229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1796 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1796  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
344 aa  714    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0653  regulatory protein, LacI  37.39 
 
 
363 aa  227  2e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.773413  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0108  polysaccharide deacetylase  39.94 
 
 
348 aa  224  1e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0248  polysaccharide deacetylase  38.04 
 
 
352 aa  224  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4008  polysaccharide deacetylase  39.7 
 
 
348 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3791  polysaccharide deacetylase  39.5 
 
 
348 aa  217  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0161  polysaccharide deacetylase  37.72 
 
 
342 aa  216  4e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0181  polysaccharide deacetylase  39.31 
 
 
353 aa  215  8e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3500  polysaccharide deacetylase family protein  40.13 
 
 
349 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0145  polysaccharide deacetylase  39.69 
 
 
348 aa  209  5e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4321  polysaccharide deacetylase  38.51 
 
 
348 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4122  polysaccharide deacetylase  39.38 
 
 
348 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3801  polysaccharide deacetylase  37.06 
 
 
348 aa  207  3e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3874  polysaccharide deacetylase  37.35 
 
 
348 aa  206  3e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1178  polysaccharide deacetylase  37.35 
 
 
370 aa  207  3e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  39.18 
 
 
348 aa  206  6e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4190  polysaccharide deacetylase  38.51 
 
 
348 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4000  polysaccharide deacetylase  36.47 
 
 
348 aa  202  6e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3791  polysaccharide deacetylase  33.72 
 
 
354 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000112343  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4235  polysaccharide deacetylase  33.62 
 
 
349 aa  194  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0225  polysaccharide deacetylase family protein  35.08 
 
 
357 aa  185  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0020  polysaccharide deacetylase  35.11 
 
 
381 aa  178  1e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04002  Polysaccharide deacetylase family protein  34.77 
 
 
391 aa  177  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1782  polysaccharide deacetylase  24.66 
 
 
305 aa  101  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1542  polysaccharide deacetylase  28.82 
 
 
273 aa  96.7  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.04781e-18 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2698  polysaccharide deacetylase  28.14 
 
 
295 aa  94.7  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000289703  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0976  polysaccharide deacetylase  27.7 
 
 
274 aa  94.7  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000769924  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2543  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  27.83 
 
 
258 aa  92.8  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2170  polysaccharide deacetylase family protein  27.88 
 
 
256 aa  92.8  9e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1828  polysaccharide deacetylase  27.88 
 
 
278 aa  92  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0287  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 
319 aa  90.5  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.316315  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  25.36 
 
 
254 aa  89.7  6e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0897  polysaccharide deacetylase  29.02 
 
 
264 aa  89.4  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000608973 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5605  polysaccharide deacetylase  26.36 
 
 
357 aa  87  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.221698  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0616  polysaccharide deacetylase  27.45 
 
 
373 aa  86.7  6e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  27.62 
 
 
278 aa  86.3  7e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3100  polysaccharide deacetylase  27.6 
 
 
262 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2381  polysaccharide deacetylase  27.49 
 
 
336 aa  84.3  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.437029  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2023  polysaccharide deacetylase  30.26 
 
 
275 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.385946 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2279  polysaccharide deacetylase  24.4 
 
 
318 aa  83.2  0.000000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  29.02 
 
 
510 aa  82.8  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  27.51 
 
 
645 aa  82.8  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2322  polysaccharide deacetylase family protein  29.67 
 
 
310 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  28.64 
 
 
1015 aa  81.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1076  polysaccharide deacetylase family protein  28.04 
 
 
274 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2342  polysaccharide deacetylase family protein  28.04 
 
 
274 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.769381  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2052  polysaccharide deacetylase family protein  29.05 
 
 
395 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1359  polysaccharide deacetylase family protein  29.05 
 
 
437 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1858  polysaccharide deacetylase  28.27 
 
 
347 aa  78.6  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000052436  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0340  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  26.64 
 
 
319 aa  79  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0441347  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2112  glycosy hydrolase family protein  25.39 
 
 
320 aa  79  0.0000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3226  polysaccharide deacetylase family protein  27.57 
 
 
437 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.107526  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3111  polysaccharide deacetylase family protein  27.57 
 
 
296 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2622  polysaccharide deacetylase family protein  28.97 
 
 
279 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.424992  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0150  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  28.97 
 
 
279 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1448  polysaccharide deacetylase family protein  27.91 
 
 
378 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1030  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  28.97 
 
 
617 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2765  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  28.5 
 
 
554 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0887626  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0375  polysaccharide deacetylase  25.6 
 
 
323 aa  75.5  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0881899  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  26.94 
 
 
319 aa  75.1  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  34.43 
 
 
264 aa  72.4  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  30.21 
 
 
321 aa  72.4  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0846  polysaccharide deacetylase  31.16 
 
 
280 aa  69.3  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  27.75 
 
 
279 aa  69.3  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0883  polysaccharide deacetylase  29.58 
 
 
298 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000351632  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2241  polysaccharide deacetylase  24.38 
 
 
297 aa  67.4  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0895  polysaccharide deacetylase  27.69 
 
 
615 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0313662  normal  0.429695 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3089  polysaccharide deacetylase  27.78 
 
 
239 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1587  polysaccharide deacetylase  30 
 
 
626 aa  67.4  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0605374  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  26.99 
 
 
234 aa  67  0.0000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0869  polysaccharide deacetylase  27.69 
 
 
615 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0273  polysaccharide deacetylase  24.21 
 
 
627 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  29.73 
 
 
274 aa  66.6  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4541  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 
263 aa  66.6  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00515582 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0448  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  28.37 
 
 
456 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4408  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 
263 aa  66.6  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1452  polysaccharide deacetylase  25.76 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3076  polysaccharide deacetylase  29.59 
 
 
258 aa  66.2  0.0000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  23.53 
 
 
306 aa  65.9  0.0000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6214  polysaccharide deacetylase  23.98 
 
 
264 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282001  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  24.35 
 
 
306 aa  65.1  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4617  polysaccharide deacetylase  29.65 
 
 
266 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0110578 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  24.54 
 
 
282 aa  63.5  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4676  polysaccharide deacetylase  24.75 
 
 
322 aa  63.2  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3305  polysaccharide deacetylase  32.32 
 
 
411 aa  62.8  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0156  polysaccharide deacetylase  23.19 
 
 
276 aa  62.8  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  26.98 
 
 
289 aa  62.8  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3011  polysaccharide deacetylase  26.43 
 
 
659 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.245243  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5079  polysaccharide deacetylase  27.85 
 
 
244 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5781  polysaccharide deacetylase  27.85 
 
 
244 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3118  polysaccharide deacetylase  26.43 
 
 
660 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4397  polysaccharide deacetylase  28.27 
 
 
244 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5874  polysaccharide deacetylase  23.61 
 
 
296 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199758  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3200  polysaccharide deacetylase  31.93 
 
 
594 aa  60.8  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000473135  hitchhiker  0.00151321 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2522  polysaccharide deacetylase  26.32 
 
 
237 aa  61.2  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.250856  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1616  polysaccharide deacetylase  24.87 
 
 
488 aa  60.8  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4456  polysaccharide deacetylase  27.7 
 
 
253 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2692  intercellular adhesion protein B  23.62 
 
 
290 aa  60.8  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.624067  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2749  intercellular adhesion protein B  23.62 
 
 
290 aa  60.8  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  21.4 
 
 
224 aa  60.8  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>