238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0455 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0455  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 339 aa  709    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0133488 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2465  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 348 aa  107  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0187  hypothetical protein  26.56 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2375  polysaccharide deacetylase  25.31 
 
 		 344 aa  103  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5826  polysaccharide deacetylase  24.76 
 
 		 354 aa  93.2  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0739761  normal  0.758977 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1729  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 316 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2336  polysaccharide deacetylase  26.89 
 
 		 339 aa  92  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1967  polysaccharide deacetylase  25.15 
 
 		 339 aa  90.1  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5022  polysaccharide deacetylase family protein  25.61 
 
 		 327 aa  88.6  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0134312  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3074  polysaccharide deacetylase  26.18 
 
 		 321 aa  88.6  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2459  polysaccharide deacetylase  20.07 
 
 		 318 aa  85.9  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0185568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0752  putative polysaccharide deacetylase  26.32 
 
 		 352 aa  85.5  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0678  polysaccharide deacetylase  25.16 
 
 		 322 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2609  polysaccharide deacetylase  28.24 
 
 		 408 aa  83.2  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.644601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1065  polysaccharide deacetylase  22.33 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.012185  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0677  polysaccharide deacetylase  27.31 
 
 		 337 aa  82  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0883  polysaccharide deacetylase  24.93 
 
 		 352 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.272059  normal  0.749815 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1958  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  22.07 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.15292  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1640  polysaccharide deacetylase  24.51 
 
 		 337 aa  80.9  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2013  polysaccharide deacetylase  21.74 
 
 		 386 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2761  polysaccharide deacetylase  25.56 
 
 		 398 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0205212  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2541  polysaccharide deacetylase  24.78 
 
 		 318 aa  79  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0393046  normal  0.0973746 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1265  polysaccharide deacetylase  24.12 
 
 		 324 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.493777  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  23.18 
 
 		 672 aa  77.4  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1233  yggt family protein  25.32 
 
 		 266 aa  75.9  0.0000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0301  polysaccharide deacetylase  24.75 
 
 		 353 aa  75.5  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351436  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1604  polysaccharide deacetylase  23.86 
 
 		 350 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.200059 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5271  polysaccharide deacetylase  21.62 
 
 		 352 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1635  polysaccharide deacetylase  24.62 
 
 		 350 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2853  polysaccharide deacetylase  24.55 
 
 		 398 aa  73.2  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2945  polysaccharide deacetylase  24.55 
 
 		 398 aa  73.2  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2823  polysaccharide deacetylase  24.9 
 
 		 400 aa  72.8  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.42622  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2728  polysaccharide deacetylase  24.9 
 
 		 400 aa  72.8  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0595  polysaccharide deacetylase  25.55 
 
 		 345 aa  72.8  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  29.06 
 
 		 321 aa  72.4  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1885  polysaccharide deacetylase  23.19 
 
 		 350 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.227771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1635  polysaccharide deacetylase  22.26 
 
 		 328 aa  70.5  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.280055  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  33 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05320  Polysaccharide deacetylase  22.32 
 
 		 351 aa  69.7  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.354337  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  32.08 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2642  polysaccharide deacetylase  25.34 
 
 		 397 aa  69.7  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.149181  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  28.32 
 
 		 255 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0110  polysaccharide deacetylase  24.06 
 
 		 316 aa  68.9  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0771  polysaccharide deacetylase  22.8 
 
 		 352 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0306  polysaccharide deacetylase  22.55 
 
 		 353 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.957569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2994  polysaccharide deacetylase  21.52 
 
 		 362 aa  68.2  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649589 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  27.5 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1557  polysaccharide deacetylase  24.22 
 
 		 322 aa  67.8  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.367828  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0630  polysaccharide deacetylase  22.36 
 
 		 352 aa  66.6  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  30.25 
 
 		 510 aa  65.9  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0290  polysaccharide deacetylase  25.18 
 
 		 322 aa  65.5  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0240  polysaccharide deacetylase  21.58 
 
 		 330 aa  65.5  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0475  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing] (glutamineamidotransferase; GMP synthetase)  23.66 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2015  polysaccharide deacetylase  20.48 
 
 		 333 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0412  polysaccharide deacetylase  22.42 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0635  polysaccharide deacetylase  23.72 
 
 		 345 aa  63.5  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0156  hypothetical protein  20.95 
 
 		 338 aa  62.8  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  27.87 
 
 		 282 aa  62.8  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0091  xylanase/chitin deacetylase  31.4 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0897  polysaccharide deacetylase  37.96 
 
 		 264 aa  62.4  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000608973 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1279  polysaccharide deacetylase  23.18 
 
 		 348 aa  62.4  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26869  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2028  polysaccharide deacetylase  21.61 
 
 		 318 aa  62.4  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.30621  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4541  polysaccharide deacetylase  32.41 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00515582 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6088  polysaccharide deacetylase  21.2 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217095  hitchhiker  0.00305245 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4408  polysaccharide deacetylase  32.41 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1500  polysaccharide deacetylase family protein  23.19 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.89834  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0616  polysaccharide deacetylase  31.73 
 
 		 373 aa  60.5  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4976  polysaccharide deacetylase  23.74 
 
 		 368 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0414  polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0501  polysaccharide deacetylase  20.35 
 
 		 352 aa  58.9  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.885129 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4928  polysaccharide deacetylase  20.57 
 
 		 368 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3100  polysaccharide deacetylase  30.89 
 
 		 262 aa  58.5  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1287  polysaccharide deacetylase  21.99 
 
 		 366 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.374689  normal  0.442268 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1076  polysaccharide deacetylase family protein  32.43 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2342  polysaccharide deacetylase family protein  32.43 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.769381  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2543  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  34.26 
 
 		 258 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0250  polysaccharide deacetylase  21.73 
 
 		 349 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28438  normal  0.993392 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3984  polysaccharide deacetylase  21.54 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2052  polysaccharide deacetylase family protein  32.43 
 
 		 395 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3306  polysaccharide deacetylase  24.91 
 
 		 333 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.582105 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  32.14 
 
 		 645 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0854  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0976  polysaccharide deacetylase  31.48 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000769924  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6486  polysaccharide deacetylase  32.14 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0136  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 316 aa  57.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1359  polysaccharide deacetylase family protein  32.43 
 
 		 437 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0507  polysaccharide deacetylase  21.93 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142501  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  30.21 
 
 		 233 aa  57  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  21.19 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  30.21 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1976  polysaccharide deacetylase  27.37 
 
 		 257 aa  57  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2717  polysaccharide deacetylase  21.69 
 
 		 628 aa  56.6  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  31.46 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4358  polysaccharide deacetylase  33.82 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1121  polysaccharide deacetylase  32.14 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3111  polysaccharide deacetylase family protein  31.53 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3105  polysaccharide deacetylase  20.86 
 
 		 336 aa  56.2  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000266277  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1448  polysaccharide deacetylase family protein  31.53 
 
 		 378 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2837  polysaccharide deacetylase  31.78 
 
 		 285 aa  55.5  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14351  hypothetical protein  22.44 
 
 		 308 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.188906  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>