143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0140 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0140  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 347 aa  696    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1279  polysaccharide deacetylase  56.76 
 
 		 348 aa  386  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26869  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0595  polysaccharide deacetylase  44.93 
 
 		 345 aa  276  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0635  polysaccharide deacetylase  46.18 
 
 		 345 aa  273  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0507  polysaccharide deacetylase  45.4 
 
 		 352 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0501  polysaccharide deacetylase  38.89 
 
 		 352 aa  231  2e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.885129 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1027  hypothetical protein  37.85 
 
 		 349 aa  221  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.504748  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0630  polysaccharide deacetylase  37.17 
 
 		 352 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0752  putative polysaccharide deacetylase  37.65 
 
 		 352 aa  208  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4928  polysaccharide deacetylase  38.25 
 
 		 368 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5271  polysaccharide deacetylase  37.72 
 
 		 352 aa  205  8e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5370  polysaccharide deacetylase  39.64 
 
 		 351 aa  205  9e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1885  polysaccharide deacetylase  38.39 
 
 		 350 aa  204  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.227771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1635  polysaccharide deacetylase  37.01 
 
 		 350 aa  203  4e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0306  polysaccharide deacetylase  36.42 
 
 		 353 aa  202  9e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.957569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0883  polysaccharide deacetylase  37.28 
 
 		 352 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.272059  normal  0.749815 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1604  polysaccharide deacetylase  38.39 
 
 		 350 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.200059 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0771  polysaccharide deacetylase  35.5 
 
 		 352 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2994  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 		 362 aa  189  7e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649589 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5866  polysaccharide deacetylase  38.74 
 
 		 350 aa  168  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0250  polysaccharide deacetylase  32.47 
 
 		 349 aa  134  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28438  normal  0.993392 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3093  polysaccharide deacetylase  27.81 
 
 		 350 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110896  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2663  polysaccharide deacetylase  28.13 
 
 		 348 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.222943 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4603  putative polysaccharide deacetylase  27.24 
 
 		 353 aa  126  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2699  polysaccharide deacetylase  28.75 
 
 		 348 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.222109 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4976  polysaccharide deacetylase  28.33 
 
 		 368 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6088  polysaccharide deacetylase  28.66 
 
 		 349 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217095  hitchhiker  0.00305245 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0412  polysaccharide deacetylase  32.58 
 
 		 324 aa  92.8  9e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1640  polysaccharide deacetylase  29.31 
 
 		 337 aa  87.4  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1729  polysaccharide deacetylase  29.03 
 
 		 316 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2336  polysaccharide deacetylase  29.11 
 
 		 339 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05320  Polysaccharide deacetylase  28.32 
 
 		 351 aa  81.6  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.354337  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1065  polysaccharide deacetylase  30.84 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.012185  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0678  polysaccharide deacetylase  30.51 
 
 		 322 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2028  polysaccharide deacetylase  25.78 
 
 		 318 aa  76.3  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.30621  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0677  polysaccharide deacetylase  28.14 
 
 		 337 aa  76.3  0.0000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2853  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 398 aa  73.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2541  polysaccharide deacetylase  29.69 
 
 		 318 aa  73.6  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0393046  normal  0.0973746 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2459  polysaccharide deacetylase  24.64 
 
 		 318 aa  73.6  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0185568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0110  polysaccharide deacetylase  30.23 
 
 		 316 aa  72.8  0.000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  23.03 
 
 		 282 aa  72  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2015  polysaccharide deacetylase  26.22 
 
 		 333 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2945  polysaccharide deacetylase  29.66 
 
 		 398 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3306  polysaccharide deacetylase  25.17 
 
 		 333 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.582105 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1557  polysaccharide deacetylase  28.02 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.367828  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1958  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  27.73 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.15292  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2823  polysaccharide deacetylase  31.91 
 
 		 400 aa  69.3  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.42622  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2761  polysaccharide deacetylase  29.08 
 
