190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0677 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0677  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 337 aa  702    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5022  polysaccharide deacetylase family protein  26.8 
 
 		 327 aa  150  4e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0134312  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5826  polysaccharide deacetylase  29.25 
 
 		 354 aa  132  6e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0739761  normal  0.758977 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2013  polysaccharide deacetylase  29.49 
 
 		 386 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3074  polysaccharide deacetylase  27.57 
 
 		 321 aa  120  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1967  polysaccharide deacetylase  31.35 
 
 		 339 aa  116  5e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1640  polysaccharide deacetylase  30.69 
 
 		 337 aa  114  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0301  polysaccharide deacetylase  29.2 
 
 		 353 aa  110  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351436  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2642  polysaccharide deacetylase  28.43 
 
 		 397 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.149181  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2541  polysaccharide deacetylase  29.17 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0393046  normal  0.0973746 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2853  polysaccharide deacetylase  27.61 
 
 		 398 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2823  polysaccharide deacetylase  29.08 
 
 		 400 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.42622  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2945  polysaccharide deacetylase  27.61 
 
 		 398 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2336  polysaccharide deacetylase  26.57 
 
 		 339 aa  102  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2761  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 		 398 aa  102  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0205212  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2728  polysaccharide deacetylase  29.08 
 
 		 400 aa  102  8e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0110  polysaccharide deacetylase  30.52 
 
 		 316 aa  100  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1065  polysaccharide deacetylase  28.64 
 
 		 305 aa  100  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.012185  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2609  polysaccharide deacetylase  26.88 
 
 		 408 aa  96.7  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.644601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0678  polysaccharide deacetylase  29.07 
 
 		 322 aa  95.5  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2459  polysaccharide deacetylase  26.78 
 
 		 318 aa  94.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0185568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0306  polysaccharide deacetylase  27.69 
 
 		 353 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.957569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3306  polysaccharide deacetylase  27.83 
 
 		 333 aa  94  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.582105 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1635  polysaccharide deacetylase  29.29 
 
 		 350 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5370  polysaccharide deacetylase  27.6 
 
 		 351 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1885  polysaccharide deacetylase  29.57 
 
 		 350 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.227771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3250  polysaccharide deacetylase family protein  27.74 
 
 		 317 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1729  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 		 316 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2028  polysaccharide deacetylase  26.17 
 
 		 318 aa  87.8  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.30621  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1604  polysaccharide deacetylase  28.7 
 
 		 350 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.200059 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2375  polysaccharide deacetylase  24.76 
 
 		 344 aa  87  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  26.57 
 
 		 672 aa  85.5  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2465  polysaccharide deacetylase  25.37 
 
 		 348 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3093  polysaccharide deacetylase  27.63 
 
 		 350 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110896  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0455  polysaccharide deacetylase  27.31 
 
 		 339 aa  82  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0133488 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2994  polysaccharide deacetylase  26.64 
 
 		 362 aa  81.6  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649589 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2015  polysaccharide deacetylase  26.13 
 
 		 333 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4976  polysaccharide deacetylase  25.6 
 
 		 368 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0412  polysaccharide deacetylase  25.26 
 
 		 324 aa  78.2  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1557  polysaccharide deacetylase  26.75 
 
 		 322 aa  77.8  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.367828  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0187  hypothetical protein  27.14 
 
 		 314 aa  77  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5866  polysaccharide deacetylase  27.57 
 
 		 350 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0140  polysaccharide deacetylase  28.14 
 
 		 347 aa  76.3  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0156  hypothetical protein  24.76 
 
 		 338 aa  75.9  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1847  polysaccharide deacetylase  30.04 
 
 		 313 aa  75.1  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1265  polysaccharide deacetylase  24.59 
 
 		 324 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.493777  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1500  polysaccharide deacetylase family protein  23.47 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.89834  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2699  polysaccharide deacetylase  26.29 
 
