32.24 
 
 		 926 aa  85.5  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1226  S-layer protein, putative  34.15 
 
 		 275 aa  85.1  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.686146  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0559  S-layer domain protein  30.95 
 
 		 1168 aa  85.1  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1714  S-layer domain-containing protein  31.68 
 
 		 573 aa  84.7  0.000000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0940  S-layer protein  34.9 
 
 		 535 aa  85.1  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000994264  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2543  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  32.24 
 
 		 410 aa  84.7  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.7515e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4391  S-layer protein  34.9 
 
 		 535 aa  84.7  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000169647  unclonable  1.31184e-25 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1687  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  31.36 
 
 		 410 aa  84.7  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000543314  hitchhiker  0.00000000000000117907 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2837  S-layer protein  32.24 
 
 		 472 aa  84.7  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0122747  hitchhiker  0.0000000116253 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1284  putative S-layer protein  33.54 
 
 		 219 aa  84.7  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0896591  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1576  cell wall hydrolase/autolysin  32.47 
 
 		 410 aa  84.3  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000010106  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1207  putative S-layer protein  33.54 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.341169 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  32.05 
 
 		 1226 aa  83.6  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1252  putative S-layer protein  33.55 
 
 		 341 aa  84  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.678676  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1027  S-layer protein  32.32 
 
 		 219 aa  84  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0927071  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0643  glycoside hydrolase family 18  32.2 
 
 		 542 aa  83.6  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.649155  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  30.91 
 
 		 1009 aa  84  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1967  hypothetical protein  33.55 
 
 		 1194 aa  83.2  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1195  S-layer protein, putative  33.55 
 
 		 345 aa  82.8  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0317  hypothetical protein  34.16 
 
 		 820 aa  82.4  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0705809  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0714  Ig domain-containing protein  30.82 
 
 		 807 aa  82.4  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000270996  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0796  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.89 
 
 		 540 aa  82  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.06495e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2476  S-layer protein  31.58 
 
 		 472 aa  81.6  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.612094  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1008  cell-wall amidase, pXO2-42-like protein  33.33 
 
 		 342 aa  82  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.8241  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3133  S-layer domain protein  33.12 
 
 		 604 aa  81.6  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.181258  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2129  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.38 
 
 		 1328 aa  81.3  0.00000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1049  S-layer protein  32.93 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0250999  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1129  S-layer protein  32.93 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.401991  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  33.96 
 
 		 1013 aa  80.9  0.00000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1010  NEAr transporter  32.7 
 
 		 343 aa  80.5  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.851709  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3093  S-layer domain-containing protein  29.14 
 
 		 935 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0755  hypothetical protein  26.88 
 
 		 1756 aa  80.1  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0517989  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2357  S-layer domain-containing protein  40.37 
 
 		 1081 aa  79.3  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0251259  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1177  putative S-layer protein  27.27 
 
 		 344 aa  78.6  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1064  crystal protein  33.99 
 
 		 822 aa  78.6  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000577462  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0243  hypothetical protein  32.92 
 
 		 685 aa  78.2  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0975  S-layer protein EA1  34 
 
 		 863 aa  78.6  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000553738 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  33.86 
 
 		 629 aa  78.6  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  34.25 
 
 		 760 aa  78.6  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1368  S-layer-like domain-containing protein  31.61 
 
 		 710 aa  78.2  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000486639  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1839  S-layer domain protein  38.74 
 
 		 575 aa  78.2  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  34.26 
 
 		 414 aa  78.2  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3582  S-layer domain protein  30.77 
 
 		 921 aa  78.2  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000137339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1798  hypothetical protein  34.42 
 
 		 218 aa  78.2  0.0000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.351482  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1021  S-layer protein  32.08 
 
 		 346 aa  77.8  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1093  S-layer protein  32.08 
 
 		 344 aa  77.8  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0141  hypothetical protein  33.12 
 
 		 758 aa  77  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  32.9 
 
 		 526 aa  77  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0443  hypothetical protein  33.63 
 
 		 413 aa  77.4  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1030  S-layer domain-containing protein  32.34 
 
 		 218 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2999  S-layer domain-containing protein  31.06 
 
 		 524 aa  76.6  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0656  hypothetical protein  36.29 
 
 		 660 aa  76.6  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000140636  hitchhiker  0.000000360107 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  28.14 
 
 		 558 aa  76.3  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3962  putative internalin  34.25 
 
 		 760 aa  75.9  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.769038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0724  cell wall hydrolase/autolysin  30.77 
 
 		 527 aa  75.9  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000386208  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3307  S-layer domain protein  32.59 
 
 		 360 aa  75.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0976  GW repeat-containing protein  30.26 
 
 		 530 aa  75.9  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1924  hypothetical protein  34.33 
 
 		 657 aa  75.9  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.398091  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1744  S-layer protein  29.14 
 
 		 332 aa  75.9  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000139139  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3178  hypothetical protein  33.64 
 
 		 552 aa  76.3  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.925927  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0974  S-layer protein  33.77 
 
 		 819 aa  75.5  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000842335 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1048  S-layer protein  31.48 
 
 		 223 aa  75.5  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000983689  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3079  S-layer domain-containing protein  31.74 
 
 		 360 aa  75.5  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00407432  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1127  S-layer protein  31.48 
 
 		 223 aa  75.5  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.600339  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.05 
 
 		 1029 aa  75.5  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1205  putative S-layer protein  31.48 
 
 		 223 aa  75.5  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.567806 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1962  putative S-layer protein  29.14 
 
 		 331 aa  75.1  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000041962 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  30.83 
 
 		 413 aa  75.1  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2680  S-layer domain-containing protein  29.22 
 
 		 1174 aa  74.7  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3315  putative S-layer protein  32.59 
 
 		 360 aa  74.7  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1926  S-layer protein  29.14 
 
 		 331 aa  74.7  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000888894  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0120  S-layer domain protein  35.4 
 
 		 767 aa  74.7  0.000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3338  S-layer protein  32.59 
 
 		 360 aa  74.3  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656673  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>