More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1454 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1454  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 201 aa  413  9.999999999999999e-116  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0891104  hitchhiker  0.0000678514 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  33.68 
 
 		 270 aa  89.4  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0880  polysaccharide deacetylase  39.47 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  35.48 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0615  polysaccharide deacetylase  34.15 
 
 		 843 aa  73.9  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00286732 
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  34.68 
 
 		 233 aa  73.9  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1639  polysaccharide deacetylase domain protein  34.19 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2752  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 251 aa  71.6  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  38.02 
 
 		 274 aa  71.2  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  33.86 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1231  polysaccharide deacetylase  33.91 
 
 		 630 aa  70.5  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.534738  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4674  polysaccharide deacetylase  36.04 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1976  polysaccharide deacetylase  32.54 
 
 		 257 aa  68.6  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  32.87 
 
 		 319 aa  68.2  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  34.62 
 
 		 598 aa  68.2  0.00000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3554  polysaccharide deacetylase  34.13 
 
 		 630 aa  67.8  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  31.5 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1736  polysaccharide deacetylase  35.16 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.70256 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3200  polysaccharide deacetylase  29.13 
 
 		 594 aa  66.2  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000473135  hitchhiker  0.00151321 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  31.47 
 
 		 590 aa  66.6  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  36.84 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2337  polysaccharide deacetylase  36.89 
 
 		 500 aa  63.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00797389  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0658  xylanase/chitin deacetylase-like protein  35.24 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  38.39 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1230  polysaccharide deacetylase  34.4 
 
 		 482 aa  63.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0440  polysaccharide deacetylase  35.78 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522067  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  36.21 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1932  polysaccharide deacetylase  33.04 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.656935  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  31.82 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0504  hypothetical protein  32.82 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  29.13 
 
 		 279 aa  62  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3089  polysaccharide deacetylase  33.8 
 
 		 239 aa  62  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  40.19 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5079  polysaccharide deacetylase  34.51 
 
 		 244 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5781  polysaccharide deacetylase  34.51 
 
 		 244 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4397  polysaccharide deacetylase  34.51 
 
 		 244 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3555  polysaccharide deacetylase  29.58 
 
 		 487 aa  60.8  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2084  polysaccharide deacetylase  29.69 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  35.24 
 
 		 542 aa  60.1  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0414  polysaccharide deacetylase  35.54 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  33.59 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2320  polysaccharide deacetylase  35.59 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  35.71 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1971  putative xylanase/chitin deacetylase  27.68 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0644502  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  27.68 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4676  polysaccharide deacetylase  30.91 
 
 		 322 aa  58.2  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  27.12 
 
 		 256 aa  57  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5037  polysaccharide deacetylase  32.71 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  32.74 
 
 		 261 aa  57  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2127  polysaccharide deacetylase  34.29 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  37.5 
 
 		 306 aa  57  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  37.5 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4456  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6390  polysaccharide deacetylase  27.03 
 
 		 238 aa  55.1  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0864277 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4011  polysaccharide deacetylase  35.19 
 
 		 360 aa  54.7  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1257  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 235 aa  54.7  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  32.71 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3874  polysaccharide deacetylase  40.37 
 
 		 281 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2023  polysaccharide deacetylase  36.11 
 
 		 275 aa  53.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.385946 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1686  polysaccharide deacetylase  28.12 
 
 		 255 aa  53.9  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.290278  normal  0.0457798 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1227  polysaccharide deacetylase  36.19 
 
 		 657 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.18341  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  32.69 
 
 		 1115 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  27.62 
 
 		 387 aa  53.1  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4358  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 		 265 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1121  polysaccharide deacetylase family protein  29.23 
 
 		 295 aa  52.4  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  32.69 
 
 		 927 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 		 242 aa  52.8  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  32.69 
 
 		 1115 aa  52.8  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 372 aa  52.4  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  32.69 
 
 		 1119 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4976  polysaccharide deacetylase  34.44 
 
 		 368 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1162  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  32.32 
 
 		 321 aa  52.8  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00597989  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  31.73 
 
 		 1101 aa  52.8  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0175  polysaccharide deacetylase  33.73 
 
 		 378 aa  52.8  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.122625  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  31.43 
 
 		 254 aa  52.8  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  32.69 
 
 		 1115 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2795  polysaccharide deacetylase  27.56 
 
 		 600 aa  52  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0146758 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2381  polysaccharide deacetylase  34.19 
 
 		 336 aa  52.4  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.437029  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  31.09 
 
 		 413 aa  52  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  29.31 
 
 		 417 aa  51.6  0.000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0792  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 278 aa  52  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.623292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  31.01 
 
 		 278 aa  51.6  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0900  polysaccharide deacetylase  28.81 
 
 		 246 aa  51.6  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.479614 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4917  polysaccharide deacetylase  30.48 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2167  polysaccharide deacetylase family protein  26.89 
 
 		 258 aa  50.8  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000111858  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  31.01 
 
 		 241 aa  50.8  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1550  polysaccharide deacetylase  30.19 
 
 		 244 aa  51.2  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0260353  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0853  polysaccharide deacetylase  31.58 
 
 		 318 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000296204  normal  0.358313 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5797  polysaccharide deacetylase  31.45 
 
 		 289 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  35.24 
 
 		 1120 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4617  polysaccharide deacetylase  39.64 
 
 		 266 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0110578 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  31.73 
 
 		 503 aa  50.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0065  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 365 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00184975  hitchhiker  0.0058603 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18670  predicted xylanase/chitin deacetylase  24.16 
 
 		 289 aa  50.1  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3339  polysaccharide deacetylase  28.36 
 
 		 434 aa  50.1  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00946214 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1878  polysaccharide deacetylase family protein  26.89 
 
 		 261 aa  50.1  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117322  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  30.66 
 
 		 1124 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  28.57 
 
 		 373 aa  49.7  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  33.64 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0678  polysaccharide deacetylase  31.87 
 
 		 322 aa  49.3  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>