203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_5022 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_5022  polysaccharide deacetylase family protein  100 
 
 		 327 aa  674    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0134312  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0677  polysaccharide deacetylase  26.8 
 
 		 337 aa  150  4e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5826  polysaccharide deacetylase  23.28 
 
 		 354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0739761  normal  0.758977 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2375  polysaccharide deacetylase  25.86 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3074  polysaccharide deacetylase  25.46 
 
 		 321 aa  106  7e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0678  polysaccharide deacetylase  27.99 
 
 		 322 aa  105  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2013  polysaccharide deacetylase  25.34 
 
 		 386 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2465  polysaccharide deacetylase  26.57 
 
 		 348 aa  101  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0301  polysaccharide deacetylase  26.67 
 
 		 353 aa  100  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351436  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1967  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 		 339 aa  97.1  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1065  polysaccharide deacetylase  22.06 
 
 		 305 aa  96.3  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.012185  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0110  polysaccharide deacetylase  27.43 
 
 		 316 aa  92.8  8e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0455  polysaccharide deacetylase  25.61 
 
 		 339 aa  88.6  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0133488 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0412  polysaccharide deacetylase  27.41 
 
 		 324 aa  88.2  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1557  polysaccharide deacetylase  27.43 
 
 		 322 aa  87.4  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.367828  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2541  polysaccharide deacetylase  25.52 
 
 		 318 aa  87  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0393046  normal  0.0973746 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1640  polysaccharide deacetylase  24.65 
 
 		 337 aa  85.1  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  27.34 
 
 		 672 aa  84  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3984  polysaccharide deacetylase  22.85 
 
 		 322 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3306  polysaccharide deacetylase  25.55 
 
 		 333 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.582105 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1729  polysaccharide deacetylase  24.52 
 
 		 316 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2336  polysaccharide deacetylase  22.67 
 
 		 339 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1635  polysaccharide deacetylase  26.92 
 
 		 350 aa  79.3  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2609  polysaccharide deacetylase  23.74 
 
 		 408 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.644601  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1500  polysaccharide deacetylase family protein  28.27 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.89834  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5301  polysaccharide deacetylase  22.83 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05320  Polysaccharide deacetylase  24.54 
 
 		 351 aa  77  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.354337  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0187  hypothetical protein  23.84 
 
 		 314 aa  76.3  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5370  polysaccharide deacetylase  22.37 
 
 		 351 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0306  polysaccharide deacetylase  24.37 
 
 		 353 aa  72.8  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.957569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2028  polysaccharide deacetylase  24.1 
 
 		 318 aa  72  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.30621  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4976  polysaccharide deacetylase  24.41 
 
 		 368 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2015  polysaccharide deacetylase  23.36 
 
 		 333 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1958  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  21.51 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.15292  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2459  polysaccharide deacetylase  37.14 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0185568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1604  polysaccharide deacetylase  22.5 
 
 		 350 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.200059 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0883  polysaccharide deacetylase  23.88 
 
 		 352 aa  69.7  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.272059  normal  0.749815 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1885  polysaccharide deacetylase  22.54 
 
 		 350 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.227771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2642  polysaccharide deacetylase  24.4 
 
 		 397 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.149181  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5271  polysaccharide deacetylase  20.76 
 
 		 352 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5866  polysaccharide deacetylase  21.76 
 
 		 350 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0148  polysaccharide deacetylase  23.88 
 
 		 342 aa  67.4  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.577134 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1265  polysaccharide deacetylase  22.26 
 
 		 324 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.493777  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  37.37 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  37.37 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0752  putative polysaccharide deacetylase  20.64 
 
 		 352 aa  65.1  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2728  polysaccharide deacetylase  23.79 
 
 		 400 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2823  polysaccharide deacetylase  23.79 
 
 		 400 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.42622  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0140  polysaccharide deacetylase  19.56 
 
 		 347 aa  63.5  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  38.67 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0250  polysaccharide deacetylase  21.4 
 
 		 349 aa  63.2  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28438  normal  0.993392 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2932  polysaccharide deacetylase  23.48 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0771  polysaccharide deacetylase  21.5 
 
 		 352 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0476  NhaD  24.1 
 
 		 256 aa  62  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.336062  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1402  xylanase/chitin deacetylase  25.68 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0167631  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5046  polysaccharide deacetylase  20.45 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.447167  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2761  polysaccharide deacetylase  23.67 
 
 		 398 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0205212  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3105  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 336 aa  59.7  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000266277  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0603  polysaccharide deacetylase  41.94 
 
 		 371 aa  59.7  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0156  hypothetical protein  21.05 
 
 		 338 aa  59.7  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4585  polysaccharide deacetylase  20.07 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.701791 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0630  polysaccharide deacetylase  22.17 
 
 		 352 aa  58.5  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3076  polysaccharide deacetylase  37.31 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0376  hypothetical protein  31.58 
 
 		 119 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.565558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  36.99 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0020  polysaccharide deacetylase  24.8 
 
 		 381 aa  58.2  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2853  polysaccharide deacetylase  21.48 
 
 		 398 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2994  polysaccharide deacetylase  22.05 
 
 		 362 aa  58.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649589 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0156  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4928  polysaccharide deacetylase  21.4 
 
 		 368 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  22.31 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2945  polysaccharide deacetylase  22.22 
 
 		 398 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0635  polysaccharide deacetylase  22.43 
 
 		 345 aa  57  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0248  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 352 aa  56.6  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  35.9 
 
 		 510 aa  57  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0653  regulatory protein, LacI  32.11 
 
 		 363 aa  56.2  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.773413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1802  polysaccharide deacetylase  24.89 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0595  polysaccharide deacetylase  22.5 
 
 		 345 aa  55.8  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0751  polysaccharide deacetylase  30.1 
 
 		 673 aa  55.5  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.442489  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0287  putative hemin storage signal peptide protein  31.63 
 
 		 724 aa  55.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.111967  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  24.67 
 
 		 348 aa  54.7  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1658  polysaccharide deacetylase family protein  22.22 
 
 		 366 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0732576  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0501  polysaccharide deacetylase  21.83 
 
 		 352 aa  54.3  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.885129 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2023  polysaccharide deacetylase  21.77 
 
 		 275 aa  54.3  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.385946 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0111  polysaccharide deacetylase family protein  23.94 
 
 		 273 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.565524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  27.13 
 
 		 274 aa  53.5  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2717  polysaccharide deacetylase  27.45 
 
 		 628 aa  53.1  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0145  polysaccharide deacetylase  27.48 
 
 		 348 aa  52.8  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  27.15 
 
 		 264 aa  52.8  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3765  polysaccharide deacetylase  32.26 
 
 		 712 aa  52.8  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21811  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4976  deacetylase  37.5 
 
 		 373 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.765353  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4122  polysaccharide deacetylase  27.48 
 
 		 348 aa  52.8  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4842  polysaccharide deacetylase  32.26 
 
 		 712 aa  52.8  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4190  polysaccharide deacetylase  27.48 
 
 		 348 aa  52.8  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4321  polysaccharide deacetylase  27.48 
 
 		 348 aa  52.8  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4358  polysaccharide deacetylase  26.73 
 
 		 265 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2620  polysaccharide deacetylase  25.23 
 
 		 672 aa  52  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1265  outer membrane N-deacetylase  25.23 
 
 		 672 aa  52  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.798831 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2837  polysaccharide deacetylase  21.91 
 
 		 285 aa  52.4  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28577  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>