More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0320 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  100 
 
 		 233 aa  484  1e-136  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  99.57 
 
 		 233 aa  481  1e-135  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0414  polysaccharide deacetylase  61.8 
 
 		 233 aa  307  6.999999999999999e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2752  polysaccharide deacetylase  56.44 
 
 		 251 aa  261  8.999999999999999e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3089  polysaccharide deacetylase  53 
 
 		 239 aa  222  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5079  polysaccharide deacetylase  52.8 
 
 		 244 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5781  polysaccharide deacetylase  52.8 
 
 		 244 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1736  polysaccharide deacetylase  46.29 
 
 		 249 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.70256 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1976  polysaccharide deacetylase  46.72 
 
 		 257 aa  219  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4397  polysaccharide deacetylase  52.34 
 
 		 244 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4456  polysaccharide deacetylase  51.16 
 
 		 253 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2084  polysaccharide deacetylase  46.38 
 
 		 249 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0229  polysaccharide deacetylase family protein  50.69 
 
 		 238 aa  202  3e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00859248  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0405  polysaccharide deacetylase  50.69 
 
 		 238 aa  202  3e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0189593 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  46.29 
 
 		 239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1971  putative xylanase/chitin deacetylase  45.85 
 
 		 239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0644502  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  37.07 
 
 		 279 aa  146  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  35.35 
 
 		 224 aa  144  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  31.19 
 
 		 234 aa  139  3e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  35.78 
 
 		 282 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  37.34 
 
 		 278 aa  131  6.999999999999999e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6390  polysaccharide deacetylase  35.21 
 
 		 238 aa  129  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0864277 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1932  polysaccharide deacetylase  36.24 
 
 		 244 aa  128  6e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.656935  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  36.7 
 
 		 255 aa  122  6e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  31.91 
 
 		 306 aa  116  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  32.73 
 
 		 1015 aa  115  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  31.9 
 
 		 306 aa  115  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  28.63 
 
 		 271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  32.34 
 
 		 274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  35.32 
 
 		 264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2950  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 1001 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  33.18 
 
 		 321 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  32.89 
 
 		 274 aa  112  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  32.33 
 
 		 289 aa  109  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  31.65 
 
 		 319 aa  107  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  32.74 
 
 		 270 aa  106  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  31.2 
 
 		 590 aa  106  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4674  polysaccharide deacetylase  33.05 
 
 		 234 aa  105  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2381  polysaccharide deacetylase  29.05 
 
 		 336 aa  105  7e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.437029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0440  polysaccharide deacetylase  32.89 
 
 		 283 aa  101  9e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522067  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  31.78 
 
 		 510 aa  101  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2127  polysaccharide deacetylase  29.72 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  28.94 
 
 		 261 aa  99.8  3e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1587  polysaccharide deacetylase  32.11 
 
 		 626 aa  99.4  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0605374  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2023  polysaccharide deacetylase  33.66 
 
 		 275 aa  97.8  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.385946 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5797  polysaccharide deacetylase  32.72 
 
 		 289 aa  97.4  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0678  polysaccharide deacetylase  30.8 
 
 		 415 aa  96.7  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.945313  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0792  polysaccharide deacetylase  31.05 
 
 		 278 aa  95.5  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.623292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3249  polysaccharide deacetylase  32.43 
 
 		 266 aa  92.8  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1457  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  30.53 
 
 		 237 aa  92.4  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.645637  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0140  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  30.47 
 
 		 409 aa  89  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 689 aa  89  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3994  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 426 aa  88.6  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0213  polysaccharide deacetylase  30.17 
 
 		 407 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.268611  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  29.22 
 
 		 598 aa  88.2  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0204  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  30.17 
 
 		 409 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0156  polysaccharide deacetylase  29.03 
 
 		 276 aa  86.7  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4676  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 322 aa  85.9  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0136  polysaccharide deacetylase  33.18 
 
 		 316 aa  85.5  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0132  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  30.17 
 
 		 409 aa  85.5  7e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0196  polysaccharide deacetylase domain protein  29.74 
 
 		 409 aa  85.1  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0138  polysaccharide deacetylase domain protein  30.04 
 
 		 409 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0134  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  30.04 
 
 		 409 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0199  polysaccharide deacetylase domain protein  29.31 
 
 		 409 aa  82.8  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.37766  normal  0.364365 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0195  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  29.31 
 
 		 407 aa  82  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00129  predicted polysaccharide deacetylase lipoprotein  29.61 
 
 		 409 aa  82  0.000000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.530219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3472  polysaccharide deacetylase  29.61 
 
 		 409 aa  82  0.000000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00128  hypothetical protein  29.61 
 
 		 409 aa  82  0.000000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411127  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3529  polysaccharide deacetylase  29.61 
 
 		 409 aa  82  0.000000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3475  polysaccharide deacetylase  26.53 
 
 		 437 aa  81.3  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3346  polysaccharide deacetylase family protein  26.53 
 
 		 417 aa  81.3  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000257148  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1014  polysaccharide deacetylase family protein  26.53 
 
 		 417 aa  80.9  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.763389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1616  polysaccharide deacetylase  27.08 
 
 		 488 aa  80.9  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2241  polysaccharide deacetylase  25.11 
 
 		 297 aa  80.5  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0110  polysaccharide deacetylase  42.34 
 
 		 316 aa  80.9  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1402  xylanase/chitin deacetylase  24.6 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0167631  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0811  Shf protein  27.59 
 
 		 284 aa  78.2  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5301  polysaccharide deacetylase  29.55 
 
 		 272 aa  78.2  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0504  hypothetical protein  26.27 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2104  polysaccharide deacetylase  26.51 
 
 		 276 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2837  polysaccharide deacetylase  28.63 
 
 		 285 aa  77.4  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0678  polysaccharide deacetylase  36.61 
 
 		 322 aa  77  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  27.32 
 
 		 645 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0287  polysaccharide deacetylase  26.47 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.316315  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1452  polysaccharide deacetylase  26.27 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0722  polysaccharide deacetylase  27.2 
 
 		 284 aa  75.9  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  27.23 
 
 		 254 aa  75.1  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  28 
 
 		 348 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0476  NhaD  23.08 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.336062  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4855  polysaccharide deacetylase family protein  25 
 
 		 273 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2541  polysaccharide deacetylase  38.89 
 
 		 318 aa  73.6  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0393046  normal  0.0973746 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1454  polysaccharide deacetylase  34.68 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0891104  hitchhiker  0.0000678514 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3500  polysaccharide deacetylase family protein  32.66 
 
 		 349 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3791  polysaccharide deacetylase  26.63 
 
 		 354 aa  73.9  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000112343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0145  polysaccharide deacetylase  28.86 
 
 		 348 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5046  polysaccharide deacetylase  28.64 
 
 		 276 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.447167  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4122  polysaccharide deacetylase  28.86 
 
 		 348 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0046  polysaccharide deacetylase family protein  24.79 
 
 		 273 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0060  polysaccharide deacetylase family protein  24.79 
 
 		 273 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2170  polysaccharide deacetylase family protein  26.92 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>