More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4456 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4456  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 253 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5079  polysaccharide deacetylase  61.43 
 
 		 244 aa  265  5e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5781  polysaccharide deacetylase  61.43 
 
 		 244 aa  265  5e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4397  polysaccharide deacetylase  60.99 
 
 		 244 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3089  polysaccharide deacetylase  60.09 
 
 		 239 aa  258  9e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  51.63 
 
 		 233 aa  219  5e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  51.16 
 
 		 233 aa  216  2e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2752  polysaccharide deacetylase  48.84 
 
 		 251 aa  206  4e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2084  polysaccharide deacetylase  46.15 
 
 		 249 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0414  polysaccharide deacetylase  43.23 
 
 		 233 aa  192  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1976  polysaccharide deacetylase  43.95 
 
 		 257 aa  190  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1736  polysaccharide deacetylase  42.99 
 
 		 249 aa  182  4.0000000000000006e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.70256 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0229  polysaccharide deacetylase family protein  42.86 
 
 		 238 aa  161  9e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00859248  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0405  polysaccharide deacetylase  42.86 
 
 		 238 aa  161  9e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0189593 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  42.52 
 
 		 239 aa  157  1e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1971  putative xylanase/chitin deacetylase  42.06 
 
 		 239 aa  154  1e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0644502  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  35.62 
 
 		 279 aa  145  5e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  33.91 
 
 		 282 aa  143  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  31.11 
 
 		 224 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  30.45 
 
 		 234 aa  135  6.0000000000000005e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1932  polysaccharide deacetylase  38.6 
 
 		 244 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.656935  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  37.56 
 
 		 255 aa  128  8.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  35.87 
 
 		 321 aa  123  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6390  polysaccharide deacetylase  37.21 
 
 		 238 aa  123  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0864277 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  34.82 
 
 		 278 aa  119  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  28.7 
 
 		 271 aa  118  9.999999999999999e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  40 
 
 		 264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1587  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 		 626 aa  112  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0605374  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  29.41 
 
 		 319 aa  108  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3249  polysaccharide deacetylase  34.35 
 
 		 266 aa  105  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2127  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  29.69 
 
 		 261 aa  104  1e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  31.06 
 
 		 510 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  30.74 
 
 		 1015 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  36.07 
 
 		 598 aa  102  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0136  polysaccharide deacetylase  33.79 
 
 		 316 aa  102  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  31.52 
 
 		 289 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  31.58 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5797  polysaccharide deacetylase  36.49 
 
 		 289 aa  99.8  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2950  glycosyl transferase family 2  30.33 
 
 		 1001 aa  99  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  25.83 
 
 		 306 aa  98.2  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  25.83 
 
 		 306 aa  97.8  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  31.51 
 
 		 274 aa  97.4  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  29.33 
 
 		 590 aa  95.9  6e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  32.6 
 
 		 270 aa  94.7  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2381  polysaccharide deacetylase  21.67 
 
 		 336 aa  94  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.437029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0678  polysaccharide deacetylase  30.22 
 
 		 415 aa  90.5  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.945313  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  27.36 
 
 		 254 aa  89.4  5e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0440  polysaccharide deacetylase  30.99 
 
 		 283 aa  89  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522067  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2023  polysaccharide deacetylase  30.51 
 
 		 275 aa  87.8  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.385946 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3475  polysaccharide deacetylase  30.25 
 
 		 437 aa  85.9  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3346  polysaccharide deacetylase family protein  30.25 
 
 		 417 aa  85.9  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000257148  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1014  polysaccharide deacetylase family protein  30.25 
 
 		 417 aa  85.9  6e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.763389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2104  polysaccharide deacetylase  30.64 
 
 		 276 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0140  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  28.07 
 
 		 409 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4676  polysaccharide deacetylase  28.1 
 
 		 322 aa  80.9  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0132  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  28.51 
 
 		 409 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0213  polysaccharide deacetylase  28.38 
 
 		 407 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.268611  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1452  polysaccharide deacetylase  25.79 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00129  predicted polysaccharide deacetylase lipoprotein  29.35 
 
 		 409 aa  79.3  0.00000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.530219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3472  polysaccharide deacetylase  29.35 
 
 		 409 aa  79.3  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0204  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  28.57 
 
 		 409 aa  79.3  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0134  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  28.07 
 
 		 409 aa  79.3  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3529  polysaccharide deacetylase  29.35 
 
 		 409 aa  79.3  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00128  hypothetical protein  29.35 
 
 		 409 aa  79.3  0.00000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411127  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0199  polysaccharide deacetylase domain protein  28.38 
 
 		 409 aa  79.3  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.37766  normal  0.364365 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0195  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  28.57 
 
 		 407 aa  79  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0138  polysaccharide deacetylase domain protein  27.63 
 
 		 409 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0792  polysaccharide deacetylase  33.85 
 
 		 278 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.623292  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0360  polysaccharide deacetylase-like protein  30.64 
 
 		 360 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2241  polysaccharide deacetylase  28.05 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4674  polysaccharide deacetylase  32.46 
 
 		 234 aa  77.8  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0156  polysaccharide deacetylase  28.34 
 
 		 276 aa  77.8  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  26.24 
 
 		 645 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0196  polysaccharide deacetylase domain protein  28.12 
 
 		 409 aa  77  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1616  polysaccharide deacetylase  29.15 
 
 		 488 aa  76.6  0.0000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0404  polysaccharide deacetylase-like protein  30.21 
 
 		 360 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.606713  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0310  polysaccharide deacetylase  30.32 
 
 		 358 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0504  hypothetical protein  25.81 
 
 		 277 aa  75.9  0.0000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3801  polysaccharide deacetylase  26.12 
 
 		 348 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3874  polysaccharide deacetylase  26.12 
 
 		 348 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4190  polysaccharide deacetylase  28.22 
 
 		 348 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2153  xylanase/chitin deacetylase  30.77 
 
 		 276 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336279  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  26.53 
 
 		 348 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0145  polysaccharide deacetylase  28.46 
 
 		 348 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4122  polysaccharide deacetylase  28.05 
 
 		 348 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3791  polysaccharide deacetylase  26.12 
 
 		 348 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3994  polysaccharide deacetylase  25.88 
 
 		 426 aa  73.2  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4358  polysaccharide deacetylase  30.05 
 
 		 265 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4321  polysaccharide deacetylase  27.8 
 
 		 348 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1457  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  25.73 
 
 		 237 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.645637  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0377  polysaccharide deacetylase-like protein  29.66 
 
 		 360 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0091  xylanase/chitin deacetylase  25.87 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0298  polysaccharide deacetylase  29.6 
 
 		 360 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4943  polysaccharide deacetylase-like protein  29.66 
 
 		 360 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  23.67 
 
 		 689 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3500  polysaccharide deacetylase family protein  27.69 
 
 		 349 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0108  polysaccharide deacetylase  29.65 
 
 		 348 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4000  polysaccharide deacetylase  25.31 
 
 		 348 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0225  polysaccharide deacetylase family protein  26.05 
 
 		 357 aa  68.6  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>