 		 398 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0205212  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0854  polysaccharide deacetylase  28.04 
 
 		 294 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2728  polysaccharide deacetylase  31.91 
 
 		 400 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  28.63 
 
 		 672 aa  67.8  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1121  polysaccharide deacetylase  32.78 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2642  polysaccharide deacetylase  29.39 
 
 		 397 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.149181  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2375  polysaccharide deacetylase  26.09 
 
 		 344 aa  65.9  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2932  polysaccharide deacetylase  31.5 
 
 		 309 aa  65.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44477  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0187  hypothetical protein  29.25 
 
 		 314 aa  65.1  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6486  polysaccharide deacetylase  30.71 
 
 		 288 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2013  polysaccharide deacetylase  23.29 
 
 		 386 aa  64.3  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  24.89 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2127  polysaccharide deacetylase  41.84 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  35.9 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5022  polysaccharide deacetylase family protein  19.56 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0134312  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2465  polysaccharide deacetylase  26.89 
 
 		 348 aa  63.2  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1967  polysaccharide deacetylase  24.71 
 
 		 339 aa  60.5  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0301  polysaccharide deacetylase  26.39 
 
 		 353 aa  58.2  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351436  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5826  polysaccharide deacetylase  22.08 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0739761  normal  0.758977 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  30.43 
 
 		 590 aa  54.3  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0229  polysaccharide deacetylase family protein  40.51 
 
 		 238 aa  53.1  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00859248  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0405  polysaccharide deacetylase  40.51 
 
 		 238 aa  53.1  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0189593 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  26.67 
 
 		 274 aa  52.8  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0240  polysaccharide deacetylase  27.45 
 
 		 330 aa  52.8  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 279 aa  52.4  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  33.66 
 
 		 261 aa  52.4  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0455  polysaccharide deacetylase  19.27 
 
 		 339 aa  51.6  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0133488 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  31.67 
 
 		 270 aa  50.8  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4674  polysaccharide deacetylase  37.08 
 
 		 234 aa  51.2  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  31.4 
 
 		 645 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0156  hypothetical protein  21.1 
 
 		 338 aa  50.1  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  29.47 
 
 		 254 aa  50.1  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  32.47 
 
 		 319 aa  49.7  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2609  polysaccharide deacetylase  27.54 
 
 		 408 aa  49.3  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.644601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  26.92 
 
 		 224 aa  48.9  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1847  polysaccharide deacetylase  32.2 
 
 		 313 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4235  polysaccharide deacetylase  25.58 
 
 		 349 aa  48.1  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0414  polysaccharide deacetylase  37.5 
 
 		 233 aa  48.1  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0309  polysaccharide deacetylase  29 
 
 		 361 aa  48.1  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0156  polysaccharide deacetylase  26.8 
 
 		 276 aa  47.8  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2752  polysaccharide deacetylase  34.62 
 
 		 251 aa  47.8  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  31.58 
 
 		 233 aa  47.4  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1638  polysaccharide deacetylase  28.93 
 
 		 238 aa  47.4  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3074  polysaccharide deacetylase  24.2 
 
 		 321 aa  47  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  31.58 
 
 		 233 aa  47  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2381  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 336 aa  46.6  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.437029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0751  polysaccharide deacetylase  21.56 
 
 		 673 aa  46.2  0.0008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.442489  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0404  polysaccharide deacetylase-like protein  30 
 
 		 360 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.606713  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0360  polysaccharide deacetylase-like protein  30 
 
 		 360 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1500  polysaccharide deacetylase family protein  23.66 
 
 		 304 aa  45.8  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.89834  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5301  polysaccharide deacetylase  23.1 
 
 		 272 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0440  polysaccharide deacetylase  32.32 
 
 		 283 aa  45.8  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522067  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3791  polysaccharide deacetylase  30.28 
 
 		 354 aa  45.8  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000112343  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>