More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0880 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0880  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 271 aa  556  1e-157  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1639  polysaccharide deacetylase domain protein  45.6 
 
 		 269 aa  205  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1231  polysaccharide deacetylase  40.87 
 
 		 630 aa  182  8.000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.534738  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3554  polysaccharide deacetylase  40.34 
 
 		 630 aa  176  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1227  polysaccharide deacetylase  37.27 
 
 		 657 aa  168  9e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.18341  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2337  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 500 aa  166  4e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00797389  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3555  polysaccharide deacetylase  36.92 
 
 		 487 aa  162  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0615  polysaccharide deacetylase  39.39 
 
 		 843 aa  158  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00286732 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1230  polysaccharide deacetylase  38.16 
 
 		 482 aa  156  4e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  44 
 
 		 598 aa  100  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  42.45 
 
 		 321 aa  87.4  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  38.79 
 
 		 242 aa  85.5  9e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2795  polysaccharide deacetylase  28.95 
 
 		 600 aa  81.6  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0146758 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0146  polysaccharide deacetylase  32.03 
 
 		 266 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1454  polysaccharide deacetylase  42.31 
 
 		 201 aa  80.9  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0891104  hitchhiker  0.0000678514 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3874  polysaccharide deacetylase  37.12 
 
 		 281 aa  77  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3339  polysaccharide deacetylase  29.53 
 
 		 434 aa  75.5  0.0000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00946214 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  33.57 
 
 		 270 aa  75.1  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0232  polysaccharide deacetylase  30.33 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.621532  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  32.09 
 
 		 279 aa  71.6  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  33.08 
 
 		 233 aa  71.6  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4676  polysaccharide deacetylase  32.52 
 
 		 322 aa  71.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  32.33 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3089  polysaccharide deacetylase  34.81 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  33.07 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2752  polysaccharide deacetylase  34.81 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  33.99 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3200  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 594 aa  67.8  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000473135  hitchhiker  0.00151321 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0414  polysaccharide deacetylase  33.08 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  32.12 
 
 		 1015 aa  67  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0853  polysaccharide deacetylase  37.39 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000296204  normal  0.358313 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  31.5 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  31.5 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0601  polysaccharide deacetylase  29.09 
 
 		 259 aa  65.5  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  32.03 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2723  polysaccharide deacetylase  26.52 
 
 		 265 aa  65.1  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  28.67 
 
 		 271 aa  65.5  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  32.39 
 
 		 278 aa  65.5  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1579  polysaccharide deacetylase  31.86 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2023  polysaccharide deacetylase  34.17 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.385946 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1121  polysaccharide deacetylase family protein  26.86 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  30.23 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3305  polysaccharide deacetylase  26.73 
 
 		 411 aa  63.5  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  27.81 
 
 		 352 aa  63.5  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4397  polysaccharide deacetylase  31.58 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2730  polysaccharide deacetylase  27.59 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0658  xylanase/chitin deacetylase-like protein  35.34 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5079  polysaccharide deacetylase  31.58 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1932  polysaccharide deacetylase  33.1 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.656935  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5781  polysaccharide deacetylase  31.58 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  29.08 
 
 		 282 aa  62.4  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4456  polysaccharide deacetylase  37.04 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  34.06 
 
 		 590 aa  62  0.000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0440  polysaccharide deacetylase  32.12 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522067  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3076  polysaccharide deacetylase  35 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1976  polysaccharide deacetylase  29.32 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  38.64 
 
 		 683 aa  61.6  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  32.14 
 
 		 542 aa  61.6  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  30.58 
 
 		 510 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 645 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5876  polysaccharide deacetylase  30.43 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1686  polysaccharide deacetylase  27.6 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.290278  normal  0.0457798 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1796  polysaccharide deacetylase  33.54 
 
 		 344 aa  60.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  33.59 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  31.76 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2794  polysaccharide deacetylase  26.72 
 
 		 597 aa  59.3  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0412434 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00270  deacetylase, putative  29.18 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  32 
 
 		 387 aa  58.9  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  24.82 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3218  polysaccharide deacetylase  34.51 
 
 		 465 aa  58.9  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.578565  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1536  polysaccharide deacetylase  35.19 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  38.1 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  34.25 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  32.82 
 
 		 1120 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  37.04 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1932  polysaccharide deacetylase  36.28 
 
 		 522 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461546  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1736  polysaccharide deacetylase  27.82 
 
 		 249 aa  57  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.70256 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  30.51 
 
 		 199 aa  57  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4674  polysaccharide deacetylase  32.82 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  36.7 
 
 		 267 aa  57  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2084  polysaccharide deacetylase  29.14 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  24.24 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  28.33 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6390  polysaccharide deacetylase  30.83 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0864277 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 465 aa  56.2  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  34.15 
 
 		 404 aa  55.8  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0504  hypothetical protein  29.3 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0900  polysaccharide deacetylase  31.01 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.479614 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5797  polysaccharide deacetylase  31.65 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3306  polysaccharide deacetylase  32.12 
 
 		 333 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.582105 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 275 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1587  polysaccharide deacetylase  30.38 
 
 		 626 aa  55.5  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0605374  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2320  polysaccharide deacetylase  33.86 
 
 		 313 aa  55.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  34.48 
 
 		 299 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  28.1 
 
 		 241 aa  55.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  29.32 
 
 		 239 aa  55.1  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1031  polysaccharide deacetylase  34.75 
 
 		 430 aa  54.7  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0136  polysaccharide deacetylase  30.41 
 
 		 316 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0677  polysaccharide deacetylase  30.28 
 
 		 337 aa  55.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>