137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0250 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0250  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 349 aa  694    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28438  normal  0.993392 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4976  polysaccharide deacetylase  42.52 
 
 		 368 aa  206  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1635  polysaccharide deacetylase  40.84 
 
 		 350 aa  192  7e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0630  polysaccharide deacetylase  41.25 
 
 		 352 aa  192  8e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0501  polysaccharide deacetylase  40.13 
 
 		 352 aa  191  1e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.885129 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5271  polysaccharide deacetylase  41.32 
 
 		 352 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5370  polysaccharide deacetylase  41.03 
 
 		 351 aa  189  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0883  polysaccharide deacetylase  40.51 
 
 		 352 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.272059  normal  0.749815 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0752  putative polysaccharide deacetylase  37.54 
 
 		 352 aa  187  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2994  polysaccharide deacetylase  40.34 
 
 		 362 aa  184  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649589 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4928  polysaccharide deacetylase  40 
 
 		 368 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1885  polysaccharide deacetylase  38.26 
 
 		 350 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.227771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1604  polysaccharide deacetylase  38.26 
 
 		 350 aa  179  9e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.200059 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0771  polysaccharide deacetylase  39.56 
 
 		 352 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0595  polysaccharide deacetylase  39.6 
 
 		 345 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0306  polysaccharide deacetylase  37.76 
 
 		 353 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.957569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5866  polysaccharide deacetylase  40.06 
 
 		 350 aa  161  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0635  polysaccharide deacetylase  40.47 
 
 		 345 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0507  polysaccharide deacetylase  37.97 
 
 		 352 aa  143  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2699  polysaccharide deacetylase  37.66 
 
 		 348 aa  143  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.222109 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6088  polysaccharide deacetylase  34.48 
 
 		 349 aa  142  7e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217095  hitchhiker  0.00305245 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1027  hypothetical protein  34.94 
 
 		 349 aa  139  7e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.504748  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4603  putative polysaccharide deacetylase  34.78 
 
 		 353 aa  139  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0140  polysaccharide deacetylase  32.47 
 
 		 347 aa  134  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3093  polysaccharide deacetylase  31.89 
 
 		 350 aa  126  6e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110896  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2663  polysaccharide deacetylase  33.45 
 
 		 348 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.222943 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1279  polysaccharide deacetylase  29.94 
 
 		 348 aa  110  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26869  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2336  polysaccharide deacetylase  29.39 
 
 		 339 aa  96.3  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2013  polysaccharide deacetylase  24.53 
 
 		 386 aa  94  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1958  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  34.19 
 
 		 294 aa  91.3  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.15292  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  31.96 
 
 		 672 aa  90.9  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2541  polysaccharide deacetylase  33.91 
 
 		 318 aa  90.9  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0393046  normal  0.0973746 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0301  polysaccharide deacetylase  28.16 
 
 		 353 aa  87.8  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351436  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1729  polysaccharide deacetylase  29.01 
 
 		 316 aa  85.9  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1967  polysaccharide deacetylase  32.33 
 
 		 339 aa  83.6  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  26.76 
 
 		 278 aa  82.8  0.000000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0678  polysaccharide deacetylase  30.4 
 
 		 322 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1557  polysaccharide deacetylase  30.67 
 
 		 322 aa  79  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.367828  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2642  polysaccharide deacetylase  31.31 
 
 		 397 aa  77  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.149181  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  24.11 
 
 		 590 aa  76.6  0.0000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0412  polysaccharide deacetylase  29.65 
 
 		 324 aa  75.5  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2459  polysaccharide deacetylase  25.48 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0185568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1640  polysaccharide deacetylase  25.66 
 
 		 337 aa  73.6  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2945  polysaccharide deacetylase  31.8 
 
 		 398 aa  73.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0405  polysaccharide deacetylase  25.43 
 
 		 238 aa  72  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0189593 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0229  polysaccharide deacetylase family protein  25.43 
 
 		 238 aa  72  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00859248  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0677  polysaccharide deacetylase  27.47 
 
 		 337 aa  72.4  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05320  Polysaccharide deacetylase  26.69 
 
 		 351 aa  72  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.354337  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2853  polysaccharide deacetylase  31.48 
 
 		 398 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0110  polysaccharide deacetylase  32.27 
 
 		 316 aa  70.9  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2015  polysaccharide deacetylase  25.82 
 
 		 333 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2823  polysaccharide deacetylase  34.75 
 
 		 400 aa  69.7  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.42622  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2728  polysaccharide deacetylase  34.75 
 
 		 400 aa  69.7  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  26.47 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  22.96 
 
 		 282 aa  69.3  0.00000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2028  polysaccharide deacetylase  24.37 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.30621  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1065  polysaccharide deacetylase  28.91 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.012185  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2761  polysaccharide deacetylase  31.15 
 
 		 398 aa  66.6  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0205212  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2752  polysaccharide deacetylase  22.59 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  21.46 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  23.27 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1121  polysaccharide deacetylase  26.89 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5826  polysaccharide deacetylase  25.63 
 
 		 354 aa  63.5  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0739761  normal  0.758977 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5022  polysaccharide deacetylase family protein  21.4 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0134312  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1976  polysaccharide deacetylase  45.71 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2609  polysaccharide deacetylase  34.17 
 
 		 408 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.644601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3306  polysaccharide deacetylase  27.87 
 
 		 333 aa  62  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.582105 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6486  polysaccharide deacetylase  26.05 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  40 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1971  putative xylanase/chitin deacetylase  37.04 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0644502  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  37.04 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0455  polysaccharide deacetylase  21.73 
 
 		 339 aa  58.5  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0133488 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0854  polysaccharide deacetylase  26.28 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1736  polysaccharide deacetylase  39.73 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.70256 
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  32.63 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  32.63 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  32.94 
 
 		 645 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0414  polysaccharide deacetylase  22.69 
 
 		 233 aa  55.1  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  18.64 
 
 		 224 aa  54.7  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0187  hypothetical protein  26.95 
 
 		 314 aa  54.3  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5046  polysaccharide deacetylase  28.73 
 
 		 276 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.447167  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0020  polysaccharide deacetylase  29.2 
 
 		 381 aa  53.5  0.000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4585  polysaccharide deacetylase  28.36 
 
 		 276 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.701791 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2127  polysaccharide deacetylase  36.7 
 
 		 256 aa  52.8  0.000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1635  polysaccharide deacetylase  24.45 
 
 		 328 aa  52.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.280055  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4358  polysaccharide deacetylase  27.24 
 
 		 265 aa  52  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3074  polysaccharide deacetylase  23.29 
 
 		 321 aa  52  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  32.32 
 
 		 319 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3089  polysaccharide deacetylase  34.09 
 
 		 239 aa  50.4  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5301  polysaccharide deacetylase  25.5 
 
 		 272 aa  50.8  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1932  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 244 aa  50.8  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.656935  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  28.04 
 
 		 254 aa  50.4  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0225  polysaccharide deacetylase family protein  29.17 
 
 		 357 aa  50.1  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  37.89 
 
 		 1015 aa  50.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2084  polysaccharide deacetylase  35.14 
 
 		 249 aa  49.7  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0248  polysaccharide deacetylase  29.59 
 
 		 352 aa  49.7  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4674  polysaccharide deacetylase  32.52 
 
 		 234 aa  50.1  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0895  polysaccharide deacetylase  27.21 
 
 		 615 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0313662  normal  0.429695 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0869  polysaccharide deacetylase  27.21 
 
 		 615 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  35.85 
 
 		 289 aa  48.9  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>