278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2241 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2241  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
297 aa  607  9.999999999999999e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4976  deacetylase  34.8 
 
 
373 aa  162  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.765353  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3056  polysaccharide deacetylase  34.55 
 
 
401 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0140  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  30.2 
 
 
409 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0134  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  30.61 
 
 
409 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0678  polysaccharide deacetylase  29 
 
 
415 aa  128  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.945313  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0138  polysaccharide deacetylase domain protein  30.2 
 
 
409 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0132  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  30.2 
 
 
409 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3994  polysaccharide deacetylase  33.03 
 
 
426 aa  127  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0196  polysaccharide deacetylase domain protein  29.11 
 
 
409 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0213  polysaccharide deacetylase  29.11 
 
 
407 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.268611  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0199  polysaccharide deacetylase domain protein  29.54 
 
 
409 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.37766  normal  0.364365 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0204  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  29.49 
 
 
409 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00129  predicted polysaccharide deacetylase lipoprotein  29.8 
 
 
409 aa  123  4e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.530219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3472  polysaccharide deacetylase  29.8 
 
 
409 aa  123  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00128  hypothetical protein  29.8 
 
 
409 aa  123  4e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411127  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3529  polysaccharide deacetylase  29.8 
 
 
409 aa  123  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0195  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  29.54 
 
 
407 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  30 
 
 
255 aa  119  4.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3475  polysaccharide deacetylase  32.58 
 
 
437 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3346  polysaccharide deacetylase family protein  32.58 
 
 
417 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000257148  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1014  polysaccharide deacetylase family protein  32.58 
 
 
417 aa  117  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.763389  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  30.04 
 
 
282 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  27.16 
 
 
321 aa  106  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0616  polysaccharide deacetylase  29.22 
 
 
373 aa  105  7e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  29.96 
 
 
306 aa  105  9e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  29.66 
 
 
306 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  27.89 
 
 
279 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  32.92 
 
 
271 aa  103  3e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2381  polysaccharide deacetylase  30.31 
 
 
336 aa  102  6e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.437029  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0897  polysaccharide deacetylase  26.49 
 
 
264 aa  101  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000608973 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  29.57 
 
 
278 aa  100  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  27.07 
 
 
319 aa  99.4  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2320  polysaccharide deacetylase  25.76 
 
 
313 aa  97.8  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1402  xylanase/chitin deacetylase  29.2 
 
 
256 aa  97.8  2e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0167631  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  28.86 
 
 
590 aa  97.1  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  29.92 
 
 
261 aa  96.3  6e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0156  polysaccharide deacetylase  25.58 
 
 
276 aa  94.4  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2543  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  26.05 
 
 
258 aa  93.6  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 
510 aa  91.7  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06580  predicted xylanase/chitin deacetylase  29.06 
 
 
629 aa  90.9  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0476  NhaD  27.35 
 
 
256 aa  90.1  4e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.336062  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0287  polysaccharide deacetylase  31.74 
 
 
319 aa  89.7  5e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.316315  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  30.84 
 
 
234 aa  89.7  5e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1457  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  26.61 
 
 
237 aa  89.4  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.645637  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1121  polysaccharide deacetylase family protein  30.43 
 
 
295 aa  89.4  7e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2692  intercellular adhesion protein B  30.43 
 
 
290 aa  89.4  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.624067  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2749  intercellular adhesion protein B  30.43 
 
 
290 aa  89.4  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0504  hypothetical protein  30.91 
 
 
277 aa  89.4  8e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  27.78 
 
 
239 aa  88.6  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0653  regulatory protein, LacI  27.48 
 
 
363 aa  88.2  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.773413  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1971  putative xylanase/chitin deacetylase  27.78 
 
 
239 aa  88.6  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0644502  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5079  polysaccharide deacetylase  29.02 
 
 
244 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5781  polysaccharide deacetylase  29.02 
 
 
244 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2295  intercellular adhesion protein B  30.8 
 
 
289 aa  86.7  4e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0572032  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1976  polysaccharide deacetylase  26.58 
 
 
257 aa  86.7  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4397  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 
244 aa  86.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0225  polysaccharide deacetylase family protein  30.32 
 
 
357 aa  86.3  6e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3249  polysaccharide deacetylase  24.45 
 
 
266 aa  85.1  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2752  polysaccharide deacetylase  27.2 
 
 
251 aa  84.3  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3089  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 
239 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1858  polysaccharide deacetylase  29.18 
 
 
347 aa  83.6  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000052436  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0976  polysaccharide deacetylase  24.79 
 
 
274 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000769924  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2837  polysaccharide deacetylase  25.59 
 
 
285 aa  82.8  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28577  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  27.1 
 
 
274 aa  82.4  0.000000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3100  polysaccharide deacetylase  23.65 
 
 
262 aa  82  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4676  polysaccharide deacetylase  27.14 
 
 
322 aa  82  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  26.47 
 
 
270 aa  81.6  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04002  Polysaccharide deacetylase family protein  26.82 
 
 
391 aa  82  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  26.34 
 
 
289 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2127  polysaccharide deacetylase  26.3 
 
 
256 aa  81.3  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1736  polysaccharide deacetylase  24.58 
 
 
249 aa  81.3  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.70256 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  25.96 
 
 
233 aa  80.5  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  25.11 
 
 
233 aa  80.5  0.00000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0229  polysaccharide deacetylase family protein  25.11 
 
 
238 aa  80.1  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00859248  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0405  polysaccharide deacetylase  25.11 
 
 
238 aa  80.1  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0189593 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2023  polysaccharide deacetylase  27.44 
 
 
275 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.385946 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  28.51 
 
 
224 aa  79.3  0.00000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1828  polysaccharide deacetylase  23.08 
 
 
278 aa  79  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2170  polysaccharide deacetylase family protein  24 
 
 
256 aa  78.6  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4541  polysaccharide deacetylase  23.81 
 
 
263 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00515582 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2084  polysaccharide deacetylase  25 
 
 
249 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4408  polysaccharide deacetylase  23.81 
 
 
263 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4000  polysaccharide deacetylase  25.45 
 
 
348 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4456  polysaccharide deacetylase  28.05 
 
 
253 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0811  Shf protein  25.9 
 
 
284 aa  77  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0171  polysaccharide deacetylase  27.2 
 
 
259 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0521886  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0722  polysaccharide deacetylase  25.9 
 
 
284 aa  77  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1452  polysaccharide deacetylase  27.86 
 
 
291 aa  77  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0414  polysaccharide deacetylase  25.21 
 
 
233 aa  76.6  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3500  polysaccharide deacetylase family protein  26.01 
 
 
349 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0883  polysaccharide deacetylase  24.8 
 
 
298 aa  76.3  0.0000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000351632  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4286  outer membrane N-deacetylase  23.87 
 
 
671 aa  75.9  0.0000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3874  polysaccharide deacetylase  25.91 
 
 
348 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0315  polysaccharide deacetylase-like protein  28.86 
 
 
360 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0362  polysaccharide deacetylase-like protein  28.88 
 
 
360 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0330  polysaccharide deacetylase-like protein  28.86 
 
 
360 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2698  polysaccharide deacetylase  24.49 
 
 
295 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000289703  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1178  polysaccharide deacetylase  25 
 
 
370 aa  74.3  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  25.1 
 
 
348 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>