135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2994 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2994  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 362 aa  724    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649589 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0501  polysaccharide deacetylase  42.94 
 
 		 352 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.885129 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0752  putative polysaccharide deacetylase  42.65 
 
 		 352 aa  261  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1885  polysaccharide deacetylase  44.64 
 
 		 350 aa  259  4e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.227771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0630  polysaccharide deacetylase  42.42 
 
 		 352 aa  258  8e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5271  polysaccharide deacetylase  43.69 
 
 		 352 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0771  polysaccharide deacetylase  43.2 
 
 		 352 aa  255  7e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1604  polysaccharide deacetylase  44.05 
 
 		 350 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.200059 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0883  polysaccharide deacetylase  42.02 
 
 		 352 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.272059  normal  0.749815 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4928  polysaccharide deacetylase  42.42 
 
 		 368 aa  249  7e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1635  polysaccharide deacetylase  43.84 
 
 		 350 aa  248  9e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0306  polysaccharide deacetylase  42.26 
 
 		 353 aa  246  4e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.957569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5370  polysaccharide deacetylase  40.95 
 
 		 351 aa  240  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5866  polysaccharide deacetylase  45.57 
 
 		 350 aa  231  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0507  polysaccharide deacetylase  40.51 
 
 		 352 aa  216  4e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0635  polysaccharide deacetylase  38.91 
 
 		 345 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4603  putative polysaccharide deacetylase  36.45 
 
 		 353 aa  202  6e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3093  polysaccharide deacetylase  36.14 
 
 		 350 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110896  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0595  polysaccharide deacetylase  38.26 
 
 		 345 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0140  polysaccharide deacetylase  36.72 
 
 		 347 aa  196  6e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1027  hypothetical protein  35.86 
 
 		 349 aa  194  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.504748  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1279  polysaccharide deacetylase  33.43 
 
 		 348 aa  193  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26869  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2663  polysaccharide deacetylase  37.35 
 
 		 348 aa  193  5e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.222943 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2699  polysaccharide deacetylase  38.86 
 
 		 348 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.222109 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0250  polysaccharide deacetylase  39.94 
 
 		 349 aa  187  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28438  normal  0.993392 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6088  polysaccharide deacetylase  35.26 
 
 		 349 aa  161  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217095  hitchhiker  0.00305245 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4976  polysaccharide deacetylase  32.36 
 
 		 368 aa  150  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2336  polysaccharide deacetylase  28.79 
 
 		 339 aa  98.6  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2013  polysaccharide deacetylase  25.81 
 
 		 386 aa  95.1  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  29.9 
 
 		 672 aa  94  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0301  polysaccharide deacetylase  28.12 
 
 		 353 aa  87.4  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351436  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05320  Polysaccharide deacetylase  26.89 
 
 		 351 aa  85.5  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.354337  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1967  polysaccharide deacetylase  28.26 
 
 		 339 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0412  polysaccharide deacetylase  27.1 
 
 		 324 aa  84  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2459  polysaccharide deacetylase  26.95 
 
 		 318 aa  84  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0185568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1729  polysaccharide deacetylase  27.36 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0677  polysaccharide deacetylase  26.36 
 
 		 337 aa  83.6  0.000000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1958  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  29.03 
 
 		 294 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.15292  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2028  polysaccharide deacetylase  26.01 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.30621  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2015  polysaccharide deacetylase  26.32 
 
 		 333 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2541  polysaccharide deacetylase  32.33 
 
 		 318 aa  79  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0393046  normal  0.0973746 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0156  hypothetical protein  23.38 
 
 		 338 aa  75.5  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0678  polysaccharide deacetylase  25.63 
 
 		 322 aa  71.2  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0110  polysaccharide deacetylase  28.25 
 
 		 316 aa  72  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  35 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1557  polysaccharide deacetylase  27.08 
 
 		 322 aa  70.5  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.367828  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2642  polysaccharide deacetylase  32.13 
 
