239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4358 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4358  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 265 aa  536  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4585  polysaccharide deacetylase  63.77 
 
 		 276 aa  351  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.701791 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5046  polysaccharide deacetylase  63.77 
 
 		 276 aa  350  2e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.447167  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  33.5 
 
 		 319 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  27.45 
 
 		 224 aa  94.4  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2950  glycosyl transferase family 2  31.85 
 
 		 1001 aa  89  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  25.55 
 
 		 306 aa  82.8  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5301  polysaccharide deacetylase  36.32 
 
 		 272 aa  82.4  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  29.7 
 
 		 254 aa  82.8  0.000000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3089  polysaccharide deacetylase  34.57 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  25.11 
 
 		 306 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  32.3 
 
 		 274 aa  80.5  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2752  polysaccharide deacetylase  28.64 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5079  polysaccharide deacetylase  32.99 
 
 		 244 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2127  polysaccharide deacetylase  30.96 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5781  polysaccharide deacetylase  32.99 
 
 		 244 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0229  polysaccharide deacetylase family protein  29.2 
 
 		 238 aa  76.3  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00859248  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0405  polysaccharide deacetylase  29.2 
 
 		 238 aa  76.3  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0189593 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  26.29 
 
 		 282 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1976  polysaccharide deacetylase  29.08 
 
 		 257 aa  75.5  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  26.92 
 
 		 278 aa  75.5  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4397  polysaccharide deacetylase  31.79 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  30.88 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4456  polysaccharide deacetylase  30.05 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1971  putative xylanase/chitin deacetylase  30.88 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0644502  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  24.75 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0414  polysaccharide deacetylase  27.32 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  28.71 
 
 		 1015 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2084  polysaccharide deacetylase  29.68 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  27.73 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1736  polysaccharide deacetylase  27.32 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.70256 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  32.4 
 
 		 270 aa  68.9  0.00000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  32.5 
 
 		 590 aa  68.2  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1587  polysaccharide deacetylase  30.35 
 
 		 626 aa  67  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0605374  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  27.98 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  26.02 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  26.02 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  25.39 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2104  polysaccharide deacetylase  28.14 
 
 		 276 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  29.79 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0108  polysaccharide deacetylase  25.43 
 
 		 348 aa  63.9  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  28.04 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3249  polysaccharide deacetylase  31.86 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2375  polysaccharide deacetylase  36.54 
 
 		 344 aa  63.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3076  polysaccharide deacetylase  29.51 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  28.23 
 
 		 264 aa  62  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0156  polysaccharide deacetylase  26.03 
 
 		 276 aa  62  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8504  polysaccharide deacetylase  32.28 
 
 		 223 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  0.0143221 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1932  polysaccharide deacetylase  32.45 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.656935  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1557  polysaccharide deacetylase  35.78 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.367828  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2023  polysaccharide deacetylase  30.66 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.385946 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0751  polysaccharide deacetylase  28.45 
 
 		 673 aa  60.1  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.442489  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  32.61 
 
 		 598 aa  59.7  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0248  polysaccharide deacetylase  28.49 
 
 		 352 aa  60.1  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0616  polysaccharide deacetylase  28.04 
 
 		 373 aa  59.7  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0440  polysaccharide deacetylase  25.77 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522067  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6390  polysaccharide deacetylase  30.28 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0864277 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1121  polysaccharide deacetylase family protein  25.91 
 
 		 295 aa  58.9  0.00000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1402  xylanase/chitin deacetylase  22.65 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0167631  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2381  polysaccharide deacetylase  23.79 
 
 		 336 aa  58.5  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.437029  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0360  polysaccharide deacetylase-like protein  24.87 
 
 		 360 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2541  polysaccharide deacetylase  36.46 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0393046  normal  0.0973746 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1967  polysaccharide deacetylase  35.96 
 
 		 339 aa  57.4  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0404  polysaccharide deacetylase-like protein  24.87 
 
 		 360 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.606713  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3105  polysaccharide deacetylase  28.1 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000266277  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4676  polysaccharide deacetylase  24.59 
 
 		 322 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1452  polysaccharide deacetylase  23.26 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1065  polysaccharide deacetylase  32.81 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.012185  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0340  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  22.97 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0441347  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4617  polysaccharide deacetylase  33.73 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0110578 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3791  polysaccharide deacetylase  23.11 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000112343  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2241  polysaccharide deacetylase  18.72 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  28.38 
 
 		 510 aa  57.4  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2153  xylanase/chitin deacetylase  27.68 
 
 		 276 aa  57  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  27.59 
 
 		 645 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18670  predicted xylanase/chitin deacetylase  28.57 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2112  glycosy hydrolase family protein  25.53 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4674  polysaccharide deacetylase  32.03 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0455  polysaccharide deacetylase  33.82 
 
 		 339 aa  56.2  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0133488 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0658  xylanase/chitin deacetylase-like protein  33.64 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0298  polysaccharide deacetylase  24.02 
 
 		 360 aa  55.5  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  26.94 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.568999  normal  0.212352 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2791  hypothetical protein  31.15 
 
 		 640 aa  55.5  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.291104  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0171  polysaccharide deacetylase  23.08 
 
 		 259 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0521886  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3874  polysaccharide deacetylase  34.86 
 
 		 281 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0310  polysaccharide deacetylase  23.14 
 
 		 358 aa  55.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3056  polysaccharide deacetylase  23.17 
 
 		 401 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  23.43 
 
 		 261 aa  55.5  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0332  polysaccharide deacetylase family protein  26.94 
 
 		 273 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.529836 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4855  polysaccharide deacetylase family protein  24.07 
 
 		 273 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0333  polysaccharide deacetylase family protein  26.94 
 
 		 273 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0722  polysaccharide deacetylase  27.93 
 
 		 284 aa  54.3  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0046  polysaccharide deacetylase family protein  24.07 
 
 		 273 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0060  polysaccharide deacetylase family protein  24.07 
 
 		 273 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4943  polysaccharide deacetylase-like protein  23.58 
 
 		 360 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5797  polysaccharide deacetylase  28.33 
 
 		 289 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0377  polysaccharide deacetylase-like protein  23.58 
 
 		 360 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0792  polysaccharide deacetylase  28 
 
 		 278 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.623292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0811  Shf protein  27.93 
 
 		 284 aa  53.5  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>