 		 348 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.222109 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6088  polysaccharide deacetylase  25.35 
 
 		 349 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217095  hitchhiker  0.00305245 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0771  polysaccharide deacetylase  24.34 
 
 		 352 aa  73.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0507  polysaccharide deacetylase  26.24 
 
 		 352 aa  73.2  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5271  polysaccharide deacetylase  23.31 
 
 		 352 aa  72.4  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05320  Polysaccharide deacetylase  24.26 
 
 		 351 aa  72.4  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.354337  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2663  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 348 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.222943 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1279  polysaccharide deacetylase  23.65 
 
 		 348 aa  72  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26869  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0250  polysaccharide deacetylase  27.47 
 
 		 349 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28438  normal  0.993392 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0630  polysaccharide deacetylase  24.42 
 
 		 352 aa  71.2  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0752  putative polysaccharide deacetylase  25.3 
 
 		 352 aa  70.9  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3984  polysaccharide deacetylase  26.02 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0883  polysaccharide deacetylase  23.95 
 
 		 352 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.272059  normal  0.749815 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4928  polysaccharide deacetylase  23.13 
 
 		 368 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0595  polysaccharide deacetylase  24.31 
 
 		 345 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0501  polysaccharide deacetylase  22.47 
 
 		 352 aa  63.9  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.885129 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  33.85 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1958  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  22.94 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.15292  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  29.89 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0635  polysaccharide deacetylase  24.11 
 
 		 345 aa  59.7  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0148  polysaccharide deacetylase  24.56 
 
 		 342 aa  58.2  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.577134 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1178  polysaccharide deacetylase  31.45 
 
 		 370 aa  58.5  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0603  polysaccharide deacetylase  35.71 
 
 		 371 aa  57.4  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1027  hypothetical protein  21.84 
 
 		 349 aa  57  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.504748  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5301  polysaccharide deacetylase  28.9 
 
 		 272 aa  57  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0616  polysaccharide deacetylase  35.16 
 
 		 373 aa  56.2  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04327  biofilm PGA synthesis lipoprotein PgaB  31.37 
 
 		 624 aa  55.5  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.215859  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  32.94 
 
 		 598 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2932  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 309 aa  54.3  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2717  polysaccharide deacetylase  31.37 
 
 		 628 aa  54.3  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3105  polysaccharide deacetylase  44.64 
 
 		 336 aa  53.9  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000266277  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1658  polysaccharide deacetylase family protein  49.02 
 
 		 366 aa  53.5  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0732576  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  28.93 
 
 		 255 aa  53.5  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2837  polysaccharide deacetylase  24.19 
 
 		 285 aa  53.1  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  28.36 
 
 		 279 aa  53.1  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0880  polysaccharide deacetylase  30.43 
 
 		 271 aa  52.8  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0260  polysaccharide deacetylase family protein  24.64 
 
 		 273 aa  52.8  0.000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1226  polysaccharide deacetylase  29.03 
 
 		 337 aa  52  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0846  polysaccharide deacetylase  31.19 
 
 		 280 aa  52.4  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  32.18 
 
 		 510 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4603  putative polysaccharide deacetylase  22.59 
 
 		 353 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0046  polysaccharide deacetylase family protein  23.91 
 
 		 273 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0060  polysaccharide deacetylase family protein  23.91 
 
 		 273 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0475  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing] (glutamineamidotransferase; GMP synthetase)  33.66 
 
 		 265 aa  52  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4585  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 276 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.701791 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5046  polysaccharide deacetylase  29.73 
 
 		 276 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.447167  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1121  polysaccharide deacetylase family protein  32.17 
 
 		 295 aa  50.8  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0091  xylanase/chitin deacetylase  27.87 
 
 		 318 aa  51.2  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1233  yggt family protein  22.07 
 
 		 266 aa  50.8  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4855  polysaccharide deacetylase family protein  23.91 
 
 		 273 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>