 		 397 aa  69.7  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.149181  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0455  polysaccharide deacetylase  21.3 
 
 		 339 aa  69.7  0.00000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0133488 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0375  polysaccharide deacetylase  30.2 
 
 		 323 aa  69.3  0.00000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0881899  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3306  polysaccharide deacetylase  29.06 
 
 		 333 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.582105 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  24.12 
 
 		 278 aa  68.6  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2945  polysaccharide deacetylase  30.03 
 
 		 398 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2853  polysaccharide deacetylase  30.38 
 
 		 398 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2465  polysaccharide deacetylase  24.26 
 
 		 348 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  23.33 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2761  polysaccharide deacetylase  32.31 
 
 		 398 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0205212  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  24.81 
 
 		 274 aa  65.5  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3074  polysaccharide deacetylase  27.42 
 
 		 321 aa  65.5  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2375  polysaccharide deacetylase  24.61 
 
 		 344 aa  65.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2823  polysaccharide deacetylase  31.62 
 
 		 400 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.42622  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  26.77 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2728  polysaccharide deacetylase  31.62 
 
 		 400 aa  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1971  putative xylanase/chitin deacetylase  26.77 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0644502  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0229  polysaccharide deacetylase family protein  27.94 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00859248  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0405  polysaccharide deacetylase  27.94 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0189593 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0811  Shf protein  22.71 
 
 		 284 aa  60.5  0.00000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0722  polysaccharide deacetylase  22.71 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1640  polysaccharide deacetylase  22.54 
 
 		 337 aa  58.9  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1121  polysaccharide deacetylase  25.81 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0854  polysaccharide deacetylase  24.8 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5022  polysaccharide deacetylase family protein  22.05 
 
 		 327 aa  57.8  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0134312  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6486  polysaccharide deacetylase  25.81 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1065  polysaccharide deacetylase  25.21 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.012185  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2084  polysaccharide deacetylase  38.71 
 
 		 249 aa  55.8  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2609  polysaccharide deacetylase  31.33 
 
 		 408 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.644601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  20.68 
 
 		 234 aa  55.8  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1976  polysaccharide deacetylase  30.07 
 
 		 257 aa  54.7  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1782  polysaccharide deacetylase  27.36 
 
 		 305 aa  54.3  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4730  polysaccharide deacetylase  34.31 
 
 		 548 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  31.5 
 
 		 590 aa  54.3  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2127  polysaccharide deacetylase  34.4 
 
 		 256 aa  54.3  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  27.87 
 
 		 224 aa  53.9  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5025  polysaccharide deacetylase  34.31 
 
 		 548 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.794076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  31.58 
 
 		 255 aa  53.5  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5826  polysaccharide deacetylase  23.6 
 
 		 354 aa  53.1  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0739761  normal  0.758977 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2279  polysaccharide deacetylase  31.87 
 
 		 318 aa  53.1  0.000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  28.85 
 
 		 261 aa  53.1  0.000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  24.91 
 
 		 1015 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4642  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 		 457 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.921462  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  33.64 
 
 		 321 aa  52.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1635  polysaccharide deacetylase  21.63 
 
 		 328 aa  52.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.280055  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  33.65 
 
 		 233 aa  51.6  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0156  polysaccharide deacetylase  23.55 
 
 		 276 aa  51.6  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  33.67 
 
 		 274 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  33.65 
 
 		 233 aa  51.6  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2837  polysaccharide deacetylase  23.74 
 
 		 285 aa  51.6  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1736  polysaccharide deacetylase  23.62 
 
 		 249 aa  50.4  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.70256 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4456  polysaccharide deacetylase  26.7 
 
 		 253 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1265  polysaccharide deacetylase  22.08 
 
 		 324 aa  50.1  0.00007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.493777  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2104  polysaccharide deacetylase  22.67 
 
 		 276 aa  49.7  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>